Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G002000.2
Synonym Sb04g000350
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RLA1
Pfam -
Panther DB PTHR37728
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g04140.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a035091
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G331200 - -
2 Sobic.007G016300 - -
3 Sobic.002G284300 - -
4 Sobic.005G083866 - -
5 Sobic.006G181150 - -
6 Sobic.007G105800 AIR12, putative, expressed -
7 Sobic.008G152100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
8 Sobic.008G175600 RING-H2 finger protein ATL5D, putative, expressed -
9 Sobic.001G214400 - -
10 Sobic.003G015800 endoglucanase precursor, putative, expressed -
11 Sobic.004G211501 - -
12 Sobic.001G020600 cyclase/dehydrase family protein, expressed -
13 Sobic.009G151500 cinnamoyl-CoA reductase-related, putative, expressed -
14 Sobic.004G200000 expressed protein -
15 Sobic.008G112400 - -
16 Sobic.008G173700 cyclic nucleotide-gated ion channel, putative, expressed K05391: cyclic nucleotide gated channel, plant
17 Sobic.008G166250 - -
18 Sobic.007G203850 - -
19 Sobic.004G177400 T-complex protein 11, putative, expressed -
20 Sobic.002G008701 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G002000 Sobic004G002000 Sobic002G331200 Sobic002G331200 Sobic004G002000--Sobic002G331200 Sobic007G016300 Sobic007G016300 Sobic004G002000--Sobic007G016300 Sobic002G284300 Sobic002G284300 Sobic004G002000--Sobic002G284300 Sobic005G083866 Sobic005G083866 Sobic004G002000--Sobic005G083866 Sobic006G181150 Sobic006G181150 Sobic004G002000--Sobic006G181150 Sobic007G105800 Sobic007G105800 Sobic004G002000--Sobic007G105800 Sobic008G152100 Sobic008G152100 Sobic004G002000--Sobic008G152100 Sobic008G175600 Sobic008G175600 Sobic004G002000--Sobic008G175600 Sobic001G214400 Sobic001G214400 Sobic004G002000--Sobic001G214400 Sobic002G331200--Sobic007G016300 Sobic002G331200--Sobic005G083866 Sobic002G331200--Sobic002G284300 Sobic002G331200--Sobic001G214400 Sobic004G200000 Sobic004G200000 Sobic002G331200--Sobic004G200000 Sobic008G112400 Sobic008G112400 Sobic002G331200--Sobic008G112400 Sobic009G094000 Sobic009G094000 Sobic002G331200--Sobic009G094000 Sobic009G151500 Sobic009G151500 Sobic002G331200--Sobic009G151500 Sobic003G043650 Sobic003G043650 Sobic002G331200--Sobic003G043650 Sobic007G016300--Sobic004G200000 Sobic007G016300--Sobic002G331200 Sobic007G016300--Sobic005G083866 Sobic009G082500 Sobic009G082500 Sobic007G016300--Sobic009G082500 Sobic007G016300--Sobic003G043650 Sobic007G016300--Sobic008G112400 Sobic002G008701 Sobic002G008701 Sobic007G016300--Sobic002G008701 Sobic004G260700 Sobic004G260700 Sobic007G016300--Sobic004G260700 Sobic001G345366 Sobic001G345366 Sobic007G016300--Sobic001G345366 Sobic002G284300--Sobic002G331200 Sobic002G284300--Sobic001G214400 Sobic008G173700 Sobic008G173700 Sobic002G284300--Sobic008G173700 Sobic004G177400 Sobic004G177400 Sobic002G284300--Sobic004G177400 Sobic003G101600 Sobic003G101600 Sobic002G284300--Sobic003G101600 Sobic008G166250 Sobic008G166250 Sobic002G284300--Sobic008G166250 Sobic002G284300--Sobic009G094000 Sobic002G284300--Sobic007G016300 Sobic002G284300--Sobic008G112400 Sobic005G083866--Sobic003G043650 Sobic005G083866--Sobic004G200000 Sobic005G083866--Sobic007G016300 Sobic005G083866--Sobic002G331200 Sobic001G311700 Sobic001G311700 Sobic005G083866--Sobic001G311700 Sobic002G030001 Sobic002G030001 Sobic005G083866--Sobic002G030001 Sobic002G018133 Sobic002G018133 Sobic005G083866--Sobic002G018133 Sobic007G081400 Sobic007G081400 Sobic005G083866--Sobic007G081400 Sobic010G041500 Sobic010G041500 Sobic005G083866--Sobic010G041500 Sobic006G181150--Sobic008G152100 Sobic005G077532 Sobic005G077532 Sobic006G181150--Sobic005G077532 Sobic009G250000 Sobic009G250000 Sobic006G181150--Sobic009G250000 Sobic001G541166 Sobic001G541166 Sobic006G181150--Sobic001G541166 Sobic006G181150--Sobic008G173700 Sobic006G181150--Sobic007G016300 Sobic003G385800 Sobic003G385800 Sobic006G181150--Sobic003G385800 Sobic004G302550 Sobic004G302550 Sobic006G181150--Sobic004G302550 Sobic006G181150--Sobic002G331200 Sobic004G211501 Sobic004G211501 Sobic007G105800--Sobic004G211501 Sobic001G520700 Sobic001G520700 Sobic007G105800--Sobic001G520700 Sobic001G493800 Sobic001G493800 Sobic007G105800--Sobic001G493800 Sobic005G042700 Sobic005G042700 Sobic007G105800--Sobic005G042700 Sobic007G161450 Sobic007G161450 Sobic007G105800--Sobic007G161450 Sobic006G162300 Sobic006G162300 Sobic007G105800--Sobic006G162300 Sobic008G139900 Sobic008G139900 Sobic007G105800--Sobic008G139900 Sobic004G001900 Sobic004G001900 Sobic007G105800--Sobic004G001900 Sobic007G105800--Sobic004G177400 Sobic008G152100--Sobic005G077532 Sobic008G152100--Sobic003G385800 Sobic008G152100--Sobic001G541166 Sobic010G009532 Sobic010G009532 Sobic008G152100--Sobic010G009532 Sobic008G152100--Sobic006G181150 Sobic005G091400 Sobic005G091400 Sobic008G152100--Sobic005G091400 Sobic004G230500 Sobic004G230500 Sobic008G152100--Sobic004G230500 Sobic007G045800 Sobic007G045800 Sobic008G152100--Sobic007G045800 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic008G152100--Sobic002G165401 Sobic009G174600 Sobic009G174600 Sobic008G175600--Sobic009G174600 Sobic008G175600--Sobic008G112400 Sobic008G175600--Sobic008G166250 Sobic002G065300 Sobic002G065300 Sobic008G175600--Sobic002G065300 Sobic004G269500 Sobic004G269500 Sobic008G175600--Sobic004G269500 Sobic002G426650 Sobic002G426650 Sobic008G175600--Sobic002G426650 Sobic008G175600--Sobic003G101600 Sobic008G175600--Sobic002G008701 Sobic008G175600--Sobic002G284300 Sobic001G214400--Sobic009G151500 Sobic001G214400--Sobic002G331200 Sobic010G001700 Sobic010G001700 Sobic001G214400--Sobic010G001700 Sobic002G138200 Sobic002G138200 Sobic001G214400--Sobic002G138200 Sobic001G214400--Sobic004G200000 Sobic001G214400--Sobic002G284300 Sobic001G214400--Sobic010G009532 Sobic001G214400--Sobic003G043650 Sobic001G214400--Sobic002G018133
Octagon: transcription factors


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