Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G205800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QCK3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G285101 - -
2 Sobic.005G208700 expressed protein K11968: ariadne-1
3 Sobic.010G034700 transferase family protein, putative, expressed -
4 Sobic.002G347850 - -
5 Sobic.002G077700 O-methyltransferase, putative, expressed -
6 Sobic.001G064400 expressed protein -
7 Sobic.004G184600 - -
8 Sobic.009G043800 SbDFR4 expression was not detectable in the seedlings of either sorghum cultivar under our experimental conditions.(PubMedID : 20529887)@dihydroflavonol-4-reductase, putative, expressed K13082: bifunctional dihydroflavonol 4-reductase/flavanone 4-reductase
9 Sobic.004G161501 - -
10 Sobic.002G191450 - -
11 Sobic.002G059700 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -
12 Sobic.004G113500 tRNA-splicing endonuclease positive effector-related, putative, expressed K10706: SETX, senataxin
13 Sobic.001G209550 - -
14 Sobic.001G305550 - -
15 Sobic.001G273400 - -
16 Sobic.002G049750 - -
17 Sobic.003G314566 - -
18 Sobic.004G150700 - -
19 Sobic.007G157600 expressed protein -
20 Sobic.006G147101 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G205800 Sobic002G205800 Sobic003G285101 Sobic003G285101 Sobic002G205800--Sobic003G285101 Sobic005G208700 Sobic005G208700 Sobic002G205800--Sobic005G208700 Sobic010G034700 Sobic010G034700 Sobic002G205800--Sobic010G034700 Sobic002G347850 Sobic002G347850 Sobic002G205800--Sobic002G347850 Sobic002G077700 Sobic002G077700 Sobic002G205800--Sobic002G077700 Sobic001G064400 Sobic001G064400 Sobic002G205800--Sobic001G064400 Sobic004G184600 Sobic004G184600 Sobic002G205800--Sobic004G184600 Sobic009G043800 Sobic009G043800 Sobic002G205800--Sobic009G043800 Sobic004G161501 Sobic004G161501 Sobic002G205800--Sobic004G161501 Sobic001G273400 Sobic001G273400 Sobic003G285101--Sobic001G273400 Sobic006G246700 Sobic006G246700 Sobic003G285101--Sobic006G246700 Sobic004G113500 Sobic004G113500 Sobic003G285101--Sobic004G113500 Sobic005G025001 Sobic005G025001 Sobic003G285101--Sobic005G025001 Sobic010G151325 Sobic010G151325 Sobic003G285101--Sobic010G151325 Sobic010G207325 Sobic010G207325 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Sobic002G143766 Sobic002G143766 Sobic004G161501--Sobic002G143766
Octagon: transcription factors


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