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Transcriptome id Sobic.001G418650.1
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UniProt A0A1Z5SA50
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NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G339900 - -
2 Sobic.009G070900 - -
3 Sobic.001G178200 - -
4 Sobic.001G378550 - -
5 Sobic.006G272450 - -
6 Sobic.001G134600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@RNA methyltransferase, TrmH family protein, putative, expressed K03437: RNA methyltransferase, TrmH family
7 Sobic.002G052500 - -
8 Sobic.009G194600 expressed protein -
9 Sobic.003G245700 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.009G010800 expressed protein -
11 Sobic.010G244600 nifU, putative, expressed -
12 Sobic.008G078600 NADP-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
13 Sobic.003G178200 tetratricopeptide repeat containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.001G419900 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@DnaK family protein, putative, expressed K03283: heat shock 70kDa protein 1/2/6/8
15 Sobic.009G116766 - -
16 Sobic.006G185400 - -
17 Sobic.001G361500 expressed protein -
18 Sobic.009G229100 expressed protein -
19 Sobic.005G022400 GATA zinc finger domain containing protein, expressed -
20 Sobic.005G189400 MBTB51 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein


Gene co-expression network
sample Sobic001G418650 Sobic001G418650 Sobic001G339900 Sobic001G339900 Sobic001G418650--Sobic001G339900 Sobic009G070900 Sobic009G070900 Sobic001G418650--Sobic009G070900 Sobic001G178200 Sobic001G178200 Sobic001G418650--Sobic001G178200 Sobic001G378550 Sobic001G378550 Sobic001G418650--Sobic001G378550 Sobic006G272450 Sobic006G272450 Sobic001G418650--Sobic006G272450 Sobic001G134600 Sobic001G134600 Sobic001G418650--Sobic001G134600 Sobic002G052500 Sobic002G052500 Sobic001G418650--Sobic002G052500 Sobic009G194600 Sobic009G194600 Sobic001G418650--Sobic009G194600 Sobic003G245700 Sobic003G245700 Sobic001G418650--Sobic003G245700 Sobic001G339900--Sobic001G378550 Sobic001G339900--Sobic006G272450 Sobic001G339900--Sobic002G052500 Sobic009G116766 Sobic009G116766 Sobic001G339900--Sobic009G116766 Sobic001G339900--Sobic003G245700 Sobic008G078600 Sobic008G078600 Sobic001G339900--Sobic008G078600 Sobic009G010800 Sobic009G010800 Sobic001G339900--Sobic009G010800 Sobic006G185400 Sobic006G185400 Sobic001G339900--Sobic006G185400 Sobic001G361500 Sobic001G361500 Sobic001G339900--Sobic001G361500 Sobic009G070900--Sobic006G272450 Sobic009G070900--Sobic001G378550 Sobic009G070900--Sobic002G052500 Sobic008G023500 Sobic008G023500 Sobic009G070900--Sobic008G023500 Sobic006G090201 Sobic006G090201 Sobic009G070900--Sobic006G090201 Sobic009G070900--Sobic003G245700 Sobic009G164200 Sobic009G164200 Sobic009G070900--Sobic009G164200 Sobic002G356700 Sobic002G356700 Sobic009G070900--Sobic002G356700 Sobic009G070900--Sobic006G185400 Sobic006G080600 Sobic006G080600 Sobic001G178200--Sobic006G080600 Sobic001G178200--Sobic002G052500 Sobic005G208500 Sobic005G208500 Sobic001G178200--Sobic005G208500 Sobic001G178200--Sobic006G272450 Sobic001G178200--Sobic001G378550 Sobic010G244600 Sobic010G244600 Sobic001G178200--Sobic010G244600 Sobic001G184900 Sobic001G184900 Sobic001G178200--Sobic001G184900 Sobic001G178200--Sobic001G339900 Sobic009G125500 Sobic009G125500 Sobic001G178200--Sobic009G125500 Sobic001G378550--Sobic006G185400 Sobic004G330500 Sobic004G330500 Sobic001G378550--Sobic004G330500 Sobic003G343100 Sobic003G343100 Sobic001G378550--Sobic003G343100 Sobic007G152200 Sobic007G152200 Sobic001G378550--Sobic007G152200 Sobic005G189400 Sobic005G189400 Sobic001G378550--Sobic005G189400 Sobic005G037500 Sobic005G037500 Sobic001G378550--Sobic005G037500 Sobic002G205201 Sobic002G205201 Sobic001G378550--Sobic002G205201 Sobic001G378550--Sobic001G361500 Sobic006G209100 Sobic006G209100 Sobic001G378550--Sobic006G209100 Sobic006G272450--Sobic009G164200 Sobic006G272450--Sobic008G023500 Sobic006G272450--Sobic006G090201 Sobic006G272450--Sobic009G010800 Sobic006G272450--Sobic009G070900 Sobic006G272450--Sobic006G185400 Sobic006G272450--Sobic003G245700 Sobic006G272450--Sobic004G330500 Sobic006G272450--Sobic005G189400 Sobic001G134600--Sobic001G378550 Sobic001G134600--Sobic002G052500 Sobic001G419900 Sobic001G419900 Sobic001G134600--Sobic001G419900 Sobic001G049000 Sobic001G049000 Sobic001G134600--Sobic001G049000 Sobic004G356600 Sobic004G356600 Sobic001G134600--Sobic004G356600 Sobic001G267266 Sobic001G267266 Sobic001G134600--Sobic001G267266 Sobic001G134600--Sobic006G090201 Sobic001G134600--Sobic003G343100 Sobic001G063900 Sobic001G063900 Sobic001G134600--Sobic001G063900 Sobic007G072901 Sobic007G072901 Sobic002G052500--Sobic007G072901 Sobic002G052500--Sobic003G245700 Sobic002G052500--Sobic003G343100 Sobic002G052500--Sobic008G023500 Sobic002G052500--Sobic006G090201 Sobic002G052500--Sobic006G185400 Sobic002G052500--Sobic009G010800 Sobic003G178200 Sobic003G178200 Sobic002G052500--Sobic003G178200 Sobic002G052500--Sobic004G330500 Sobic009G194600--Sobic003G343100 Sobic010G058650 Sobic010G058650 Sobic009G194600--Sobic010G058650 Sobic010G275550 Sobic010G275550 Sobic009G194600--Sobic010G275550 Sobic009G194600--Sobic003G245700 Sobic009G194600--Sobic006G185400 Sobic009G194600--Sobic004G330500 Sobic009G194600--Sobic007G152200 Sobic009G194600--Sobic005G189400 Sobic009G194600--Sobic008G023500 Sobic003G245700--Sobic003G178200 Sobic003G245700--Sobic005G189400 Sobic003G245700--Sobic006G185400 Sobic003G245700--Sobic004G330500 Sobic003G245700--Sobic008G023500 Sobic003G245700--Sobic006G090201 Sobic003G245700--Sobic002G205201 Sobic003G245700--Sobic007G152200 Sobic003G245700--Sobic001G361500
Octagon: transcription factors


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