Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G384150.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W7G5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g43430.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G312100 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
2 Sobic.003G326100 nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase, putative, expressed -
3 Sobic.002G223100 annexin, putative, expressed -
4 Sobic.002G012350 - -
5 Sobic.002G267300 expressed protein -
6 Sobic.007G129900 expressed protein -
7 Sobic.004G290400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
8 Sobic.007G069450 - -
9 Sobic.002G401301 - -
10 Sobic.004G274000 STE_MEK_ste7_MAP2K.4 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed -
11 Sobic.006G077900 cysteine synthase, putative, expressed K01738: cysteine synthase
12 Sobic.007G202700 exo70 exocyst complex subunit, putative, expressed -
13 Sobic.002G188800 anthocyanin 3-O-beta-glucosyltransferase, putative, expressed -
14 Sobic.002G044900 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.009G239000 OsMADS78 - MADS-box family gene with M-alpha type-box, expressed -
16 Sobic.008G053000 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
17 Sobic.006G077100 serine/threonine-protein kinase receptor precursor, putative, expressed -
18 Sobic.007G035100 cyclin, putative, expressed K05868: G2/mitotic-specific cyclin-B1
19 Sobic.010G111700 - -
20 Sobic.009G053001 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G384150 Sobic002G384150 Sobic002G312100 Sobic002G312100 Sobic002G384150--Sobic002G312100 Sobic003G326100 Sobic003G326100 Sobic002G384150--Sobic003G326100 Sobic002G223100 Sobic002G223100 Sobic002G384150--Sobic002G223100 Sobic002G012350 Sobic002G012350 Sobic002G384150--Sobic002G012350 Sobic002G267300 Sobic002G267300 Sobic002G384150--Sobic002G267300 Sobic007G129900 Sobic007G129900 Sobic002G384150--Sobic007G129900 Sobic004G290400 Sobic004G290400 Sobic002G384150--Sobic004G290400 Sobic007G069450 Sobic007G069450 Sobic002G384150--Sobic007G069450 Sobic002G401301 Sobic002G401301 Sobic002G384150--Sobic002G401301 Sobic007G120600 Sobic007G120600 Sobic002G312100--Sobic007G120600 Sobic010G146350 Sobic010G146350 Sobic002G312100--Sobic010G146350 Sobic001G060001 Sobic001G060001 Sobic002G312100--Sobic001G060001 Sobic003G021401 Sobic003G021401 Sobic002G312100--Sobic003G021401 Sobic004G052700 Sobic004G052700 Sobic002G312100--Sobic004G052700 Sobic008G096401 Sobic008G096401 Sobic002G312100--Sobic008G096401 Sobic005G207600 Sobic005G207600 Sobic002G312100--Sobic005G207600 Sobic001G190600 Sobic001G190600 Sobic002G312100--Sobic001G190600 Sobic010G228200 Sobic010G228200 Sobic002G312100--Sobic010G228200 Sobic002G188800 Sobic002G188800 Sobic003G326100--Sobic002G188800 Sobic003G326100--Sobic001G060001 Sobic004G181100 Sobic004G181100 Sobic003G326100--Sobic004G181100 Sobic003G326100--Sobic008G096401 Sobic003G326100--Sobic004G052700 Sobic003G326100--Sobic007G120600 Sobic003G326100--Sobic002G401301 Sobic006G042800 Sobic006G042800 Sobic003G326100--Sobic006G042800 Sobic002G159400 Sobic002G159400 Sobic003G326100--Sobic002G159400 Sobic004G274000 Sobic004G274000 Sobic002G223100--Sobic004G274000 Sobic002G223100--Sobic002G401301 Sobic010G111700 Sobic010G111700 Sobic002G223100--Sobic010G111700 Sobic007G035100 Sobic007G035100 Sobic002G223100--Sobic007G035100 Sobic002G008000 Sobic002G008000 Sobic002G223100--Sobic002G008000 Sobic004G286351 Sobic004G286351 Sobic002G223100--Sobic004G286351 Sobic002G223100--Sobic007G069450 Sobic009G053001 Sobic009G053001 Sobic002G223100--Sobic009G053001 Sobic001G493600 Sobic001G493600 Sobic002G223100--Sobic001G493600 Sobic002G012350--Sobic004G286351 Sobic002G012350--Sobic001G493600 Sobic010G172666 Sobic010G172666 Sobic002G012350--Sobic010G172666 Sobic004G303150 Sobic004G303150 Sobic002G012350--Sobic004G303150 Sobic002G012350--Sobic007G069450 Sobic002G012350--Sobic010G111700 Sobic009G239000 Sobic009G239000 Sobic002G012350--Sobic009G239000 Sobic002G012350--Sobic007G035100 Sobic002G012350--Sobic009G053001 Sobic001G022000 Sobic001G022000 Sobic002G267300--Sobic001G022000 Sobic008G024000 Sobic008G024000 Sobic002G267300--Sobic008G024000 Sobic005G205000 Sobic005G205000 Sobic002G267300--Sobic005G205000 Sobic001G482500 Sobic001G482500 Sobic002G267300--Sobic001G482500 Sobic007G090418 Sobic007G090418 Sobic002G267300--Sobic007G090418 Sobic002G384800 Sobic002G384800 Sobic002G267300--Sobic002G384800 Sobic007G193900 Sobic007G193900 Sobic002G267300--Sobic007G193900 Sobic007G193500 Sobic007G193500 Sobic002G267300--Sobic007G193500 Sobic002G067050 Sobic002G067050 Sobic002G267300--Sobic002G067050 Sobic003G432600 Sobic003G432600 Sobic007G129900--Sobic003G432600 Sobic003G008100 Sobic003G008100 Sobic007G129900--Sobic003G008100 Sobic007G129900--Sobic010G228200 Sobic007G129900--Sobic007G120600 Sobic007G129900--Sobic004G052700 Sobic007G129900--Sobic008G096401 Sobic007G129900--Sobic010G146350 Sobic007G129900--Sobic001G060001 Sobic007G129900--Sobic005G207600 Sobic002G044900 Sobic002G044900 Sobic004G290400--Sobic002G044900 Sobic009G067200 Sobic009G067200 Sobic004G290400--Sobic009G067200 Sobic006G088500 Sobic006G088500 Sobic004G290400--Sobic006G088500 Sobic004G290400--Sobic002G401301 Sobic004G290400--Sobic002G312100 Sobic004G290400--Sobic003G326100 Sobic008G053000 Sobic008G053000 Sobic004G290400--Sobic008G053000 Sobic007G007650 Sobic007G007650 Sobic004G290400--Sobic007G007650 Sobic004G290400--Sobic004G274000 Sobic007G069450--Sobic010G111700 Sobic007G069450--Sobic007G035100 Sobic007G069450--Sobic004G286351 Sobic007G069450--Sobic004G274000 Sobic007G069450--Sobic001G493600 Sobic007G069450--Sobic010G172666 Sobic007G069450--Sobic004G181100 Sobic007G069450--Sobic002G159400 Sobic007G069450--Sobic006G042800 Sobic002G401301--Sobic004G274000 Sobic002G401301--Sobic002G188800 Sobic002G401301--Sobic004G181100 Sobic010G267651 Sobic010G267651 Sobic002G401301--Sobic010G267651 Sobic002G401301--Sobic006G042800 Sobic002G401301--Sobic002G159400 Sobic002G401301--Sobic008G096401 Sobic002G401301--Sobic004G052700 Sobic002G401301--Sobic007G035100
Octagon: transcription factors


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