Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G001550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VV86
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G088401 - -
2 Sobic.005G098200 TKL_IRAK_CR4L.7 - The CR4L subfamily has homology with Crinkly4, expressed -
3 Sobic.007G072400 phosphoribosyl transferase, putative, expressed -
4 Sobic.008G098098 - -
5 Sobic.008G119200 - -
6 Sobic.007G016000 - -
7 Sobic.004G180600 expressed protein K18172: COX assembly mitochondrial protein 2
8 Sobic.005G231800 tropinone reductase, putative, expressed K08081: tropinone reductase I
9 Sobic.003G173032 - -
10 Sobic.006G212600 M16 domain containing zinc peptidase, putative, expressed -
11 Sobic.008G023000 expressed protein -
12 Sobic.001G527400 - -
13 Sobic.008G002100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein -
14 Sobic.006G273500 expressed protein -
15 Sobic.009G005800 formin-like protein 6 precursor, putative, expressed -
16 Sobic.004G226300 expressed protein -
17 Sobic.005G209800 nodulin, putative, expressed -
18 Sobic.007G183000 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
19 Sobic.002G048250 - -
20 Sobic.006G171000 Highest expression level in primordial inflorescence(PubMedID : 27501690)@OsSPL7 - SBP-box gene family member, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G001550 Sobic003G001550 Sobic009G088401 Sobic009G088401 Sobic003G001550--Sobic009G088401 Sobic005G098200 Sobic005G098200 Sobic003G001550--Sobic005G098200 Sobic007G072400 Sobic007G072400 Sobic003G001550--Sobic007G072400 Sobic008G098098 Sobic008G098098 Sobic003G001550--Sobic008G098098 Sobic008G119200 Sobic008G119200 Sobic003G001550--Sobic008G119200 Sobic007G016000 Sobic007G016000 Sobic003G001550--Sobic007G016000 Sobic004G180600 Sobic004G180600 Sobic003G001550--Sobic004G180600 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic003G001550--Sobic005G231800 Sobic003G173032 Sobic003G173032 Sobic003G001550--Sobic003G173032 Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic009G088401--Sobic008G023000 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic009G088401--Sobic005G209800 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic009G088401--Sobic006G171000 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic009G088401--Sobic008G002100 Sobic009G088401--Sobic003G173032 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic009G088401--Sobic001G527400 Sobic009G088401--Sobic007G072400 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic009G088401--Sobic004G226300 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic009G088401--Sobic007G183000 Sobic003G104900 Sobic003G104900 Sobic005G098200--Sobic003G104900 Sobic001G483700 Sobic001G483700 Sobic005G098200--Sobic001G483700 Sobic005G098200--Sobic005G209800 Sobic005G098200--Sobic005G231800 Sobic005G098200--Sobic008G002100 Sobic003G142900 Sobic003G142900 Sobic005G098200--Sobic003G142900 Sobic005G098200--Sobic008G023000 Sobic005G098200--Sobic004G226300 Sobic005G098200--Sobic001G527400 Sobic007G072400--Sobic001G527400 Sobic007G072400--Sobic006G171000 Sobic007G072400--Sobic008G002100 Sobic007G072400--Sobic005G209800 Sobic007G072400--Sobic007G183000 Sobic007G072400--Sobic008G023000 Sobic007G072400--Sobic004G226300 Sobic007G072400--Sobic003G173032 Sobic001G137200 Sobic001G137200 Sobic007G072400--Sobic001G137200 Sobic008G098098--Sobic008G119200 Sobic001G000900 Sobic001G000900 Sobic008G098098--Sobic001G000900 Sobic006G273500 Sobic006G273500 Sobic008G098098--Sobic006G273500 Sobic009G223700 Sobic009G223700 Sobic008G098098--Sobic009G223700 Sobic008G098098--Sobic005G231800 Sobic008G098098--Sobic004G226300 Sobic008G098098--Sobic007G183000 Sobic008G098098--Sobic009G088401 Sobic008G098098--Sobic001G527400 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic008G119200--Sobic002G048250 Sobic008G119200--Sobic007G183000 Sobic008G119200--Sobic004G226300 Sobic008G119200--Sobic005G231800 Sobic008G119200--Sobic001G527400 Sobic002G285525 Sobic002G285525 Sobic008G119200--Sobic002G285525 Sobic008G119200--Sobic008G023000 Sobic008G119200--Sobic008G002100 Sobic004G347866 Sobic004G347866 Sobic008G119200--Sobic004G347866 Sobic007G016000--Sobic008G098098 Sobic007G016000--Sobic009G088401 Sobic007G016000--Sobic008G119200 Sobic007G016000--Sobic004G180600 Sobic007G016000--Sobic007G072400 Sobic010G152700 Sobic010G152700 Sobic007G016000--Sobic010G152700 Sobic007G016000--Sobic003G173032 Sobic007G016000--Sobic006G171000 Sobic007G016000--Sobic008G023000 Sobic004G180600--Sobic006G273500 Sobic004G180600--Sobic008G098098 Sobic004G180600--Sobic009G088401 Sobic004G180600--Sobic007G016000 Sobic004G180600--Sobic008G119200 Sobic004G107400 Sobic004G107400 Sobic004G180600--Sobic004G107400 Sobic003G407500 Sobic003G407500 Sobic004G180600--Sobic003G407500 Sobic004G180600--Sobic007G072400 Sobic004G180600--Sobic005G209800 Sobic005G231800--Sobic008G023000 Sobic005G231800--Sobic001G527400 Sobic005G231800--Sobic008G002100 Sobic005G231800--Sobic007G183000 Sobic005G231800--Sobic004G226300 Sobic005G231800--Sobic005G209800 Sobic005G231800--Sobic002G048250 Sobic005G231800--Sobic003G173032 Sobic005G231800--Sobic006G171000 Sobic003G173032--Sobic008G023000 Sobic003G173032--Sobic008G002100 Sobic003G173032--Sobic001G527400 Sobic003G173032--Sobic007G183000 Sobic003G173032--Sobic004G226300 Sobic003G173032--Sobic005G209800 Sobic003G173032--Sobic005G231800 Sobic003G173032--Sobic002G048250 Sobic003G173032--Sobic006G171000
Octagon: transcription factors


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