Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G012000.1
Synonym Sb02g001270
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X7W5
Pfam -
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF629
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14470 : NB-ARC domain-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g02630.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS5A02G518500
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G011900 expressed protein -
2 Sobic.001G407300 expressed protein -
3 Sobic.007G226500 spotted leaf 11, putative, expressed -
4 Sobic.010G261900 methyltransferase, putative, expressed -
5 Sobic.009G180600 CAMK_CAMK_like.4 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
6 Sobic.009G167400 KIP1, putative, expressed -
7 Sobic.008G002201 - -
8 Sobic.004G289100 OsSub20 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
9 Sobic.006G230000 - -
10 Sobic.004G008500 - -
11 Sobic.003G347800 KIP1, putative, expressed -
12 Sobic.003G211000 - -
13 Sobic.010G279600 ZOS2-19 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
14 Sobic.009G044200 C2 domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.001G152800 pollen preferential protein, putative, expressed -
16 Sobic.001G445400 expressed protein -
17 Sobic.007G166500 expansin precursor, putative, expressed -
18 Sobic.010G063700 plasma membrane ATPase, putative, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase
19 Sobic.003G434100 - -
20 Sobic.002G029000 protein kinase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G012000 Sobic002G012000 Sobic002G011900 Sobic002G011900 Sobic002G012000--Sobic002G011900 Sobic001G407300 Sobic001G407300 Sobic002G012000--Sobic001G407300 Sobic007G226500 Sobic007G226500 Sobic002G012000--Sobic007G226500 Sobic010G261900 Sobic010G261900 Sobic002G012000--Sobic010G261900 Sobic009G180600 Sobic009G180600 Sobic002G012000--Sobic009G180600 Sobic009G167400 Sobic009G167400 Sobic002G012000--Sobic009G167400 Sobic008G002201 Sobic008G002201 Sobic002G012000--Sobic008G002201 Sobic004G289100 Sobic004G289100 Sobic002G012000--Sobic004G289100 Sobic006G230000 Sobic006G230000 Sobic002G012000--Sobic006G230000 Sobic009G072600 Sobic009G072600 Sobic002G011900--Sobic009G072600 Sobic005G199800 Sobic005G199800 Sobic002G011900--Sobic005G199800 Sobic002G061732 Sobic002G061732 Sobic002G011900--Sobic002G061732 Sobic002G323200 Sobic002G323200 Sobic002G011900--Sobic002G323200 Sobic004G057000 Sobic004G057000 Sobic002G011900--Sobic004G057000 Sobic002G029000 Sobic002G029000 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Octagon: transcription factors


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