Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G308000.1
Synonym Sb01g030020
Functional annotation viral A-type inclusion protein repeat containing protein, expressed
UniProt C5WTF4
Pfam PF10358
Panther DB PTHR13140 PTHR13140:SF402
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G22060 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g01710.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053569 , Zm00025a052040 , Zm00025a000145
Brachypodium PNT67836 , KQK24089 , KQK24088
Barley -
Wheat TraesCS4B02G361700 , TraesCS1A02G207100 , TraesCS4D02G354700 , TraesCS1B02G220900 , TraesCS5A02G529700
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G120400 CBS domain-containing protein, putative, expressed -
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3 Sobic.005G092100 - -
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13 Sobic.002G199800 - -
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15 Sobic.004G177900 - -
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18 Sobic.010G003200 pleckstrin homology domain-containing protein-related taxo, putative, expressed -
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Gene co-expression network
sample Sobic001G308000 Sobic001G308000 Sobic005G120400 Sobic005G120400 Sobic001G308000--Sobic005G120400 Sobic010G177500 Sobic010G177500 Sobic001G308000--Sobic010G177500 Sobic005G092100 Sobic005G092100 Sobic001G308000--Sobic005G092100 Sobic004G349600 Sobic004G349600 Sobic001G308000--Sobic004G349600 Sobic009G238650 Sobic009G238650 Sobic001G308000--Sobic009G238650 Sobic003G191350 Sobic003G191350 Sobic001G308000--Sobic003G191350 Sobic002G088600 Sobic002G088600 Sobic001G308000--Sobic002G088600 Sobic002G372000 Sobic002G372000 Sobic001G308000--Sobic002G372000 Sobic001G165901 Sobic001G165901 Sobic001G308000--Sobic001G165901 Sobic005G120400--Sobic004G349600 Sobic005G120400--Sobic001G308000 Sobic005G120400--Sobic009G238650 Sobic005G120400--Sobic010G177500 Sobic002G199800 Sobic002G199800 Sobic005G120400--Sobic002G199800 Sobic006G239500 Sobic006G239500 Sobic005G120400--Sobic006G239500 Sobic005G120400--Sobic003G191350 Sobic005G120400--Sobic005G092100 Sobic005G120400--Sobic001G165901 Sobic010G177500--Sobic005G092100 Sobic008G025400 Sobic008G025400 Sobic010G177500--Sobic008G025400 Sobic003G151400 Sobic003G151400 Sobic010G177500--Sobic003G151400 Sobic010G177500--Sobic002G088600 Sobic003G093100 Sobic003G093100 Sobic010G177500--Sobic003G093100 Sobic010G177500--Sobic002G372000 Sobic001G109900 Sobic001G109900 Sobic010G177500--Sobic001G109900 Sobic010G166600 Sobic010G166600 Sobic010G177500--Sobic010G166600 Sobic010G001200 Sobic010G001200 Sobic010G177500--Sobic010G001200 Sobic005G092100--Sobic003G151400 Sobic005G092100--Sobic010G001200 Sobic005G092100--Sobic001G109900 Sobic004G251900 Sobic004G251900 Sobic005G092100--Sobic004G251900 Sobic007G051100 Sobic007G051100 Sobic005G092100--Sobic007G051100 Sobic005G092100--Sobic008G025400 Sobic006G022700 Sobic006G022700 Sobic005G092100--Sobic006G022700 Sobic004G025500 Sobic004G025500 Sobic005G092100--Sobic004G025500 Sobic009G105100 Sobic009G105100 Sobic005G092100--Sobic009G105100 Sobic004G349600--Sobic002G199800 Sobic004G349600--Sobic009G238650 Sobic004G349600--Sobic006G239500 Sobic004G349600--Sobic005G120400 Sobic003G407700 Sobic003G407700 Sobic004G349600--Sobic003G407700 Sobic010G073900 Sobic010G073900 Sobic004G349600--Sobic010G073900 Sobic010G128350 Sobic010G128350 Sobic004G349600--Sobic010G128350 Sobic004G349600--Sobic002G088600 Sobic004G349600--Sobic010G177500 Sobic009G238650--Sobic006G239500 Sobic009G238650--Sobic004G349600 Sobic009G238650--Sobic002G199800 Sobic009G238650--Sobic010G073900 Sobic009G238650--Sobic002G088600 Sobic009G238650--Sobic010G128350 Sobic009G238650--Sobic005G120400 Sobic009G238650--Sobic003G407700 Sobic007G048101 Sobic007G048101 Sobic009G238650--Sobic007G048101 Sobic010G257800 Sobic010G257800 Sobic003G191350--Sobic010G257800 Sobic008G168932 Sobic008G168932 Sobic003G191350--Sobic008G168932 Sobic005G185750 Sobic005G185750 Sobic003G191350--Sobic005G185750 Sobic004G289900 Sobic004G289900 Sobic003G191350--Sobic004G289900 Sobic001G513400 Sobic001G513400 Sobic003G191350--Sobic001G513400 Sobic003G191350--Sobic005G092100 Sobic002G128700 Sobic002G128700 Sobic003G191350--Sobic002G128700 Sobic001G539880 Sobic001G539880 Sobic003G191350--Sobic001G539880 Sobic010G271600 Sobic010G271600 Sobic003G191350--Sobic010G271600 Sobic004G177900 Sobic004G177900 Sobic002G088600--Sobic004G177900 Sobic002G088600--Sobic003G093100 Sobic001G294500 Sobic001G294500 Sobic002G088600--Sobic001G294500 Sobic002G088600--Sobic008G025400 Sobic002G088600--Sobic003G151400 Sobic004G328500 Sobic004G328500 Sobic002G088600--Sobic004G328500 Sobic007G131000 Sobic007G131000 Sobic002G088600--Sobic007G131000 Sobic009G061601 Sobic009G061601 Sobic002G088600--Sobic009G061601 Sobic005G043300 Sobic005G043300 Sobic002G088600--Sobic005G043300 Sobic002G372000--Sobic010G001200 Sobic002G384500 Sobic002G384500 Sobic002G372000--Sobic002G384500 Sobic004G273600 Sobic004G273600 Sobic002G372000--Sobic004G273600 Sobic002G372000--Sobic005G092100 Sobic002G279900 Sobic002G279900 Sobic002G372000--Sobic002G279900 Sobic002G372000--Sobic006G022700 Sobic002G295800 Sobic002G295800 Sobic002G372000--Sobic002G295800 Sobic002G125100 Sobic002G125100 Sobic002G372000--Sobic002G125100 Sobic004G071900 Sobic004G071900 Sobic002G372000--Sobic004G071900 Sobic001G165901--Sobic010G128350 Sobic010G010201 Sobic010G010201 Sobic001G165901--Sobic010G010201 Sobic009G121200 Sobic009G121200 Sobic001G165901--Sobic009G121200 Sobic001G165901--Sobic005G120400 Sobic001G432200 Sobic001G432200 Sobic001G165901--Sobic001G432200 Sobic001G165901--Sobic004G349600 Sobic001G165901--Sobic002G088600 Sobic001G165901--Sobic005G092100 Sobic001G165901--Sobic003G151400
Octagon: transcription factors


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