Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G248600.1
Synonym Sb02g028460
Functional annotation MYB family transcription factor, putative, expressed
UniProt C5X3Y2
Pfam PF00439 PF00249
Panther DB PTHR37888 PTHR37888:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G44430 : DNA-binding bromodomain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g31454.1 : MYB family transcription factor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047459
Brachypodium KQJ90771
Barley HORVU5Hr1G073580.1 , HORVU5Hr1G073580.2 , HORVU5Hr1G073580.3 , HORVU5Hr1G073540.2
Wheat TraesCS5A02G266600 , TraesCS5A02G266600 , TraesCS5B02G266200
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G248600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic002G248600 Sobic002G248600 Sobic007G181900 Sobic007G181900 Sobic002G248600--Sobic007G181900 Sobic002G041900 Sobic002G041900 Sobic002G248600--Sobic002G041900 Sobic004G002000 Sobic004G002000 Sobic002G248600--Sobic004G002000 Sobic007G225050 Sobic007G225050 Sobic002G248600--Sobic007G225050 Sobic007G203800 Sobic007G203800 Sobic002G248600--Sobic007G203800 Sobic003G015800 Sobic003G015800 Sobic002G248600--Sobic003G015800 Sobic006G045301 Sobic006G045301 Sobic002G248600--Sobic006G045301 Sobic002G380150 Sobic002G380150 Sobic002G248600--Sobic002G380150 Sobic008G078500 Sobic008G078500 Sobic002G248600--Sobic008G078500 Sobic003G272200 Sobic003G272200 Sobic007G181900--Sobic003G272200 Sobic007G181900--Sobic002G248600 Sobic003G393400 Sobic003G393400 Sobic007G181900--Sobic003G393400 Sobic007G181900--Sobic002G041900 Sobic001G299900 Sobic001G299900 Sobic007G181900--Sobic001G299900 Sobic001G032400 Sobic001G032400 Sobic007G181900--Sobic001G032400 Sobic001G423600 Sobic001G423600 Sobic007G181900--Sobic001G423600 Sobic004G303500 Sobic004G303500 Sobic007G181900--Sobic004G303500 Sobic001G476100 Sobic001G476100 Sobic007G181900--Sobic001G476100 Sobic005G060400 Sobic005G060400 Sobic002G041900--Sobic005G060400 Sobic002G041900--Sobic002G248600 Sobic009G160300 Sobic009G160300 Sobic002G041900--Sobic009G160300 Sobic003G325000 Sobic003G325000 Sobic002G041900--Sobic003G325000 Sobic001G280300 Sobic001G280300 Sobic002G041900--Sobic001G280300 Sobic001G523932 Sobic001G523932 Sobic002G041900--Sobic001G523932 Sobic007G052500 Sobic007G052500 Sobic002G041900--Sobic007G052500 Sobic008G049300 Sobic008G049300 Sobic002G041900--Sobic008G049300 Sobic001G321700 Sobic001G321700 Sobic002G041900--Sobic001G321700 Sobic002G331200 Sobic002G331200 Sobic004G002000--Sobic002G331200 Sobic007G016300 Sobic007G016300 Sobic004G002000--Sobic007G016300 Sobic002G284300 Sobic002G284300 Sobic004G002000--Sobic002G284300 Sobic005G083866 Sobic005G083866 Sobic004G002000--Sobic005G083866 Sobic006G181150 Sobic006G181150 Sobic004G002000--Sobic006G181150 Sobic007G105800 Sobic007G105800 Sobic004G002000--Sobic007G105800 Sobic008G152100 Sobic008G152100 Sobic004G002000--Sobic008G152100 Sobic008G175600 Sobic008G175600 Sobic004G002000--Sobic008G175600 Sobic001G214400 Sobic001G214400 Sobic004G002000--Sobic001G214400 Sobic007G225050--Sobic006G045301 Sobic007G225050--Sobic007G203800 Sobic007G225050--Sobic003G015800 Sobic007G225050--Sobic008G078500 Sobic007G203850 Sobic007G203850 Sobic007G225050--Sobic007G203850 Sobic004G118300 Sobic004G118300 Sobic007G225050--Sobic004G118300 Sobic007G081400 Sobic007G081400 Sobic007G225050--Sobic007G081400 Sobic007G225050--Sobic002G380150 Sobic003G305250 Sobic003G305250 Sobic007G225050--Sobic003G305250 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic007G203800--Sobic002G171901 Sobic004G084600 Sobic004G084600 Sobic007G203800--Sobic004G084600 Sobic009G192400 Sobic009G192400 Sobic007G203800--Sobic009G192400 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic007G203800--Sobic006G041200 Sobic007G203800--Sobic007G225050 Sobic007G206400 Sobic007G206400 Sobic007G203800--Sobic007G206400 Sobic003G336550 Sobic003G336550 Sobic007G203800--Sobic003G336550 Sobic006G021100 Sobic006G021100 Sobic007G203800--Sobic006G021100 Sobic008G085800 Sobic008G085800 Sobic007G203800--Sobic008G085800 Sobic003G015800--Sobic006G045301 Sobic003G015800--Sobic007G225050 Sobic003G015800--Sobic007G203850 Sobic002G008701 Sobic002G008701 Sobic003G015800--Sobic002G008701 Sobic003G015800--Sobic002G380150 Sobic003G015800--Sobic008G078500 Sobic003G015800--Sobic007G016300 Sobic003G015800--Sobic005G083866 Sobic001G311700 Sobic001G311700 Sobic003G015800--Sobic001G311700 Sobic006G045301--Sobic007G225050 Sobic006G045301--Sobic003G015800 Sobic006G045301--Sobic007G203850 Sobic006G045301--Sobic001G311700 Sobic006G045301--Sobic002G380150 Sobic008G086300 Sobic008G086300 Sobic006G045301--Sobic008G086300 Sobic006G045301--Sobic007G081400 Sobic006G045301--Sobic008G078500 Sobic006G045301--Sobic005G083866 Sobic002G380150--Sobic007G081400 Sobic002G380150--Sobic006G045301 Sobic001G150100 Sobic001G150100 Sobic002G380150--Sobic001G150100 Sobic002G030001 Sobic002G030001 Sobic002G380150--Sobic002G030001 Sobic002G142350 Sobic002G142350 Sobic002G380150--Sobic002G142350 Sobic002G380150--Sobic007G203850 Sobic007G038200 Sobic007G038200 Sobic002G380150--Sobic007G038200 Sobic002G380150--Sobic007G225050 Sobic006G119100 Sobic006G119100 Sobic002G380150--Sobic006G119100 Sobic008G078500--Sobic007G225050 Sobic007G174000 Sobic007G174000 Sobic008G078500--Sobic007G174000 Sobic008G078500--Sobic007G203850 Sobic008G078500--Sobic006G045301 Sobic003G241600 Sobic003G241600 Sobic008G078500--Sobic003G241600 Sobic004G223350 Sobic004G223350 Sobic008G078500--Sobic004G223350 Sobic008G078500--Sobic002G380150 Sobic001G093732 Sobic001G093732 Sobic008G078500--Sobic001G093732 Sobic006G154900 Sobic006G154900 Sobic008G078500--Sobic006G154900
Octagon: transcription factors


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