Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G062700.3,Sobic.002G062700.2,Sobic.002G062700.5,Sobic.002G062700.4
Synonym Sb02g005220
Functional annotation Leucine Rich Repeat family protein, expressed
UniProt A0A1W0W2N6 , C5XBV2
Pfam PF13855 PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF528
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G69550 : disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class),Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g46200.1 : Leucine Rich Repeat family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS4A02G493400
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
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15 Sobic.003G173032 - -
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19 Sobic.004G224300 5-azacytidine resistance protein related, putative, expressed -
20 Sobic.002G344100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G062700 Sobic002G062700 Sobic006G123700 Sobic006G123700 Sobic002G062700--Sobic006G123700 Sobic008G050100 Sobic008G050100 Sobic002G062700--Sobic008G050100 Sobic010G136900 Sobic010G136900 Sobic002G062700--Sobic010G136900 Sobic009G187500 Sobic009G187500 Sobic002G062700--Sobic009G187500 Sobic006G144800 Sobic006G144800 Sobic002G062700--Sobic006G144800 Sobic002G101800 Sobic002G101800 Sobic002G062700--Sobic002G101800 Sobic008G119200 Sobic008G119200 Sobic002G062700--Sobic008G119200 Sobic003G283750 Sobic003G283750 Sobic002G062700--Sobic003G283750 Sobic007G124000 Sobic007G124000 Sobic002G062700--Sobic007G124000 Sobic006G123700--Sobic002G101800 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic006G123700--Sobic004G224300 Sobic001G137200 Sobic001G137200 Sobic006G123700--Sobic001G137200 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic006G123700--Sobic002G048250 Sobic003G173032 Sobic003G173032 Sobic006G123700--Sobic003G173032 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic006G123700--Sobic005G209800 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic006G123700--Sobic008G002100 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic006G123700--Sobic001G527400 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic006G123700--Sobic007G183000 Sobic003G028800 Sobic003G028800 Sobic008G050100--Sobic003G028800 Sobic008G050100--Sobic006G123700 Sobic008G050100--Sobic002G101800 Sobic008G050100--Sobic006G144800 Sobic008G050100--Sobic010G136900 Sobic008G050100--Sobic003G173032 Sobic002G422200 Sobic002G422200 Sobic008G050100--Sobic002G422200 Sobic010G261400 Sobic010G261400 Sobic008G050100--Sobic010G261400 Sobic008G050100--Sobic008G002100 Sobic010G136900--Sobic002G101800 Sobic003G191800 Sobic003G191800 Sobic010G136900--Sobic003G191800 Sobic005G102200 Sobic005G102200 Sobic010G136900--Sobic005G102200 Sobic007G139000 Sobic007G139000 Sobic010G136900--Sobic007G139000 Sobic002G283800 Sobic002G283800 Sobic010G136900--Sobic002G283800 Sobic010G136900--Sobic006G123700 Sobic003G111600 Sobic003G111600 Sobic010G136900--Sobic003G111600 Sobic010G152700 Sobic010G152700 Sobic010G136900--Sobic010G152700 Sobic002G344100 Sobic002G344100 Sobic010G136900--Sobic002G344100 Sobic009G187500--Sobic002G048250 Sobic009G187500--Sobic008G002100 Sobic004G089700 Sobic004G089700 Sobic009G187500--Sobic004G089700 Sobic009G187500--Sobic007G183000 Sobic009G187500--Sobic001G527400 Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic009G187500--Sobic008G023000 Sobic009G187500--Sobic005G209800 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic009G187500--Sobic004G226300 Sobic009G187500--Sobic004G224300 Sobic006G144800--Sobic005G209800 Sobic006G144800--Sobic008G002100 Sobic006G144800--Sobic003G173032 Sobic006G144800--Sobic001G527400 Sobic006G144800--Sobic008G023000 Sobic003G104900 Sobic003G104900 Sobic006G144800--Sobic003G104900 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic006G144800--Sobic006G171000 Sobic006G144800--Sobic009G187500 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic006G144800--Sobic005G231800 Sobic002G101800--Sobic005G102200 Sobic002G101800--Sobic003G191800 Sobic002G101800--Sobic006G123700 Sobic002G101800--Sobic010G152700 Sobic002G101800--Sobic007G139000 Sobic002G101800--Sobic001G137200 Sobic001G483700 Sobic001G483700 Sobic002G101800--Sobic001G483700 Sobic002G285525 Sobic002G285525 Sobic002G101800--Sobic002G285525 Sobic002G101800--Sobic003G111600 Sobic008G119200--Sobic002G048250 Sobic008G119200--Sobic007G183000 Sobic008G119200--Sobic004G226300 Sobic008G119200--Sobic005G231800 Sobic008G119200--Sobic001G527400 Sobic008G119200--Sobic002G285525 Sobic008G119200--Sobic008G023000 Sobic008G119200--Sobic008G002100 Sobic004G347866 Sobic004G347866 Sobic008G119200--Sobic004G347866 Sobic010G029200 Sobic010G029200 Sobic003G283750--Sobic010G029200 Sobic003G142900 Sobic003G142900 Sobic003G283750--Sobic003G142900 Sobic001G460700 Sobic001G460700 Sobic003G283750--Sobic001G460700 Sobic010G208300 Sobic010G208300 Sobic003G283750--Sobic010G208300 Sobic009G039400 Sobic009G039400 Sobic003G283750--Sobic009G039400 Sobic010G068300 Sobic010G068300 Sobic003G283750--Sobic010G068300 Sobic003G081400 Sobic003G081400 Sobic003G283750--Sobic003G081400 Sobic010G045300 Sobic010G045300 Sobic003G283750--Sobic010G045300 Sobic005G022600 Sobic005G022600 Sobic003G283750--Sobic005G022600 Sobic007G124000--Sobic010G136900 Sobic007G124000--Sobic002G283800 Sobic009G088401 Sobic009G088401 Sobic007G124000--Sobic009G088401 Sobic007G124000--Sobic002G101800 Sobic007G124000--Sobic006G144800 Sobic007G124000--Sobic006G123700 Sobic007G124000--Sobic003G191800 Sobic007G124000--Sobic010G152700 Sobic007G124000--Sobic008G119200
Octagon: transcription factors


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