Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G177500.1
Synonym SYP124, ATSYP124, Sb10g022930
Functional annotation syntaxin, putative, expressed
UniProt C5Z572
Pfam PF05739 PF00804
Panther DB PTHR19957 PTHR19957:SF80
NCBI CDD KOG0810; SNARE protein Syntaxin 1 and related proteins
KEGG Orthology K08486; syntaxin 1B/2/3
Gene Ontology GO:0005515; protein binding GO:0016020membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G61290 : syntaxin of plants 124
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g39050.1 : syntaxin, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a042274 , Zm00025a051266 , Zm00025a034586
Brachypodium KQK12847 , KQJ94003 , KQJ94002 , KQK17849
Barley HORVU6Hr1G038490.1 , HORVU6Hr1G038490.2 , HORVU6Hr1G038490.3 , HORVU6Hr1G038490.4 , HORVU6Hr1G038490.5 , HORVU6Hr1G038490.6 , HORVU7Hr1G085550.1 , HORVU7Hr1G085550.2 , HORVU6Hr1G038490.7
Wheat TraesCS6A02G182200 , TraesCS6B02G211000 , TraesCS7D02G354500 , TraesCS7A02G368400 , TraesCS6D02G169800 , TraesCS7B02G260100
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G092100 - -
2 Sobic.008G025400 ankyrin, putative, expressed -
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19 Sobic.007G222200 - -
20 Sobic.004G131400 DEF7 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G177500 Sobic010G177500 Sobic005G092100 Sobic005G092100 Sobic010G177500--Sobic005G092100 Sobic008G025400 Sobic008G025400 Sobic010G177500--Sobic008G025400 Sobic003G151400 Sobic003G151400 Sobic010G177500--Sobic003G151400 Sobic002G088600 Sobic002G088600 Sobic010G177500--Sobic002G088600 Sobic003G093100 Sobic003G093100 Sobic010G177500--Sobic003G093100 Sobic002G372000 Sobic002G372000 Sobic010G177500--Sobic002G372000 Sobic001G109900 Sobic001G109900 Sobic010G177500--Sobic001G109900 Sobic010G166600 Sobic010G166600 Sobic010G177500--Sobic010G166600 Sobic010G001200 Sobic010G001200 Sobic010G177500--Sobic010G001200 Sobic005G092100--Sobic003G151400 Sobic005G092100--Sobic010G001200 Sobic005G092100--Sobic001G109900 Sobic004G251900 Sobic004G251900 Sobic005G092100--Sobic004G251900 Sobic007G051100 Sobic007G051100 Sobic005G092100--Sobic007G051100 Sobic005G092100--Sobic008G025400 Sobic006G022700 Sobic006G022700 Sobic005G092100--Sobic006G022700 Sobic004G025500 Sobic004G025500 Sobic005G092100--Sobic004G025500 Sobic009G105100 Sobic009G105100 Sobic005G092100--Sobic009G105100 Sobic008G025400--Sobic003G093100 Sobic001G294500 Sobic001G294500 Sobic008G025400--Sobic001G294500 Sobic003G111000 Sobic003G111000 Sobic008G025400--Sobic003G111000 Sobic008G025400--Sobic003G151400 Sobic003G246500 Sobic003G246500 Sobic008G025400--Sobic003G246500 Sobic003G164400 Sobic003G164400 Sobic008G025400--Sobic003G164400 Sobic004G177900 Sobic004G177900 Sobic008G025400--Sobic004G177900 Sobic008G025400--Sobic002G088600 Sobic007G131000 Sobic007G131000 Sobic008G025400--Sobic007G131000 Sobic003G151400--Sobic001G294500 Sobic003G151400--Sobic001G109900 Sobic003G151400--Sobic007G131000 Sobic003G151400--Sobic003G093100 Sobic009G061601 Sobic009G061601 Sobic003G151400--Sobic009G061601 Sobic003G151400--Sobic008G025400 Sobic006G205400 Sobic006G205400 Sobic003G151400--Sobic006G205400 Sobic003G151400--Sobic005G092100 Sobic002G254700 Sobic002G254700 Sobic003G151400--Sobic002G254700 Sobic002G088600--Sobic004G177900 Sobic002G088600--Sobic003G093100 Sobic002G088600--Sobic001G294500 Sobic002G088600--Sobic008G025400 Sobic002G088600--Sobic003G151400 Sobic004G328500 Sobic004G328500 Sobic002G088600--Sobic004G328500 Sobic002G088600--Sobic007G131000 Sobic002G088600--Sobic009G061601 Sobic005G043300 Sobic005G043300 Sobic002G088600--Sobic005G043300 Sobic003G093100--Sobic008G025400 Sobic003G093100--Sobic001G294500 Sobic003G093100--Sobic003G151400 Sobic003G093100--Sobic002G088600 Sobic003G093100--Sobic004G177900 Sobic003G093100--Sobic007G131000 Sobic003G093100--Sobic003G246500 Sobic003G093100--Sobic003G164400 Sobic003G093100--Sobic009G061601 Sobic002G372000--Sobic010G001200 Sobic002G384500 Sobic002G384500 Sobic002G372000--Sobic002G384500 Sobic004G273600 Sobic004G273600 Sobic002G372000--Sobic004G273600 Sobic002G372000--Sobic005G092100 Sobic002G279900 Sobic002G279900 Sobic002G372000--Sobic002G279900 Sobic002G372000--Sobic006G022700 Sobic002G295800 Sobic002G295800 Sobic002G372000--Sobic002G295800 Sobic002G125100 Sobic002G125100 Sobic002G372000--Sobic002G125100 Sobic004G071900 Sobic004G071900 Sobic002G372000--Sobic004G071900 Sobic008G043300 Sobic008G043300 Sobic001G109900--Sobic008G043300 Sobic009G075400 Sobic009G075400 Sobic001G109900--Sobic009G075400 Sobic010G276100 Sobic010G276100 Sobic001G109900--Sobic010G276100 Sobic007G057600 Sobic007G057600 Sobic001G109900--Sobic007G057600 Sobic004G134000 Sobic004G134000 Sobic001G109900--Sobic004G134000 Sobic002G197900 Sobic002G197900 Sobic001G109900--Sobic002G197900 Sobic009G082900 Sobic009G082900 Sobic001G109900--Sobic009G082900 Sobic003G335200 Sobic003G335200 Sobic001G109900--Sobic003G335200 Sobic010G144700 Sobic010G144700 Sobic001G109900--Sobic010G144700 Sobic002G157900 Sobic002G157900 Sobic010G166600--Sobic002G157900 Sobic001G332200 Sobic001G332200 Sobic010G166600--Sobic001G332200 Sobic006G136700 Sobic006G136700 Sobic010G166600--Sobic006G136700 Sobic009G090400 Sobic009G090400 Sobic010G166600--Sobic009G090400 Sobic002G417401 Sobic002G417401 Sobic010G166600--Sobic002G417401 Sobic001G024300 Sobic001G024300 Sobic010G166600--Sobic001G024300 Sobic007G222200 Sobic007G222200 Sobic010G166600--Sobic007G222200 Sobic009G116100 Sobic009G116100 Sobic010G166600--Sobic009G116100 Sobic009G089200 Sobic009G089200 Sobic010G166600--Sobic009G089200 Sobic001G135950 Sobic001G135950 Sobic010G001200--Sobic001G135950 Sobic010G001200--Sobic002G279900 Sobic004G099200 Sobic004G099200 Sobic010G001200--Sobic004G099200 Sobic010G001200--Sobic004G071900 Sobic010G001200--Sobic002G125100 Sobic001G525600 Sobic001G525600 Sobic010G001200--Sobic001G525600 Sobic005G145400 Sobic005G145400 Sobic010G001200--Sobic005G145400 Sobic006G215500 Sobic006G215500 Sobic010G001200--Sobic006G215500 Sobic003G420500 Sobic003G420500 Sobic010G001200--Sobic003G420500
Octagon: transcription factors


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