Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G372100.1
Synonym Sb02g039060
Functional annotation nodulation-signaling pathway 1 protein, putative, expressed
UniProt C5XDZ4
Pfam PF03514
Panther DB PTHR31636 PTHR31636:SF40
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G13840 : GRAS family transcription factor
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g29480.1 : nodulation-signaling pathway 1 protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a048733 , Zm00025a052167
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.009G019400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G372100 Sobic002G372100 Sobic009G126200 Sobic009G126200 Sobic002G372100--Sobic009G126200 Sobic005G159400 Sobic005G159400 Sobic002G372100--Sobic005G159400 Sobic009G193600 Sobic009G193600 Sobic002G372100--Sobic009G193600 Sobic004G209450 Sobic004G209450 Sobic002G372100--Sobic004G209450 Sobic003G089500 Sobic003G089500 Sobic002G372100--Sobic003G089500 Sobic002G172300 Sobic002G172300 Sobic002G372100--Sobic002G172300 Sobic005G228250 Sobic005G228250 Sobic002G372100--Sobic005G228250 Sobic003G229900 Sobic003G229900 Sobic002G372100--Sobic003G229900 Sobic001G242400 Sobic001G242400 Sobic002G372100--Sobic001G242400 Sobic009G126200--Sobic005G228250 Sobic006G142925 Sobic006G142925 Sobic009G126200--Sobic006G142925 Sobic009G019400 Sobic009G019400 Sobic009G126200--Sobic009G019400 Sobic002G069300 Sobic002G069300 Sobic009G126200--Sobic002G069300 Sobic003G281000 Sobic003G281000 Sobic009G126200--Sobic003G281000 Sobic010G143666 Sobic010G143666 Sobic009G126200--Sobic010G143666 Sobic002G382200 Sobic002G382200 Sobic009G126200--Sobic002G382200 Sobic009G239400 Sobic009G239400 Sobic009G126200--Sobic009G239400 Sobic005G133750 Sobic005G133750 Sobic009G126200--Sobic005G133750 Sobic005G159400--Sobic002G372100 Sobic005G159400--Sobic004G209450 Sobic008G161900 Sobic008G161900 Sobic005G159400--Sobic008G161900 Sobic005G159400--Sobic003G089500 Sobic005G159400--Sobic009G126200 Sobic001G309666 Sobic001G309666 Sobic005G159400--Sobic001G309666 Sobic003G186132 Sobic003G186132 Sobic005G159400--Sobic003G186132 Sobic005G159400--Sobic002G172300 Sobic010G215201 Sobic010G215201 Sobic005G159400--Sobic010G215201 Sobic002G015950 Sobic002G015950 Sobic009G193600--Sobic002G015950 Sobic006G037500 Sobic006G037500 Sobic009G193600--Sobic006G037500 Sobic004G071850 Sobic004G071850 Sobic009G193600--Sobic004G071850 Sobic005G205100 Sobic005G205100 Sobic009G193600--Sobic005G205100 Sobic001G273950 Sobic001G273950 Sobic009G193600--Sobic001G273950 Sobic003G260050 Sobic003G260050 Sobic009G193600--Sobic003G260050 Sobic003G111700 Sobic003G111700 Sobic009G193600--Sobic003G111700 Sobic009G043900 Sobic009G043900 Sobic009G193600--Sobic009G043900 Sobic006G049000 Sobic006G049000 Sobic009G193600--Sobic006G049000 Sobic004G209450--Sobic009G126200 Sobic004G209450--Sobic002G372100 Sobic004G209450--Sobic005G159400 Sobic004G209450--Sobic005G228250 Sobic006G015000 Sobic006G015000 Sobic004G209450--Sobic006G015000 Sobic009G248600 Sobic009G248600 Sobic004G209450--Sobic009G248600 Sobic007G022100 Sobic007G022100 Sobic004G209450--Sobic007G022100 Sobic004G209450--Sobic003G089500 Sobic004G209450--Sobic005G133750 Sobic008G030801 Sobic008G030801 Sobic003G089500--Sobic008G030801 Sobic002G055000 Sobic002G055000 Sobic003G089500--Sobic002G055000 Sobic002G266700 Sobic002G266700 Sobic003G089500--Sobic002G266700 Sobic001G297900 Sobic001G297900 Sobic003G089500--Sobic001G297900 Sobic001G480900 Sobic001G480900 Sobic003G089500--Sobic001G480900 Sobic003G089500--Sobic010G215201 Sobic010G011500 Sobic010G011500 Sobic003G089500--Sobic010G011500 Sobic006G049633 Sobic006G049633 Sobic003G089500--Sobic006G049633 Sobic001G071500 Sobic001G071500 Sobic003G089500--Sobic001G071500 Sobic002G054800 Sobic002G054800 Sobic002G172300--Sobic002G054800 Sobic002G172300--Sobic001G071500 Sobic002G172300--Sobic008G030801 Sobic002G172300--Sobic010G215201 Sobic005G073300 Sobic005G073300 Sobic002G172300--Sobic005G073300 Sobic002G132201 Sobic002G132201 Sobic002G172300--Sobic002G132201 Sobic002G240200 Sobic002G240200 Sobic002G172300--Sobic002G240200 Sobic001G371650 Sobic001G371650 Sobic002G172300--Sobic001G371650 Sobic001G421100 Sobic001G421100 Sobic002G172300--Sobic001G421100 Sobic005G228250--Sobic009G126200 Sobic008G004500 Sobic008G004500 Sobic005G228250--Sobic008G004500 Sobic005G228250--Sobic005G133750 Sobic005G228250--Sobic002G382200 Sobic005G228250--Sobic010G143666 Sobic002G202050 Sobic002G202050 Sobic005G228250--Sobic002G202050 Sobic003G229900--Sobic006G049633 Sobic003G229900--Sobic002G055000 Sobic003G229900--Sobic010G011500 Sobic003G229900--Sobic001G480900 Sobic003G229900--Sobic002G266700 Sobic004G296750 Sobic004G296750 Sobic003G229900--Sobic004G296750 Sobic008G061900 Sobic008G061900 Sobic003G229900--Sobic008G061900 Sobic007G007100 Sobic007G007100 Sobic003G229900--Sobic007G007100 Sobic003G229900--Sobic009G019400 Sobic001G242400--Sobic003G229900 Sobic001G242400--Sobic006G049633 Sobic001G242400--Sobic001G273950 Sobic006G141200 Sobic006G141200 Sobic001G242400--Sobic006G141200 Sobic001G242400--Sobic008G030801 Sobic001G242400--Sobic007G007100 Sobic006G161200 Sobic006G161200 Sobic001G242400--Sobic006G161200 Sobic001G242400--Sobic010G215201 Sobic004G221800 Sobic004G221800 Sobic001G242400--Sobic004G221800
Octagon: transcription factors


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