Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G120400.1
Synonym Sb05g017490
Functional annotation CBS domain-containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RI68
Pfam PF00564 PF00571
Panther DB PTHR13780 PTHR13780:SF45
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G50640 : CBS / octicosapeptide/Phox/Bemp1 (PB1) domains-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g69900.1 : CBS domain-containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029720
Brachypodium KQJ88499 , KQJ88498
Barley HORVU5Hr1G061750.10 , HORVU5Hr1G061750.11 , HORVU5Hr1G061750.8 , HORVU5Hr1G061750.9 , HORVU5Hr1G061750.2 , HORVU5Hr1G061750.3 , HORVU5Hr1G061750.1 , HORVU5Hr1G061750.6 , HORVU5Hr1G061750.7 , HORVU5Hr1G061750.4 , HORVU5Hr1G061750.5
Wheat TraesCS5B02G207600 , TraesCS5A02G209500 , TraesCS5D02G215700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G349600 MATE efflux family protein, putative, expressed K03327: TC.MATE, SLC47A, norM, mdtK, multidrug resistance protein, MATE family
2 Sobic.001G308000 viral A-type inclusion protein repeat containing protein, expressed -
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20 Sobic.002G372000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G120400 Sobic005G120400 Sobic004G349600 Sobic004G349600 Sobic005G120400--Sobic004G349600 Sobic001G308000 Sobic001G308000 Sobic005G120400--Sobic001G308000 Sobic009G238650 Sobic009G238650 Sobic005G120400--Sobic009G238650 Sobic010G177500 Sobic010G177500 Sobic005G120400--Sobic010G177500 Sobic002G199800 Sobic002G199800 Sobic005G120400--Sobic002G199800 Sobic006G239500 Sobic006G239500 Sobic005G120400--Sobic006G239500 Sobic003G191350 Sobic003G191350 Sobic005G120400--Sobic003G191350 Sobic005G092100 Sobic005G092100 Sobic005G120400--Sobic005G092100 Sobic001G165901 Sobic001G165901 Sobic005G120400--Sobic001G165901 Sobic004G349600--Sobic002G199800 Sobic004G349600--Sobic009G238650 Sobic004G349600--Sobic006G239500 Sobic004G349600--Sobic005G120400 Sobic003G407700 Sobic003G407700 Sobic004G349600--Sobic003G407700 Sobic010G073900 Sobic010G073900 Sobic004G349600--Sobic010G073900 Sobic010G128350 Sobic010G128350 Sobic004G349600--Sobic010G128350 Sobic002G088600 Sobic002G088600 Sobic004G349600--Sobic002G088600 Sobic004G349600--Sobic010G177500 Sobic001G308000--Sobic005G120400 Sobic001G308000--Sobic010G177500 Sobic001G308000--Sobic005G092100 Sobic001G308000--Sobic004G349600 Sobic001G308000--Sobic009G238650 Sobic001G308000--Sobic003G191350 Sobic001G308000--Sobic002G088600 Sobic002G372000 Sobic002G372000 Sobic001G308000--Sobic002G372000 Sobic001G308000--Sobic001G165901 Sobic009G238650--Sobic006G239500 Sobic009G238650--Sobic004G349600 Sobic009G238650--Sobic002G199800 Sobic009G238650--Sobic010G073900 Sobic009G238650--Sobic002G088600 Sobic009G238650--Sobic010G128350 Sobic009G238650--Sobic005G120400 Sobic009G238650--Sobic003G407700 Sobic007G048101 Sobic007G048101 Sobic009G238650--Sobic007G048101 Sobic010G177500--Sobic005G092100 Sobic008G025400 Sobic008G025400 Sobic010G177500--Sobic008G025400 Sobic003G151400 Sobic003G151400 Sobic010G177500--Sobic003G151400 Sobic010G177500--Sobic002G088600 Sobic003G093100 Sobic003G093100 Sobic010G177500--Sobic003G093100 Sobic010G177500--Sobic002G372000 Sobic001G109900 Sobic001G109900 Sobic010G177500--Sobic001G109900 Sobic010G166600 Sobic010G166600 Sobic010G177500--Sobic010G166600 Sobic010G001200 Sobic010G001200 Sobic010G177500--Sobic010G001200 Sobic002G199800--Sobic006G239500 Sobic002G199800--Sobic004G349600 Sobic002G199800--Sobic003G407700 Sobic002G199800--Sobic009G238650 Sobic002G199800--Sobic010G073900 Sobic002G199800--Sobic005G120400 Sobic009G098700 Sobic009G098700 Sobic002G199800--Sobic009G098700 Sobic002G199800--Sobic010G128350 Sobic002G199800--Sobic001G165901 Sobic006G239500--Sobic002G199800 Sobic006G239500--Sobic009G238650 Sobic006G239500--Sobic004G349600 Sobic006G239500--Sobic010G073900 Sobic006G239500--Sobic003G407700 Sobic006G239500--Sobic010G128350 Sobic006G239500--Sobic005G120400 Sobic006G239500--Sobic009G098700 Sobic006G239500--Sobic007G048101 Sobic010G257800 Sobic010G257800 Sobic003G191350--Sobic010G257800 Sobic008G168932 Sobic008G168932 Sobic003G191350--Sobic008G168932 Sobic005G185750 Sobic005G185750 Sobic003G191350--Sobic005G185750 Sobic004G289900 Sobic004G289900 Sobic003G191350--Sobic004G289900 Sobic001G513400 Sobic001G513400 Sobic003G191350--Sobic001G513400 Sobic003G191350--Sobic005G092100 Sobic002G128700 Sobic002G128700 Sobic003G191350--Sobic002G128700 Sobic001G539880 Sobic001G539880 Sobic003G191350--Sobic001G539880 Sobic010G271600 Sobic010G271600 Sobic003G191350--Sobic010G271600 Sobic005G092100--Sobic003G151400 Sobic005G092100--Sobic010G001200 Sobic005G092100--Sobic001G109900 Sobic004G251900 Sobic004G251900 Sobic005G092100--Sobic004G251900 Sobic007G051100 Sobic007G051100 Sobic005G092100--Sobic007G051100 Sobic005G092100--Sobic008G025400 Sobic006G022700 Sobic006G022700 Sobic005G092100--Sobic006G022700 Sobic004G025500 Sobic004G025500 Sobic005G092100--Sobic004G025500 Sobic009G105100 Sobic009G105100 Sobic005G092100--Sobic009G105100 Sobic001G165901--Sobic010G128350 Sobic010G010201 Sobic010G010201 Sobic001G165901--Sobic010G010201 Sobic009G121200 Sobic009G121200 Sobic001G165901--Sobic009G121200 Sobic001G165901--Sobic005G120400 Sobic001G432200 Sobic001G432200 Sobic001G165901--Sobic001G432200 Sobic001G165901--Sobic004G349600 Sobic001G165901--Sobic002G088600 Sobic001G165901--Sobic005G092100 Sobic001G165901--Sobic003G151400
Octagon: transcription factors


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