Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G102401.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RI49
Pfam PF03018
Panther DB PTHR21495 PTHR21495:SF54
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G65870 : Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g10850.1 : dirigent, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU4Hr1G016600.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G187701 - -
2 Sobic.003G168700 "oxidative phosphorylation, ATP production, stroma side of thylakoid membranes"(PubMedID : 8481382)@cytochrome b6, putative, expressed K02635: cytochrome b6
3 Sobic.010G123650 - -
4 Sobic.004G215650 - -
5 Sobic.001G087850 - -
6 Sobic.003G404050 - -
7 Sobic.006G171801 - -
8 Sobic.003G396050 - -
9 Sobic.003G123950 - -
10 Sobic.002G042700 - -
11 Sobic.001G436450 - -
12 Sobic.003G414200 Zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
13 Sobic.003G112100 expansin precursor, putative, expressed -
14 Sobic.005G194400 ribulose bisphosphate carboxylase large chain precursor, putative, expressed K01601: ribulose-bisphosphate carboxylase large chain
15 Sobic.008G116800 expressed protein -
16 Sobic.001G504300 - -
17 Sobic.004G207733 - -
18 Sobic.008G127000 gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed -
19 Sobic.002G147550 - -
20 Sobic.008G156800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G102401 Sobic005G102401 Sobic004G187701 Sobic004G187701 Sobic005G102401--Sobic004G187701 Sobic003G168700 Sobic003G168700 Sobic005G102401--Sobic003G168700 Sobic010G123650 Sobic010G123650 Sobic005G102401--Sobic010G123650 Sobic004G215650 Sobic004G215650 Sobic005G102401--Sobic004G215650 Sobic001G087850 Sobic001G087850 Sobic005G102401--Sobic001G087850 Sobic003G404050 Sobic003G404050 Sobic005G102401--Sobic003G404050 Sobic006G171801 Sobic006G171801 Sobic005G102401--Sobic006G171801 Sobic003G396050 Sobic003G396050 Sobic005G102401--Sobic003G396050 Sobic003G123950 Sobic003G123950 Sobic005G102401--Sobic003G123950 Sobic001G436450 Sobic001G436450 Sobic004G187701--Sobic001G436450 Sobic009G079400 Sobic009G079400 Sobic004G187701--Sobic009G079400 Sobic004G187701--Sobic001G087850 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic004G187701--Sobic006G176900 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic004G187701--Sobic002G147550 Sobic004G207733 Sobic004G207733 Sobic004G187701--Sobic004G207733 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic004G187701--Sobic004G127733 Sobic003G244250 Sobic003G244250 Sobic004G187701--Sobic003G244250 Sobic004G187701--Sobic010G123650 Sobic002G042700 Sobic002G042700 Sobic003G168700--Sobic002G042700 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic003G168700--Sobic003G112100 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic003G168700--Sobic003G394701 Sobic003G168700--Sobic010G123650 Sobic003G168700--Sobic003G404050 Sobic003G168700--Sobic004G215650 Sobic008G156800 Sobic008G156800 Sobic003G168700--Sobic008G156800 Sobic003G029150 Sobic003G029150 Sobic003G168700--Sobic003G029150 Sobic004G129400 Sobic004G129400 Sobic003G168700--Sobic004G129400 Sobic010G123650--Sobic001G087850 Sobic010G123650--Sobic004G207733 Sobic010G123650--Sobic003G404050 Sobic010G123650--Sobic002G147550 Sobic010G123650--Sobic003G112100 Sobic010G123650--Sobic001G436450 Sobic010G123650--Sobic003G168700 Sobic010G123650--Sobic006G176900 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic010G123650--Sobic001G045900 Sobic007G163200 Sobic007G163200 Sobic004G215650--Sobic007G163200 Sobic001G504300 Sobic001G504300 Sobic004G215650--Sobic001G504300 Sobic003G414200 Sobic003G414200 Sobic004G215650--Sobic003G414200 Sobic004G215650--Sobic003G168700 Sobic004G215650--Sobic010G123650 Sobic004G194600 Sobic004G194600 Sobic004G215650--Sobic004G194600 Sobic004G215650--Sobic003G123950 Sobic001G045100 Sobic001G045100 Sobic004G215650--Sobic001G045100 Sobic004G215650--Sobic003G112100 Sobic001G087850--Sobic010G123650 Sobic001G087850--Sobic004G207733 Sobic001G087850--Sobic001G436450 Sobic001G087850--Sobic002G147550 Sobic001G087850--Sobic006G176900 Sobic001G087850--Sobic003G404050 Sobic001G087850--Sobic001G045900 Sobic001G087850--Sobic004G187701 Sobic006G065000 Sobic006G065000 Sobic001G087850--Sobic006G065000 Sobic003G404050--Sobic001G436450 Sobic003G406850 Sobic003G406850 Sobic003G404050--Sobic003G406850 Sobic010G011100 Sobic010G011100 Sobic003G404050--Sobic010G011100 Sobic003G404050--Sobic010G123650 Sobic003G404050--Sobic002G147550 Sobic003G404050--Sobic002G042700 Sobic008G116800 Sobic008G116800 Sobic003G404050--Sobic008G116800 Sobic001G249800 Sobic001G249800 Sobic003G404050--Sobic001G249800 Sobic003G404050--Sobic001G087850 Sobic010G157600 Sobic010G157600 Sobic006G171801--Sobic010G157600 Sobic002G286500 Sobic002G286500 Sobic006G171801--Sobic002G286500 Sobic006G171801--Sobic003G404050 Sobic010G028366 Sobic010G028366 Sobic006G171801--Sobic010G028366 Sobic006G171801--Sobic010G123650 Sobic006G171801--Sobic001G087850 Sobic006G171801--Sobic001G436450 Sobic009G184450 Sobic009G184450 Sobic006G171801--Sobic009G184450 Sobic002G136500 Sobic002G136500 Sobic006G171801--Sobic002G136500 Sobic003G396050--Sobic003G123950 Sobic010G053700 Sobic010G053700 Sobic003G396050--Sobic010G053700 Sobic006G033601 Sobic006G033601 Sobic003G396050--Sobic006G033601 Sobic003G396050--Sobic008G156800 Sobic002G170000 Sobic002G170000 Sobic003G396050--Sobic002G170000 Sobic001G062066 Sobic001G062066 Sobic003G396050--Sobic001G062066 Sobic004G143550 Sobic004G143550 Sobic003G396050--Sobic004G143550 Sobic003G396050--Sobic008G116800 Sobic003G396050--Sobic003G112100 Sobic003G123950--Sobic008G156800 Sobic003G123950--Sobic003G396050 Sobic003G123950--Sobic010G123650 Sobic003G123950--Sobic003G168700 Sobic003G123950--Sobic003G112100 Sobic003G123950--Sobic004G215650 Sobic003G123950--Sobic002G170000 Sobic003G123950--Sobic004G129400 Sobic003G123950--Sobic010G053700
Octagon: transcription factors


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