Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G398400.1
Synonym Sb02g041310, GATL4
Functional annotation glycosyl transferase 8 domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5X424
Pfam PF01501
Panther DB PTHR13778 PTHR13778:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016757; transferase activity, transferring glycosyl groups


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G06260 : galacturonosyltransferase-like 4
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g45260.1 : glycosyl transferase 8 domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a049392 , Zm00025a002567 , Zm00025a048973 , Zm00025a052611 , Zm00025a056572 , Zm00025a007479 , Zm00025a010455
Brachypodium KQK21598 , KQK02001 , KQJ83757
Barley HORVU4Hr1G003590.1 , HORVU4Hr1G003590.2 , HORVU4Hr1G054790.3 , HORVU4Hr1G054790.2 , HORVU4Hr1G054790.1 , HORVU4Hr1G042240.2 , HORVU4Hr1G042240.1 , HORVU6Hr1G076820.3 , HORVU6Hr1G076820.2 , HORVU6Hr1G076820.1 , HORVU2Hr1G024740.1 , HORVU2Hr1G024740.2
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G398400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.004G163900 SNARE domain containing protein, putative, expressed K18211: synaptosomal-associated protein 25


Gene co-expression network
sample Sobic002G398400 Sobic002G398400 Sobic001G345300 Sobic001G345300 Sobic002G398400--Sobic001G345300 Sobic009G118100 Sobic009G118100 Sobic002G398400--Sobic009G118100 Sobic001G474001 Sobic001G474001 Sobic002G398400--Sobic001G474001 Sobic003G315600 Sobic003G315600 Sobic002G398400--Sobic003G315600 Sobic007G204800 Sobic007G204800 Sobic002G398400--Sobic007G204800 Sobic010G070100 Sobic010G070100 Sobic002G398400--Sobic010G070100 Sobic006G099200 Sobic006G099200 Sobic002G398400--Sobic006G099200 Sobic005G027250 Sobic005G027250 Sobic002G398400--Sobic005G027250 Sobic002G160200 Sobic002G160200 Sobic002G398400--Sobic002G160200 Sobic001G345300--Sobic002G398400 Sobic008G141300 Sobic008G141300 Sobic001G345300--Sobic008G141300 Sobic004G180200 Sobic004G180200 Sobic001G345300--Sobic004G180200 Sobic001G345300--Sobic005G027250 Sobic001G345300--Sobic007G204800 Sobic002G068701 Sobic002G068701 Sobic001G345300--Sobic002G068701 Sobic001G345300--Sobic006G099200 Sobic009G044200 Sobic009G044200 Sobic001G345300--Sobic009G044200 Sobic001G345300--Sobic002G160200 Sobic009G118100--Sobic003G315600 Sobic009G118100--Sobic001G474001 Sobic001G120800 Sobic001G120800 Sobic009G118100--Sobic001G120800 Sobic010G257900 Sobic010G257900 Sobic009G118100--Sobic010G257900 Sobic003G444700 Sobic003G444700 Sobic009G118100--Sobic003G444700 Sobic009G118100--Sobic007G204800 Sobic003G131900 Sobic003G131900 Sobic009G118100--Sobic003G131900 Sobic006G130900 Sobic006G130900 Sobic009G118100--Sobic006G130900 Sobic002G102600 Sobic002G102600 Sobic009G118100--Sobic002G102600 Sobic001G474001--Sobic009G118100 Sobic001G474001--Sobic003G315600 Sobic001G474001--Sobic007G204800 Sobic001G474001--Sobic001G120800 Sobic001G474001--Sobic010G257900 Sobic001G474001--Sobic006G130900 Sobic001G474001--Sobic006G099200 Sobic001G474001--Sobic002G160200 Sobic001G474001--Sobic002G102600 Sobic003G315600--Sobic006G130900 Sobic004G240700 Sobic004G240700 Sobic003G315600--Sobic004G240700 Sobic010G015100 Sobic010G015100 Sobic003G315600--Sobic010G015100 Sobic003G315600--Sobic001G120800 Sobic005G072850 Sobic005G072850 Sobic003G315600--Sobic005G072850 Sobic003G315600--Sobic009G118100 Sobic003G315600--Sobic010G257900 Sobic003G315600--Sobic001G474001 Sobic002G125500 Sobic002G125500 Sobic003G315600--Sobic002G125500 Sobic007G204800--Sobic002G160200 Sobic004G338900 Sobic004G338900 Sobic007G204800--Sobic004G338900 Sobic007G204800--Sobic006G099200 Sobic001G160900 Sobic001G160900 Sobic007G204800--Sobic001G160900 Sobic007G204800--Sobic001G120800 Sobic007G204800--Sobic002G102600 Sobic007G204800--Sobic010G257900 Sobic007G204800--Sobic005G027250 Sobic002G083100 Sobic002G083100 Sobic007G204800--Sobic002G083100 Sobic004G163900 Sobic004G163900 Sobic010G070100--Sobic004G163900 Sobic008G129800 Sobic008G129800 Sobic010G070100--Sobic008G129800 Sobic002G122500 Sobic002G122500 Sobic010G070100--Sobic002G122500 Sobic003G322000 Sobic003G322000 Sobic010G070100--Sobic003G322000 Sobic006G037100 Sobic006G037100 Sobic010G070100--Sobic006G037100 Sobic008G080700 Sobic008G080700 Sobic010G070100--Sobic008G080700 Sobic008G131300 Sobic008G131300 Sobic010G070100--Sobic008G131300 Sobic002G305800 Sobic002G305800 Sobic010G070100--Sobic002G305800 Sobic003G400700 Sobic003G400700 Sobic010G070100--Sobic003G400700 Sobic006G099200--Sobic005G027250 Sobic006G099200--Sobic007G204800 Sobic006G099200--Sobic004G338900 Sobic006G099200--Sobic009G044200 Sobic006G099200--Sobic001G160900 Sobic010G032200 Sobic010G032200 Sobic006G099200--Sobic010G032200 Sobic006G099200--Sobic002G160200 Sobic006G099200--Sobic002G083100 Sobic006G099200--Sobic001G120800 Sobic005G027250--Sobic006G099200 Sobic005G027250--Sobic009G044200 Sobic005G027250--Sobic004G338900 Sobic005G027250--Sobic007G204800 Sobic005G027250--Sobic002G160200 Sobic005G027250--Sobic001G160900 Sobic005G027250--Sobic002G083100 Sobic005G027250--Sobic010G032200 Sobic005G125200 Sobic005G125200 Sobic005G027250--Sobic005G125200 Sobic002G160200--Sobic002G102600 Sobic002G160200--Sobic007G204800 Sobic002G160200--Sobic004G338900 Sobic005G098100 Sobic005G098100 Sobic002G160200--Sobic005G098100 Sobic002G160200--Sobic003G400700 Sobic002G160200--Sobic001G160900 Sobic005G001200 Sobic005G001200 Sobic002G160200--Sobic005G001200 Sobic002G160200--Sobic006G037100 Sobic002G160200--Sobic008G129800
Octagon: transcription factors


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