Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G303000.3,Sobic.004G303000.2,Sobic.004G303000.4,Sobic.004G303000.1
Synonym Sb04g033620
Functional annotation DTA2, putative, expressed
UniProt C5XS55 , A0A1Z5RPS4 , A0A1Z5RQ91 , C5XS59
Pfam PF05686
Panther DB PTHR12203:SF33 PTHR12203 PTHR12203 PTHR12203:SF33
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G23850 : Arabidopsis thaliana protein of unknown function (DUF821)
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g42920.1 : DTA2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010436 , Zm00025a032137
Brachypodium KQK00519 , KQK00518 , PNT69133 , PNT69132 , PNT69131 , PNT69130 , KQJ83775 , PNT61565
Barley HORVU6Hr1G060750.6 , HORVU6Hr1G060750.7 , HORVU6Hr1G060750.4 , HORVU6Hr1G060750.5 , HORVU6Hr1G060750.2 , HORVU6Hr1G060750.3 , HORVU6Hr1G060750.1 , HORVU6Hr1G060750.8 , HORVU6Hr1G060750.9 , HORVU6Hr1G060750.10 , HORVU6Hr1G060750.18 , HORVU6Hr1G060750.14 , HORVU6Hr1G060750.15 , HORVU6Hr1G060750.16 , HORVU6Hr1G060750.17 , HORVU6Hr1G060750.11 , HORVU6Hr1G060750.12 , HORVU6Hr1G060750.13
Wheat TraesCS2A02G368900 , TraesCS2A02G368900 , TraesCS2D02G365700 , TraesCS6B02G266000 , TraesCS6D02G220200 , TraesCS2A02G369000 , TraesCSU02G025200 , TraesCS2B02G093400 , TraesCS6D02G220200 , TraesCS2B02G386200 , TraesCS6A02G237500 , TraesCS2D02G365600
Populus PNT56552


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G092100 - -
2 Sobic.008G159701 - -
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4 Sobic.010G003200 pleckstrin homology domain-containing protein-related taxo, putative, expressed -
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6 Sobic.007G226700 -(PubMedID : 26976818)@dicarboxylate transporter 4(PubMedID : 27016024)@citrate transporter, putative, expressed K03319: divalent anion:Na+ symporter, DASS family
7 Sobic.001G226600 Beta amylase BAM (Os)(PubMedID : 27208977)@beta-amylase, putative, expressed K01177: beta-amylase
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19 Sobic.006G022700 OsFBD9 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
20 Sobic.009G089000 ATCHX, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G303000 Sobic004G303000 Sobic005G092100 Sobic005G092100 Sobic004G303000--Sobic005G092100 Sobic008G159701 Sobic008G159701 Sobic004G303000--Sobic008G159701 Sobic006G032000 Sobic006G032000 Sobic004G303000--Sobic006G032000 Sobic010G003200 Sobic010G003200 Sobic004G303000--Sobic010G003200 Sobic003G151400 Sobic003G151400 Sobic004G303000--Sobic003G151400 Sobic007G226700 Sobic007G226700 Sobic004G303000--Sobic007G226700 Sobic001G226600 Sobic001G226600 Sobic004G303000--Sobic001G226600 Sobic007G222200 Sobic007G222200 Sobic004G303000--Sobic007G222200 Sobic002G417401 Sobic002G417401 Sobic004G303000--Sobic002G417401 Sobic005G092100--Sobic003G151400 Sobic010G001200 Sobic010G001200 Sobic005G092100--Sobic010G001200 Sobic001G109900 Sobic001G109900 Sobic005G092100--Sobic001G109900 Sobic004G251900 Sobic004G251900 Sobic005G092100--Sobic004G251900 Sobic007G051100 Sobic007G051100 Sobic005G092100--Sobic007G051100 Sobic008G025400 Sobic008G025400 Sobic005G092100--Sobic008G025400 Sobic006G022700 Sobic006G022700 Sobic005G092100--Sobic006G022700 Sobic004G025500 Sobic004G025500 Sobic005G092100--Sobic004G025500 Sobic009G105100 Sobic009G105100 Sobic005G092100--Sobic009G105100 Sobic004G290600 Sobic004G290600 Sobic008G159701--Sobic004G290600 Sobic006G205400 Sobic006G205400 Sobic008G159701--Sobic006G205400 Sobic005G003700 Sobic005G003700 Sobic008G159701--Sobic005G003700 Sobic002G254700 Sobic002G254700 Sobic008G159701--Sobic002G254700 Sobic003G333100 Sobic003G333100 Sobic008G159701--Sobic003G333100 Sobic008G159701--Sobic003G151400 Sobic008G159701--Sobic010G001200 Sobic009G061601 Sobic009G061601 Sobic008G159701--Sobic009G061601 Sobic007G091400 Sobic007G091400 Sobic008G159701--Sobic007G091400 Sobic009G098400 Sobic009G098400 Sobic006G032000--Sobic009G098400 Sobic005G214700 Sobic005G214700 Sobic006G032000--Sobic005G214700 Sobic004G187400 Sobic004G187400 Sobic006G032000--Sobic004G187400 Sobic010G271600 Sobic010G271600 Sobic006G032000--Sobic010G271600 Sobic010G190500 Sobic010G190500 Sobic006G032000--Sobic010G190500 Sobic008G102850 Sobic008G102850 Sobic006G032000--Sobic008G102850 Sobic006G032000--Sobic002G417401 Sobic006G032000--Sobic006G022700 Sobic009G090400 Sobic009G090400 Sobic006G032000--Sobic009G090400 Sobic004G273600 Sobic004G273600 Sobic010G003200--Sobic004G273600 Sobic010G003200--Sobic009G105100 Sobic010G003200--Sobic003G151400 Sobic002G295800 Sobic002G295800 Sobic010G003200--Sobic002G295800 Sobic010G252600 Sobic010G252600 Sobic010G003200--Sobic010G252600 Sobic002G372000 Sobic002G372000 Sobic010G003200--Sobic002G372000 Sobic005G110160 Sobic005G110160 Sobic010G003200--Sobic005G110160 Sobic001G142501 Sobic001G142501 Sobic010G003200--Sobic001G142501 Sobic010G003200--Sobic005G092100 Sobic001G294500 Sobic001G294500 Sobic003G151400--Sobic001G294500 Sobic003G151400--Sobic001G109900 Sobic007G131000 Sobic007G131000 Sobic003G151400--Sobic007G131000 Sobic003G093100 Sobic003G093100 Sobic003G151400--Sobic003G093100 Sobic003G151400--Sobic009G061601 Sobic003G151400--Sobic008G025400 Sobic003G151400--Sobic006G205400 Sobic003G151400--Sobic005G092100 Sobic003G151400--Sobic002G254700 Sobic005G148950 Sobic005G148950 Sobic007G226700--Sobic005G148950 Sobic010G166600 Sobic010G166600 Sobic007G226700--Sobic010G166600 Sobic005G031700 Sobic005G031700 Sobic007G226700--Sobic005G031700 Sobic006G136700 Sobic006G136700 Sobic007G226700--Sobic006G136700 Sobic001G024300 Sobic001G024300 Sobic007G226700--Sobic001G024300 Sobic009G116100 Sobic009G116100 Sobic007G226700--Sobic009G116100 Sobic001G332200 Sobic001G332200 Sobic007G226700--Sobic001G332200 Sobic002G157900 Sobic002G157900 Sobic007G226700--Sobic002G157900 Sobic001G511100 Sobic001G511100 Sobic007G226700--Sobic001G511100 Sobic002G282600 Sobic002G282600 Sobic001G226600--Sobic002G282600 Sobic001G226600--Sobic006G032000 Sobic001G220800 Sobic001G220800 Sobic001G226600--Sobic001G220800 Sobic004G350400 Sobic004G350400 Sobic001G226600--Sobic004G350400 Sobic003G438500 Sobic003G438500 Sobic001G226600--Sobic003G438500 Sobic002G091300 Sobic002G091300 Sobic001G226600--Sobic002G091300 Sobic004G131400 Sobic004G131400 Sobic001G226600--Sobic004G131400 Sobic001G226600--Sobic009G116100 Sobic010G056500 Sobic010G056500 Sobic001G226600--Sobic010G056500 Sobic007G222200--Sobic009G090400 Sobic007G222200--Sobic002G417401 Sobic007G222200--Sobic001G024300 Sobic007G222200--Sobic002G157900 Sobic005G122100 Sobic005G122100 Sobic007G222200--Sobic005G122100 Sobic003G009600 Sobic003G009600 Sobic007G222200--Sobic003G009600 Sobic007G222200--Sobic006G136700 Sobic007G222200--Sobic009G116100 Sobic007G222200--Sobic001G332200 Sobic002G417401--Sobic007G222200 Sobic002G417401--Sobic001G024300 Sobic002G417401--Sobic001G332200 Sobic002G417401--Sobic002G157900 Sobic002G417401--Sobic009G090400 Sobic002G417401--Sobic006G136700 Sobic002G417401--Sobic009G116100 Sobic002G417401--Sobic003G009600 Sobic002G417401--Sobic002G091300
Octagon: transcription factors


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