Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G349600.1
Synonym Sb04g037630
Functional annotation MATE efflux family protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RQY9
Pfam PF01554
Panther DB PTHR11206 PTHR11206:SF109
NCBI CDD KOG1347; Uncharacterized membrane protein, predicted efflux pump
KEGG Orthology K03327; TC.MATE, SLC47A, norM, mdtK, multidrug resistance protein, MATE family
Gene Ontology GO:0016020; membrane GO:0015297antiporter activity GO:0006855drug transmembrane transport


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G00350 : MATE efflux family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g44870.1 : MATE efflux family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a032299 , Zm00025a030519 , Zm00025a017378 , Zm00025a001018 , Zm00025a039938 , Zm00025a032766
Brachypodium PNT69457 , KQK01431 , KQK01430
Barley HORVU6Hr1G091840.2 , HORVU6Hr1G091840.1 , HORVU6Hr1G091850.1 , HORVU6Hr1G091850.3 , HORVU6Hr1G091850.2
Wheat TraesCS6D02G384400 , TraesCS6A02G400200 , TraesCS6B02G440400
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic004G349600 Sobic004G349600 Sobic002G199800 Sobic002G199800 Sobic004G349600--Sobic002G199800 Sobic009G238650 Sobic009G238650 Sobic004G349600--Sobic009G238650 Sobic006G239500 Sobic006G239500 Sobic004G349600--Sobic006G239500 Sobic005G120400 Sobic005G120400 Sobic004G349600--Sobic005G120400 Sobic003G407700 Sobic003G407700 Sobic004G349600--Sobic003G407700 Sobic010G073900 Sobic010G073900 Sobic004G349600--Sobic010G073900 Sobic010G128350 Sobic010G128350 Sobic004G349600--Sobic010G128350 Sobic002G088600 Sobic002G088600 Sobic004G349600--Sobic002G088600 Sobic010G177500 Sobic010G177500 Sobic004G349600--Sobic010G177500 Sobic002G199800--Sobic006G239500 Sobic002G199800--Sobic004G349600 Sobic002G199800--Sobic003G407700 Sobic002G199800--Sobic009G238650 Sobic002G199800--Sobic010G073900 Sobic002G199800--Sobic005G120400 Sobic009G098700 Sobic009G098700 Sobic002G199800--Sobic009G098700 Sobic002G199800--Sobic010G128350 Sobic001G165901 Sobic001G165901 Sobic002G199800--Sobic001G165901 Sobic009G238650--Sobic006G239500 Sobic009G238650--Sobic004G349600 Sobic009G238650--Sobic002G199800 Sobic009G238650--Sobic010G073900 Sobic009G238650--Sobic002G088600 Sobic009G238650--Sobic010G128350 Sobic009G238650--Sobic005G120400 Sobic009G238650--Sobic003G407700 Sobic007G048101 Sobic007G048101 Sobic009G238650--Sobic007G048101 Sobic006G239500--Sobic002G199800 Sobic006G239500--Sobic009G238650 Sobic006G239500--Sobic004G349600 Sobic006G239500--Sobic010G073900 Sobic006G239500--Sobic003G407700 Sobic006G239500--Sobic010G128350 Sobic006G239500--Sobic005G120400 Sobic006G239500--Sobic009G098700 Sobic006G239500--Sobic007G048101 Sobic005G120400--Sobic004G349600 Sobic001G308000 Sobic001G308000 Sobic005G120400--Sobic001G308000 Sobic005G120400--Sobic009G238650 Sobic005G120400--Sobic010G177500 Sobic005G120400--Sobic002G199800 Sobic005G120400--Sobic006G239500 Sobic003G191350 Sobic003G191350 Sobic005G120400--Sobic003G191350 Sobic005G092100 Sobic005G092100 Sobic005G120400--Sobic005G092100 Sobic005G120400--Sobic001G165901 Sobic003G407700--Sobic010G073900 Sobic003G407700--Sobic002G199800 Sobic003G407700--Sobic004G349600 Sobic003G407700--Sobic009G238650 Sobic003G407700--Sobic006G239500 Sobic009G121200 Sobic009G121200 Sobic003G407700--Sobic009G121200 Sobic003G407700--Sobic009G098700 Sobic003G407700--Sobic005G120400 Sobic003G407700--Sobic001G165901 Sobic010G073900--Sobic003G407700 Sobic010G073900--Sobic002G199800 Sobic010G073900--Sobic009G238650 Sobic010G073900--Sobic006G239500 Sobic010G073900--Sobic004G349600 Sobic001G322400 Sobic001G322400 Sobic010G073900--Sobic001G322400 Sobic010G073900--Sobic010G128350 Sobic010G073900--Sobic009G098700 Sobic010G073900--Sobic009G121200 Sobic010G010201 Sobic010G010201 Sobic010G128350--Sobic010G010201 Sobic010G128350--Sobic009G238650 Sobic010G128350--Sobic006G239500 Sobic010G128350--Sobic001G165901 Sobic010G128350--Sobic004G349600 Sobic010G128350--Sobic010G073900 Sobic010G128350--Sobic002G199800 Sobic001G432200 Sobic001G432200 Sobic010G128350--Sobic001G432200 Sobic010G128350--Sobic002G088600 Sobic004G177900 Sobic004G177900 Sobic002G088600--Sobic004G177900 Sobic003G093100 Sobic003G093100 Sobic002G088600--Sobic003G093100 Sobic001G294500 Sobic001G294500 Sobic002G088600--Sobic001G294500 Sobic008G025400 Sobic008G025400 Sobic002G088600--Sobic008G025400 Sobic003G151400 Sobic003G151400 Sobic002G088600--Sobic003G151400 Sobic004G328500 Sobic004G328500 Sobic002G088600--Sobic004G328500 Sobic007G131000 Sobic007G131000 Sobic002G088600--Sobic007G131000 Sobic009G061601 Sobic009G061601 Sobic002G088600--Sobic009G061601 Sobic005G043300 Sobic005G043300 Sobic002G088600--Sobic005G043300 Sobic010G177500--Sobic005G092100 Sobic010G177500--Sobic008G025400 Sobic010G177500--Sobic003G151400 Sobic010G177500--Sobic002G088600 Sobic010G177500--Sobic003G093100 Sobic002G372000 Sobic002G372000 Sobic010G177500--Sobic002G372000 Sobic001G109900 Sobic001G109900 Sobic010G177500--Sobic001G109900 Sobic010G166600 Sobic010G166600 Sobic010G177500--Sobic010G166600 Sobic010G001200 Sobic010G001200 Sobic010G177500--Sobic010G001200
Octagon: transcription factors


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