Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G208700.1
Synonym Sb05g026220, ATARI8, ARI8
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y7I5
Pfam PF01485
Panther DB PTHR11685 PTHR11685:SF131
NCBI CDD KOG1815; Predicted E3 ubiquitin ligase
KEGG Orthology K11968; ariadne-1
Gene Ontology GO:0016567; protein ubiquitination GO:0004842ubiquitin-protein transferase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G31510 : IBR domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g38630.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029172 , Zm00025a015947
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.010G060800 glutamate synthase, chloroplast precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G208700 Sobic005G208700 Sobic002G265700 Sobic002G265700 Sobic005G208700--Sobic002G265700 Sobic001G305550 Sobic001G305550 Sobic005G208700--Sobic001G305550 Sobic002G205800 Sobic002G205800 Sobic005G208700--Sobic002G205800 Sobic002G084600 Sobic002G084600 Sobic005G208700--Sobic002G084600 Sobic002G162450 Sobic002G162450 Sobic005G208700--Sobic002G162450 Sobic002G020950 Sobic002G020950 Sobic005G208700--Sobic002G020950 Sobic006G225700 Sobic006G225700 Sobic005G208700--Sobic006G225700 Sobic001G006600 Sobic001G006600 Sobic005G208700--Sobic001G006600 Sobic001G150650 Sobic001G150650 Sobic002G265700--Sobic001G150650 Sobic001G150600 Sobic001G150600 Sobic002G265700--Sobic001G150600 Sobic007G093000 Sobic007G093000 Sobic002G265700--Sobic007G093000 Sobic007G092900 Sobic007G092900 Sobic002G265700--Sobic007G092900 Sobic003G087200 Sobic003G087200 Sobic002G265700--Sobic003G087200 Sobic002G420700 Sobic002G420700 Sobic002G265700--Sobic002G420700 Sobic007G035000 Sobic007G035000 Sobic002G265700--Sobic007G035000 Sobic001G162700 Sobic001G162700 Sobic002G265700--Sobic001G162700 Sobic003G315500 Sobic003G315500 Sobic002G265700--Sobic003G315500 Sobic009G107600 Sobic009G107600 Sobic001G305550--Sobic009G107600 Sobic001G305550--Sobic005G208700 Sobic004G227550 Sobic004G227550 Sobic001G305550--Sobic004G227550 Sobic001G305550--Sobic002G265700 Sobic001G305550--Sobic002G205800 Sobic007G146001 Sobic007G146001 Sobic001G305550--Sobic007G146001 Sobic007G094050 Sobic007G094050 Sobic001G305550--Sobic007G094050 Sobic004G163100 Sobic004G163100 Sobic001G305550--Sobic004G163100 Sobic003G285101 Sobic003G285101 Sobic002G205800--Sobic003G285101 Sobic002G205800--Sobic005G208700 Sobic010G034700 Sobic010G034700 Sobic002G205800--Sobic010G034700 Sobic002G347850 Sobic002G347850 Sobic002G205800--Sobic002G347850 Sobic002G077700 Sobic002G077700 Sobic002G205800--Sobic002G077700 Sobic001G064400 Sobic001G064400 Sobic002G205800--Sobic001G064400 Sobic004G184600 Sobic004G184600 Sobic002G205800--Sobic004G184600 Sobic009G043800 Sobic009G043800 Sobic002G205800--Sobic009G043800 Sobic004G161501 Sobic004G161501 Sobic002G205800--Sobic004G161501 Sobic009G058200 Sobic009G058200 Sobic002G084600--Sobic009G058200 Sobic008G053900 Sobic008G053900 Sobic002G084600--Sobic008G053900 Sobic002G084600--Sobic006G225700 Sobic007G163901 Sobic007G163901 Sobic002G084600--Sobic007G163901 Sobic003G111200 Sobic003G111200 Sobic002G084600--Sobic003G111200 Sobic002G084600--Sobic009G107600 Sobic008G028800 Sobic008G028800 Sobic002G084600--Sobic008G028800 Sobic005G169400 Sobic005G169400 Sobic002G084600--Sobic005G169400 Sobic002G084600--Sobic004G227550 Sobic010G060800 Sobic010G060800 Sobic002G162450--Sobic010G060800 Sobic008G003800 Sobic008G003800 Sobic002G162450--Sobic008G003800 Sobic006G222000 Sobic006G222000 Sobic002G162450--Sobic006G222000 Sobic008G010000 Sobic008G010000 Sobic002G162450--Sobic008G010000 Sobic005G157733 Sobic005G157733 Sobic002G162450--Sobic005G157733 Sobic006G241100 Sobic006G241100 Sobic002G162450--Sobic006G241100 Sobic002G162450--Sobic004G161501 Sobic007G022000 Sobic007G022000 Sobic002G162450--Sobic007G022000 Sobic002G162450--Sobic006G225700 Sobic002G020950--Sobic002G020950 Sobic008G162600 Sobic008G162600 Sobic002G020950--Sobic008G162600 SobicK010300 SobicK010300 Sobic002G020950--SobicK010300 Sobic002G020950--Sobic001G150650 Sobic006G017500 Sobic006G017500 Sobic002G020950--Sobic006G017500 Sobic007G128800 Sobic007G128800 Sobic002G020950--Sobic007G128800 Sobic001G111432 Sobic001G111432 Sobic002G020950--Sobic001G111432 Sobic006G039000 Sobic006G039000 Sobic002G020950--Sobic006G039000 Sobic008G182700 Sobic008G182700 Sobic002G020950--Sobic008G182700 Sobic006G225700--Sobic006G241100 Sobic006G225700--Sobic006G222000 Sobic006G225700--Sobic004G227550 Sobic007G201600 Sobic007G201600 Sobic006G225700--Sobic007G201600 Sobic006G225700--Sobic002G084600 Sobic006G225700--Sobic007G094050 Sobic005G081900 Sobic005G081900 Sobic006G225700--Sobic005G081900 Sobic006G225700--Sobic008G053900 Sobic001G006600--Sobic003G087200 Sobic001G006600--Sobic001G150600 Sobic001G006600--Sobic005G169400 Sobic009G207600 Sobic009G207600 Sobic001G006600--Sobic009G207600 Sobic009G114000 Sobic009G114000 Sobic001G006600--Sobic009G114000 Sobic003G355600 Sobic003G355600 Sobic001G006600--Sobic003G355600 Sobic004G063400 Sobic004G063400 Sobic001G006600--Sobic004G063400 Sobic004G321800 Sobic004G321800 Sobic001G006600--Sobic004G321800 Sobic003G148800 Sobic003G148800 Sobic001G006600--Sobic003G148800
Octagon: transcription factors


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