Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G354900.4
Synonym Sb01g033930
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QMX5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a002679
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G213200 ZOS10-05 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
2 Sobic.001G075900 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
3 Sobic.003G073620 - -
4 Sobic.001G536300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@KIP1, putative, expressed -
5 Sobic.002G268200 glycosyl hydrolase family 29, putative, expressed K01206: alpha-L-fucosidase
6 Sobic.001G523500 DUF623 domain containing protein, expressed -
7 Sobic.001G084300 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
8 Sobic.002G202200 - -
9 Sobic.004G221150 - -
10 Sobic.009G242032 - -
11 Sobic.003G145200 expressed protein -
12 Sobic.005G066800 - -
13 Sobic.003G350000 pentatricopeptide, putative, expressed -
14 Sobic.001G391000 aspartic proteinase nepenthesin precursor, putative, expressed -
15 Sobic.001G298100 Not investigated(PubMedID : 23766026)@Osmolyte biosynthesis(PubMedID : 28620409)@AP2 domain containing protein, expressed -
16 Sobic.007G206550 - -
17 Sobic.010G067950 - K14292: trimethylguanosine synthase
18 Sobic.008G113400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
19 Sobic.002G367850 - -
20 Sobic.009G053201 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G354900 Sobic001G354900 Sobic001G213200 Sobic001G213200 Sobic001G354900--Sobic001G213200 Sobic001G075900 Sobic001G075900 Sobic001G354900--Sobic001G075900 Sobic003G073620 Sobic003G073620 Sobic001G354900--Sobic003G073620 Sobic001G536300 Sobic001G536300 Sobic001G354900--Sobic001G536300 Sobic002G268200 Sobic002G268200 Sobic001G354900--Sobic002G268200 Sobic001G523500 Sobic001G523500 Sobic001G354900--Sobic001G523500 Sobic001G084300 Sobic001G084300 Sobic001G354900--Sobic001G084300 Sobic002G202200 Sobic002G202200 Sobic001G354900--Sobic002G202200 Sobic004G221150 Sobic004G221150 Sobic001G354900--Sobic004G221150 Sobic001G213200--Sobic003G073620 Sobic001G213200--Sobic001G075900 Sobic001G213200--Sobic001G354900 Sobic001G213200--Sobic002G202200 Sobic001G391000 Sobic001G391000 Sobic001G213200--Sobic001G391000 Sobic009G242032 Sobic009G242032 Sobic001G213200--Sobic009G242032 Sobic005G066800 Sobic005G066800 Sobic001G213200--Sobic005G066800 Sobic001G213200--Sobic004G221150 Sobic003G265300 Sobic003G265300 Sobic001G213200--Sobic003G265300 Sobic001G075900--Sobic003G073620 Sobic001G075900--Sobic001G213200 Sobic010G078800 Sobic010G078800 Sobic001G075900--Sobic010G078800 Sobic001G075900--Sobic001G354900 Sobic001G037550 Sobic001G037550 Sobic001G075900--Sobic001G037550 Sobic001G075900--Sobic001G391000 Sobic002G367850 Sobic002G367850 Sobic001G075900--Sobic002G367850 Sobic001G075900--Sobic003G265300 Sobic001G075900--Sobic001G523500 Sobic003G073620--Sobic001G075900 Sobic003G073620--Sobic001G213200 Sobic003G073620--Sobic010G078800 Sobic003G073620--Sobic001G354900 Sobic003G073620--Sobic003G265300 Sobic003G073620--Sobic001G391000 Sobic003G073620--Sobic002G367850 Sobic003G073620--Sobic002G202200 Sobic003G073620--Sobic005G066800 Sobic003G145200 Sobic003G145200 Sobic001G536300--Sobic003G145200 Sobic005G086700 Sobic005G086700 Sobic001G536300--Sobic005G086700 Sobic001G536300--Sobic001G354900 Sobic004G258800 Sobic004G258800 Sobic001G536300--Sobic004G258800 Sobic007G174000 Sobic007G174000 Sobic001G536300--Sobic007G174000 Sobic001G536300--Sobic001G084300 Sobic004G045700 Sobic004G045700 Sobic001G536300--Sobic004G045700 Sobic010G275600 Sobic010G275600 Sobic001G536300--Sobic010G275600 Sobic004G073700 Sobic004G073700 Sobic001G536300--Sobic004G073700 Sobic002G268200--Sobic001G354900 Sobic004G287500 Sobic004G287500 Sobic002G268200--Sobic004G287500 Sobic002G268200--Sobic003G145200 Sobic007G153300 Sobic007G153300 Sobic002G268200--Sobic007G153300 Sobic002G268200--Sobic004G221150 Sobic002G268200--Sobic001G523500 Sobic002G287500 Sobic002G287500 Sobic002G268200--Sobic002G287500 Sobic006G186200 Sobic006G186200 Sobic002G268200--Sobic006G186200 Sobic006G163650 Sobic006G163650 Sobic002G268200--Sobic006G163650 Sobic007G206550 Sobic007G206550 Sobic001G523500--Sobic007G206550 Sobic006G075700 Sobic006G075700 Sobic001G523500--Sobic006G075700 Sobic001G104400 Sobic001G104400 Sobic001G523500--Sobic001G104400 Sobic007G157550 Sobic007G157550 Sobic001G523500--Sobic007G157550 Sobic001G179680 Sobic001G179680 Sobic001G523500--Sobic001G179680 Sobic004G347866 Sobic004G347866 Sobic001G523500--Sobic004G347866 Sobic001G523500--Sobic003G265300 Sobic004G089700 Sobic004G089700 Sobic001G523500--Sobic004G089700 Sobic001G494150 Sobic001G494150 Sobic001G523500--Sobic001G494150 Sobic001G084300--Sobic004G073700 Sobic002G152400 Sobic002G152400 Sobic001G084300--Sobic002G152400 Sobic003G390600 Sobic003G390600 Sobic001G084300--Sobic003G390600 Sobic002G269700 Sobic002G269700 Sobic001G084300--Sobic002G269700 Sobic001G084300--Sobic001G354900 Sobic003G281400 Sobic003G281400 Sobic001G084300--Sobic003G281400 Sobic001G084300--Sobic001G536300 Sobic006G027800 Sobic006G027800 Sobic001G084300--Sobic006G027800 Sobic008G047900 Sobic008G047900 Sobic001G084300--Sobic008G047900 Sobic002G202200--Sobic005G066800 Sobic002G202200--Sobic009G242032 Sobic007G124800 Sobic007G124800 Sobic002G202200--Sobic007G124800 Sobic001G316500 Sobic001G316500 Sobic002G202200--Sobic001G316500 Sobic001G027400 Sobic001G027400 Sobic002G202200--Sobic001G027400 Sobic002G202200--Sobic002G367850 Sobic008G007100 Sobic008G007100 Sobic002G202200--Sobic008G007100 Sobic001G174300 Sobic001G174300 Sobic002G202200--Sobic001G174300 Sobic002G187350 Sobic002G187350 Sobic002G202200--Sobic002G187350 Sobic008G134000 Sobic008G134000 Sobic004G221150--Sobic008G134000 Sobic004G108900 Sobic004G108900 Sobic004G221150--Sobic004G108900 Sobic008G144100 Sobic008G144100 Sobic004G221150--Sobic008G144100 Sobic001G399501 Sobic001G399501 Sobic004G221150--Sobic001G399501 Sobic009G223700 Sobic009G223700 Sobic004G221150--Sobic009G223700 Sobic004G221150--Sobic001G179680 Sobic004G221150--Sobic004G089700 Sobic002G256500 Sobic002G256500 Sobic004G221150--Sobic002G256500 Sobic006G169300 Sobic006G169300 Sobic004G221150--Sobic006G169300
Octagon: transcription factors


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