Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G443500.1
Synonym Sb01g041670
Functional annotation tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed
UniProt C5WRM6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g13370.1 : tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a022636 , Zm00025a022637 , Zm00025a001478
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G064760.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G077800 expressed protein -
2 Sobic.008G012000 - -
3 Sobic.004G090500 - -
4 Sobic.007G083900 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
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16 Sobic.003G330800 LTPL29 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
17 Sobic.010G195301 - -
18 Sobic.008G051500 GATA zinc finger domain containing protein, expressed -
19 Sobic.008G068850 - -
20 Sobic.007G080300 MBTB20 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein


Gene co-expression network
sample Sobic001G443500 Sobic001G443500 Sobic006G077800 Sobic006G077800 Sobic001G443500--Sobic006G077800 Sobic008G012000 Sobic008G012000 Sobic001G443500--Sobic008G012000 Sobic004G090500 Sobic004G090500 Sobic001G443500--Sobic004G090500 Sobic007G083900 Sobic007G083900 Sobic001G443500--Sobic007G083900 Sobic004G126900 Sobic004G126900 Sobic001G443500--Sobic004G126900 Sobic007G024000 Sobic007G024000 Sobic001G443500--Sobic007G024000 Sobic008G069200 Sobic008G069200 Sobic001G443500--Sobic008G069200 Sobic001G085200 Sobic001G085200 Sobic001G443500--Sobic001G085200 Sobic010G022900 Sobic010G022900 Sobic001G443500--Sobic010G022900 Sobic006G077800--Sobic004G126900 Sobic006G077800--Sobic004G090500 Sobic006G077800--Sobic008G012000 Sobic006G077800--Sobic007G024000 Sobic006G077800--Sobic008G069200 Sobic006G077800--Sobic007G083900 Sobic010G137600 Sobic010G137600 Sobic006G077800--Sobic010G137600 Sobic006G077800--Sobic001G443500 Sobic001G029700 Sobic001G029700 Sobic006G077800--Sobic001G029700 Sobic008G012000--Sobic004G090500 Sobic008G012000--Sobic007G083900 Sobic008G012000--Sobic007G024000 Sobic008G068850 Sobic008G068850 Sobic008G012000--Sobic008G068850 Sobic008G012000--Sobic008G069200 Sobic005G058500 Sobic005G058500 Sobic008G012000--Sobic005G058500 Sobic009G020000 Sobic009G020000 Sobic008G012000--Sobic009G020000 Sobic008G068900 Sobic008G068900 Sobic008G012000--Sobic008G068900 Sobic008G188200 Sobic008G188200 Sobic008G012000--Sobic008G188200 Sobic004G090500--Sobic008G012000 Sobic004G090500--Sobic008G069200 Sobic004G090500--Sobic007G083900 Sobic004G090500--Sobic007G024000 Sobic004G090500--Sobic008G188200 Sobic004G090500--Sobic005G058500 Sobic004G090500--Sobic009G020000 Sobic004G090500--Sobic008G068850 Sobic004G354500 Sobic004G354500 Sobic004G090500--Sobic004G354500 Sobic007G083900--Sobic008G012000 Sobic007G083900--Sobic004G090500 Sobic007G083900--Sobic009G020000 Sobic010G258900 Sobic010G258900 Sobic007G083900--Sobic010G258900 Sobic007G040900 Sobic007G040900 Sobic007G083900--Sobic007G040900 Sobic003G099800 Sobic003G099800 Sobic007G083900--Sobic003G099800 Sobic002G164866 Sobic002G164866 Sobic007G083900--Sobic002G164866 Sobic003G129100 Sobic003G129100 Sobic007G083900--Sobic003G129100 Sobic003G139400 Sobic003G139400 Sobic007G083900--Sobic003G139400 Sobic004G126900--Sobic006G077800 Sobic004G126900--Sobic010G137600 Sobic004G126900--Sobic008G069200 Sobic004G126900--Sobic001G029700 Sobic003G076400 Sobic003G076400 Sobic004G126900--Sobic003G076400 Sobic004G126900--Sobic004G090500 Sobic004G126900--Sobic007G083900 Sobic004G126900--Sobic008G012000 Sobic002G116700 Sobic002G116700 Sobic004G126900--Sobic002G116700 Sobic007G024000--Sobic004G354500 Sobic007G024000--Sobic004G090500 Sobic007G024000--Sobic008G069200 Sobic007G024000--Sobic005G058500 Sobic005G178200 Sobic005G178200 Sobic007G024000--Sobic005G178200 Sobic007G024000--Sobic008G012000 Sobic007G024000--Sobic008G188200 Sobic003G415300 Sobic003G415300 Sobic007G024000--Sobic003G415300 Sobic010G195301 Sobic010G195301 Sobic007G024000--Sobic010G195301 Sobic008G069200--Sobic008G188200 Sobic008G069200--Sobic004G090500 Sobic008G069200--Sobic005G178200 Sobic008G069200--Sobic003G415300 Sobic003G326300 Sobic003G326300 Sobic008G069200--Sobic003G326300 Sobic008G069200--Sobic007G024000 Sobic008G184000 Sobic008G184000 Sobic008G069200--Sobic008G184000 Sobic008G069200--Sobic005G058500 Sobic008G082300 Sobic008G082300 Sobic008G069200--Sobic008G082300 Sobic008G051500 Sobic008G051500 Sobic001G085200--Sobic008G051500 Sobic010G029800 Sobic010G029800 Sobic001G085200--Sobic010G029800 Sobic003G232332 Sobic003G232332 Sobic001G085200--Sobic003G232332 Sobic005G052200 Sobic005G052200 Sobic001G085200--Sobic005G052200 Sobic001G541400 Sobic001G541400 Sobic001G085200--Sobic001G541400 Sobic001G269650 Sobic001G269650 Sobic001G085200--Sobic001G269650 Sobic007G066200 Sobic007G066200 Sobic001G085200--Sobic007G066200 Sobic004G008700 Sobic004G008700 Sobic001G085200--Sobic004G008700 Sobic005G042400 Sobic005G042400 Sobic001G085200--Sobic005G042400 Sobic003G010000 Sobic003G010000 Sobic010G022900--Sobic003G010000 Sobic003G179300 Sobic003G179300 Sobic010G022900--Sobic003G179300 Sobic003G330800 Sobic003G330800 Sobic010G022900--Sobic003G330800 Sobic010G022900--Sobic007G040900 Sobic003G167566 Sobic003G167566 Sobic010G022900--Sobic003G167566 Sobic006G144201 Sobic006G144201 Sobic010G022900--Sobic006G144201 Sobic010G022900--Sobic010G258900 Sobic008G070100 Sobic008G070100 Sobic010G022900--Sobic008G070100 Sobic005G174800 Sobic005G174800 Sobic010G022900--Sobic005G174800
Octagon: transcription factors


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