Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G431900.1
Synonym Sb01g040630
Functional annotation DUF292 domain containing protein, expressed
UniProt C5WQT7
Pfam PF03398
Panther DB PTHR12161 PTHR12161:SF26
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G13340 : Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g15220.1 : DUF292 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a001671 , Zm00025a052833 , Zm00025a052832 , Zm00025a052831
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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19 Sobic.003G260500 - -
20 Sobic.007G023000 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G431900 Sobic001G431900 Sobic002G142950 Sobic002G142950 Sobic001G431900--Sobic002G142950 Sobic008G100900 Sobic008G100900 Sobic001G431900--Sobic008G100900 Sobic007G132650 Sobic007G132650 Sobic001G431900--Sobic007G132650 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic001G431900--Sobic008G115200 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic001G431900--Sobic003G335100 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic001G431900--Sobic004G133201 Sobic001G323101 Sobic001G323101 Sobic001G431900--Sobic001G323101 Sobic008G085800 Sobic008G085800 Sobic001G431900--Sobic008G085800 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic001G431900--Sobic007G004400 Sobic002G142950--Sobic008G100900 Sobic002G142950--Sobic004G133201 Sobic007G113000 Sobic007G113000 Sobic002G142950--Sobic007G113000 Sobic002G142950--Sobic001G431900 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic002G142950--Sobic004G134400 Sobic007G023000 Sobic007G023000 Sobic002G142950--Sobic007G023000 Sobic004G127766 Sobic004G127766 Sobic002G142950--Sobic004G127766 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic002G142950--Sobic010G247750 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic002G142950--Sobic004G274300 Sobic008G100900--Sobic002G142950 Sobic008G100801 Sobic008G100801 Sobic008G100900--Sobic008G100801 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic008G100900--Sobic006G111000 Sobic008G100900--Sobic004G133201 Sobic008G100900--Sobic004G127766 Sobic008G100900--Sobic008G115200 Sobic008G100900--Sobic007G113000 Sobic010G169950 Sobic010G169950 Sobic008G100900--Sobic010G169950 Sobic004G117850 Sobic004G117850 Sobic008G100900--Sobic004G117850 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic007G132650--Sobic003G260500 Sobic007G132650--Sobic004G274300 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic007G132650--Sobic003G187600 Sobic009G079600 Sobic009G079600 Sobic007G132650--Sobic009G079600 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic007G132650--Sobic006G107766 Sobic007G132650--Sobic004G134400 Sobic007G132650--Sobic001G323101 Sobic010G039150 Sobic010G039150 Sobic007G132650--Sobic010G039150 Sobic006G149900 Sobic006G149900 Sobic007G132650--Sobic006G149900 Sobic008G115200--Sobic004G133201 Sobic008G115200--Sobic007G004400 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic008G115200--Sobic010G136700 Sobic008G115200--Sobic006G107766 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic008G115200--Sobic006G176900 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic008G115200--Sobic008G119600 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic008G115200--Sobic003G394701 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic008G115200--Sobic006G223101 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic008G115200--Sobic002G074900 Sobic003G335100--Sobic007G004400 Sobic006G223601 Sobic006G223601 Sobic003G335100--Sobic006G223601 Sobic003G335100--Sobic006G223101 Sobic003G406850 Sobic003G406850 Sobic003G335100--Sobic003G406850 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic003G335100--Sobic003G112100 Sobic003G335100--Sobic002G074900 Sobic003G335100--Sobic008G115200 Sobic003G335100--Sobic006G176900 Sobic003G335100--Sobic008G119600 Sobic004G133201--Sobic004G274300 Sobic004G133201--Sobic006G107766 Sobic004G133201--Sobic008G115200 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic004G133201--Sobic003G169550 Sobic004G133201--Sobic003G394701 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic004G133201--Sobic007G046700 Sobic004G133201--Sobic004G134400 Sobic001G255866 Sobic001G255866 Sobic004G133201--Sobic001G255866 Sobic007G090433 Sobic007G090433 Sobic004G133201--Sobic007G090433 Sobic001G323101--Sobic009G079600 Sobic001G323101--Sobic004G134400 Sobic001G323101--Sobic003G187600 Sobic001G323101--Sobic004G274300 Sobic001G323101--Sobic007G132650 Sobic001G323101--Sobic003G112100 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic001G323101--Sobic004G129400 Sobic001G323101--Sobic003G169550 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic001G323101--Sobic007G127200 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic008G085800--Sobic002G171901 Sobic007G174500 Sobic007G174500 Sobic008G085800--Sobic007G174500 Sobic008G085800--Sobic006G223101 Sobic003G329300 Sobic003G329300 Sobic008G085800--Sobic003G329300 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic008G085800--Sobic009G176100 Sobic004G138100 Sobic004G138100 Sobic008G085800--Sobic004G138100 Sobic008G085800--Sobic007G004400 Sobic008G085800--Sobic003G335100 Sobic003G334400 Sobic003G334400 Sobic008G085800--Sobic003G334400 Sobic007G004400--Sobic003G335100 Sobic007G004400--Sobic008G119600 Sobic007G004400--Sobic008G115200 Sobic007G004400--Sobic006G223101 Sobic007G004400--Sobic002G074900 Sobic007G004400--Sobic003G406850 Sobic007G004400--Sobic006G176900 Sobic007G004400--Sobic010G136700 Sobic007G004400--Sobic006G223601
Octagon: transcription factors


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