Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G177900.1,Sobic.004G177900.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YQF0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G088600 glucose-1-phosphate adenylyltransferase large subunit, putative, expressed K00975: glucose-1-phosphate adenylyltransferase
2 Sobic.001G294500 phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase, chloroplast precursor, putative, expressed K01626: E2.5.1.54, aroF, aroG, 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase
3 Sobic.003G093100 cyclin-related protein, putative, expressed -
4 Sobic.008G025400 ankyrin, putative, expressed -
5 Sobic.004G328500 expressed protein -
6 Sobic.005G043300 - -
7 Sobic.003G151400 protein kinase, putative, expressed K13436: pto-interacting protein 1
8 Sobic.007G131000 dynamin-2B, putative, expressed K01528: dynamin 1/3
9 Sobic.003G246500 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.009G061601 - -
11 Sobic.003G445300 aquaporin protein, putative, expressed K09873: aquaporin TIP
12 Sobic.005G204600 OsMADS68 - MADS-box family gene with MIKC , type-box, expressed -
13 Sobic.007G133800 - -
14 Sobic.007G129800 expressed protein -
15 Sobic.010G215000 fasciclin-like arabinogalactan precursor protein, putative, expressed -
16 Sobic.002G414000 - -
17 Sobic.001G165700 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
18 Sobic.005G220400 pollen allergen, putative, expressed -
19 Sobic.003G164400 potassium transporter, putative, expressed K03549: KUP system potassium uptake protein
20 Sobic.007G016700 OsFBX142 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G177900 Sobic004G177900 Sobic002G088600 Sobic002G088600 Sobic004G177900--Sobic002G088600 Sobic001G294500 Sobic001G294500 Sobic004G177900--Sobic001G294500 Sobic003G093100 Sobic003G093100 Sobic004G177900--Sobic003G093100 Sobic008G025400 Sobic008G025400 Sobic004G177900--Sobic008G025400 Sobic004G328500 Sobic004G328500 Sobic004G177900--Sobic004G328500 Sobic005G043300 Sobic005G043300 Sobic004G177900--Sobic005G043300 Sobic003G151400 Sobic003G151400 Sobic004G177900--Sobic003G151400 Sobic007G131000 Sobic007G131000 Sobic004G177900--Sobic007G131000 Sobic003G246500 Sobic003G246500 Sobic004G177900--Sobic003G246500 Sobic002G088600--Sobic004G177900 Sobic002G088600--Sobic003G093100 Sobic002G088600--Sobic001G294500 Sobic002G088600--Sobic008G025400 Sobic002G088600--Sobic003G151400 Sobic002G088600--Sobic004G328500 Sobic002G088600--Sobic007G131000 Sobic009G061601 Sobic009G061601 Sobic002G088600--Sobic009G061601 Sobic002G088600--Sobic005G043300 Sobic001G294500--Sobic007G131000 Sobic001G294500--Sobic004G177900 Sobic001G294500--Sobic003G151400 Sobic001G294500--Sobic005G043300 Sobic001G294500--Sobic003G246500 Sobic001G294500--Sobic008G025400 Sobic001G294500--Sobic003G093100 Sobic005G204600 Sobic005G204600 Sobic001G294500--Sobic005G204600 Sobic001G294500--Sobic009G061601 Sobic003G093100--Sobic008G025400 Sobic003G093100--Sobic001G294500 Sobic003G093100--Sobic003G151400 Sobic003G093100--Sobic002G088600 Sobic003G093100--Sobic004G177900 Sobic003G093100--Sobic007G131000 Sobic003G093100--Sobic003G246500 Sobic003G164400 Sobic003G164400 Sobic003G093100--Sobic003G164400 Sobic003G093100--Sobic009G061601 Sobic008G025400--Sobic003G093100 Sobic008G025400--Sobic001G294500 Sobic003G111000 Sobic003G111000 Sobic008G025400--Sobic003G111000 Sobic008G025400--Sobic003G151400 Sobic008G025400--Sobic003G246500 Sobic008G025400--Sobic003G164400 Sobic008G025400--Sobic004G177900 Sobic008G025400--Sobic002G088600 Sobic008G025400--Sobic007G131000 Sobic004G328500--Sobic001G294500 Sobic004G328500--Sobic004G177900 Sobic004G052600 Sobic004G052600 Sobic004G328500--Sobic004G052600 Sobic001G143700 Sobic001G143700 Sobic004G328500--Sobic001G143700 Sobic008G138400 Sobic008G138400 Sobic004G328500--Sobic008G138400 Sobic002G097300 Sobic002G097300 Sobic004G328500--Sobic002G097300 Sobic005G148000 Sobic005G148000 Sobic004G328500--Sobic005G148000 Sobic002G006200 Sobic002G006200 Sobic004G328500--Sobic002G006200 Sobic005G189100 Sobic005G189100 Sobic004G328500--Sobic005G189100 Sobic007G160501 Sobic007G160501 Sobic005G043300--Sobic007G160501 Sobic001G246001 Sobic001G246001 Sobic005G043300--Sobic001G246001 Sobic005G214800 Sobic005G214800 Sobic005G043300--Sobic005G214800 Sobic003G445300 Sobic003G445300 Sobic005G043300--Sobic003G445300 Sobic002G414000 Sobic002G414000 Sobic005G043300--Sobic002G414000 Sobic003G351100 Sobic003G351100 Sobic005G043300--Sobic003G351100 Sobic009G110800 Sobic009G110800 Sobic005G043300--Sobic009G110800 Sobic010G215000 Sobic010G215000 Sobic005G043300--Sobic010G215000 Sobic008G125801 Sobic008G125801 Sobic005G043300--Sobic008G125801 Sobic003G151400--Sobic001G294500 Sobic001G109900 Sobic001G109900 Sobic003G151400--Sobic001G109900 Sobic003G151400--Sobic007G131000 Sobic003G151400--Sobic003G093100 Sobic003G151400--Sobic009G061601 Sobic003G151400--Sobic008G025400 Sobic006G205400 Sobic006G205400 Sobic003G151400--Sobic006G205400 Sobic005G092100 Sobic005G092100 Sobic003G151400--Sobic005G092100 Sobic002G254700 Sobic002G254700 Sobic003G151400--Sobic002G254700 Sobic007G131000--Sobic003G246500 Sobic005G040700 Sobic005G040700 Sobic007G131000--Sobic005G040700 Sobic004G100900 Sobic004G100900 Sobic007G131000--Sobic004G100900 Sobic003G175950 Sobic003G175950 Sobic007G131000--Sobic003G175950 Sobic010G051000 Sobic010G051000 Sobic007G131000--Sobic010G051000 Sobic001G332000 Sobic001G332000 Sobic007G131000--Sobic001G332000 Sobic001G329200 Sobic001G329200 Sobic007G131000--Sobic001G329200 Sobic001G269100 Sobic001G269100 Sobic007G131000--Sobic001G269100 Sobic001G171300 Sobic001G171300 Sobic007G131000--Sobic001G171300 Sobic003G246500--Sobic004G100900 Sobic010G091800 Sobic010G091800 Sobic003G246500--Sobic010G091800 Sobic001G269800 Sobic001G269800 Sobic003G246500--Sobic001G269800 Sobic002G053800 Sobic002G053800 Sobic003G246500--Sobic002G053800 Sobic009G203900 Sobic009G203900 Sobic003G246500--Sobic009G203900 Sobic004G293300 Sobic004G293300 Sobic003G246500--Sobic004G293300 Sobic008G154300 Sobic008G154300 Sobic003G246500--Sobic008G154300 Sobic001G306400 Sobic001G306400 Sobic003G246500--Sobic001G306400 Sobic007G222100 Sobic007G222100 Sobic003G246500--Sobic007G222100
Octagon: transcription factors


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