Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G010400.1
Synonym Sb02g001120
Functional annotation OsFBX1 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt C5X7B2
Pfam -
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF154
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g05880.1 : OsFBX1 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044898 , Zm00025a044899
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G349600 MATE efflux family protein, putative, expressed K03327: TC.MATE, SLC47A, norM, mdtK, multidrug resistance protein, MATE family
2 Sobic.005G120400 CBS domain-containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.003G407700 dnaJ domain containing protein, expressed -
4 Sobic.002G199800 - -
5 Sobic.003G191350 - -
6 Sobic.006G042900 FAR1 family protein, expressed -
7 Sobic.009G238650 - -
8 Sobic.005G049900 - -
9 Sobic.009G042800 expressed protein -
10 Sobic.006G239500 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
11 Sobic.002G330200 mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17, putative, expressed K17795: mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM17
12 Sobic.009G121200 stromal membrane-associated protein, putative, expressed K12486: stromal membrane-associated protein
13 Sobic.010G177500 syntaxin, putative, expressed K08486: syntaxin 1B/2/3
14 Sobic.010G073900 expressed protein -
15 Sobic.005G092100 - -
16 Sobic.002G088600 glucose-1-phosphate adenylyltransferase large subunit, putative, expressed K00975: glucose-1-phosphate adenylyltransferase
17 Sobic.005G147900 - -
18 Sobic.001G165901 - -
19 Sobic.001G308000 viral A-type inclusion protein repeat containing protein, expressed -
20 Sobic.007G185801 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G010400 Sobic002G010400 Sobic004G349600 Sobic004G349600 Sobic002G010400--Sobic004G349600 Sobic005G120400 Sobic005G120400 Sobic002G010400--Sobic005G120400 Sobic003G407700 Sobic003G407700 Sobic002G010400--Sobic003G407700 Sobic002G199800 Sobic002G199800 Sobic002G010400--Sobic002G199800 Sobic003G191350 Sobic003G191350 Sobic002G010400--Sobic003G191350 Sobic006G042900 Sobic006G042900 Sobic002G010400--Sobic006G042900 Sobic009G238650 Sobic009G238650 Sobic002G010400--Sobic009G238650 Sobic005G049900 Sobic005G049900 Sobic002G010400--Sobic005G049900 Sobic009G042800 Sobic009G042800 Sobic002G010400--Sobic009G042800 Sobic004G349600--Sobic002G199800 Sobic004G349600--Sobic009G238650 Sobic006G239500 Sobic006G239500 Sobic004G349600--Sobic006G239500 Sobic004G349600--Sobic005G120400 Sobic004G349600--Sobic003G407700 Sobic010G073900 Sobic010G073900 Sobic004G349600--Sobic010G073900 Sobic010G128350 Sobic010G128350 Sobic004G349600--Sobic010G128350 Sobic002G088600 Sobic002G088600 Sobic004G349600--Sobic002G088600 Sobic010G177500 Sobic010G177500 Sobic004G349600--Sobic010G177500 Sobic005G120400--Sobic004G349600 Sobic001G308000 Sobic001G308000 Sobic005G120400--Sobic001G308000 Sobic005G120400--Sobic009G238650 Sobic005G120400--Sobic010G177500 Sobic005G120400--Sobic002G199800 Sobic005G120400--Sobic006G239500 Sobic005G120400--Sobic003G191350 Sobic005G092100 Sobic005G092100 Sobic005G120400--Sobic005G092100 Sobic001G165901 Sobic001G165901 Sobic005G120400--Sobic001G165901 Sobic003G407700--Sobic010G073900 Sobic003G407700--Sobic002G199800 Sobic003G407700--Sobic004G349600 Sobic003G407700--Sobic009G238650 Sobic003G407700--Sobic006G239500 Sobic009G121200 Sobic009G121200 Sobic003G407700--Sobic009G121200 Sobic009G098700 Sobic009G098700 Sobic003G407700--Sobic009G098700 Sobic003G407700--Sobic005G120400 Sobic003G407700--Sobic001G165901 Sobic002G199800--Sobic006G239500 Sobic002G199800--Sobic004G349600 Sobic002G199800--Sobic003G407700 Sobic002G199800--Sobic009G238650 Sobic002G199800--Sobic010G073900 Sobic002G199800--Sobic005G120400 Sobic002G199800--Sobic009G098700 Sobic002G199800--Sobic010G128350 Sobic002G199800--Sobic001G165901 Sobic010G257800 Sobic010G257800 Sobic003G191350--Sobic010G257800 Sobic008G168932 Sobic008G168932 Sobic003G191350--Sobic008G168932 Sobic005G185750 Sobic005G185750 Sobic003G191350--Sobic005G185750 Sobic004G289900 Sobic004G289900 Sobic003G191350--Sobic004G289900 Sobic001G513400 Sobic001G513400 Sobic003G191350--Sobic001G513400 Sobic003G191350--Sobic005G092100 Sobic002G128700 Sobic002G128700 Sobic003G191350--Sobic002G128700 Sobic001G539880 Sobic001G539880 Sobic003G191350--Sobic001G539880 Sobic010G271600 Sobic010G271600 Sobic003G191350--Sobic010G271600 Sobic010G187800 Sobic010G187800 Sobic006G042900--Sobic010G187800 Sobic006G042900--Sobic001G513400 Sobic001G380000 Sobic001G380000 Sobic006G042900--Sobic001G380000 Sobic008G052800 Sobic008G052800 Sobic006G042900--Sobic008G052800 Sobic005G147900 Sobic005G147900 Sobic006G042900--Sobic005G147900 Sobic007G096900 Sobic007G096900 Sobic006G042900--Sobic007G096900 Sobic003G233800 Sobic003G233800 Sobic006G042900--Sobic003G233800 Sobic006G042900--Sobic004G289900 Sobic004G334900 Sobic004G334900 Sobic006G042900--Sobic004G334900 Sobic009G238650--Sobic006G239500 Sobic009G238650--Sobic004G349600 Sobic009G238650--Sobic002G199800 Sobic009G238650--Sobic010G073900 Sobic009G238650--Sobic002G088600 Sobic009G238650--Sobic010G128350 Sobic009G238650--Sobic005G120400 Sobic009G238650--Sobic003G407700 Sobic007G048101 Sobic007G048101 Sobic009G238650--Sobic007G048101 Sobic002G298201 Sobic002G298201 Sobic005G049900--Sobic002G298201 Sobic005G049900--Sobic005G147900 Sobic002G034200 Sobic002G034200 Sobic005G049900--Sobic002G034200 Sobic003G317000 Sobic003G317000 Sobic005G049900--Sobic003G317000 Sobic001G136150 Sobic001G136150 Sobic005G049900--Sobic001G136150 Sobic001G196400 Sobic001G196400 Sobic005G049900--Sobic001G196400 Sobic006G238500 Sobic006G238500 Sobic005G049900--Sobic006G238500 Sobic002G261400 Sobic002G261400 Sobic005G049900--Sobic002G261400 Sobic006G016800 Sobic006G016800 Sobic005G049900--Sobic006G016800 Sobic009G021000 Sobic009G021000 Sobic009G042800--Sobic009G021000 Sobic006G066050 Sobic006G066050 Sobic009G042800--Sobic006G066050 Sobic009G125100 Sobic009G125100 Sobic009G042800--Sobic009G125100 Sobic007G161100 Sobic007G161100 Sobic009G042800--Sobic007G161100 Sobic004G059200 Sobic004G059200 Sobic009G042800--Sobic004G059200 Sobic002G015200 Sobic002G015200 Sobic009G042800--Sobic002G015200 Sobic002G087600 Sobic002G087600 Sobic009G042800--Sobic002G087600 Sobic003G054800 Sobic003G054800 Sobic009G042800--Sobic003G054800 Sobic004G327000 Sobic004G327000 Sobic009G042800--Sobic004G327000
Octagon: transcription factors


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