Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G050500.1
Synonym Sb03g004400
Functional annotation -
UniProt C5XND9
Pfam PF00170
Panther DB PTHR22952 PTHR22952:SF157
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003700DNA-binding transcription factor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g14910.1 : bZIP transcription factor family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a007483
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G100000 expressed protein -
2 Sobic.006G150800 gibberellin 2-beta-dioxygenase 7, putative, expressed K04125: gibberellin 2beta-dioxygenase
3 Sobic.002G109200 - -
4 Sobic.003G154100 gibberellin 2-oxidase, putative, expressed K04125: gibberellin 2beta-dioxygenase
5 Sobic.010G133566 - -
6 Sobic.009G128200 - -
7 Sobic.007G153800 - -
8 Sobic.001G380300 - -
9 Sobic.007G026400 expressed protein -
10 Sobic.002G198700 up-regulated under drought stress(PubMedID : 24655390)@expressed protein -
11 Sobic.007G163433 - -
12 Sobic.006G239900 Cf-4A protein, putative, expressed -
13 Sobic.003G340350 - -
14 Sobic.004G206800 - -
15 Sobic.006G068900 expressed protein -
16 Sobic.009G018600 TKL_IRAK_CrRLK1L-1.3 - The CrRLK1L-1 subfamily has homology to the CrRLK1L homolog, expressed -
17 Sobic.001G313000 expressed protein -
18 Sobic.004G269300 - -
19 Sobic.001G276550 - -
20 Sobic.006G155150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G050500 Sobic003G050500 Sobic004G100000 Sobic004G100000 Sobic003G050500--Sobic004G100000 Sobic006G150800 Sobic006G150800 Sobic003G050500--Sobic006G150800 Sobic002G109200 Sobic002G109200 Sobic003G050500--Sobic002G109200 Sobic003G154100 Sobic003G154100 Sobic003G050500--Sobic003G154100 Sobic010G133566 Sobic010G133566 Sobic003G050500--Sobic010G133566 Sobic009G128200 Sobic009G128200 Sobic003G050500--Sobic009G128200 Sobic007G153800 Sobic007G153800 Sobic003G050500--Sobic007G153800 Sobic001G380300 Sobic001G380300 Sobic003G050500--Sobic001G380300 Sobic007G026400 Sobic007G026400 Sobic003G050500--Sobic007G026400 Sobic010G019200 Sobic010G019200 Sobic004G100000--Sobic010G019200 Sobic008G094150 Sobic008G094150 Sobic004G100000--Sobic008G094150 Sobic004G100000--Sobic003G050500 Sobic002G198700 Sobic002G198700 Sobic004G100000--Sobic002G198700 Sobic006G049200 Sobic006G049200 Sobic004G100000--Sobic006G049200 Sobic008G005900 Sobic008G005900 Sobic004G100000--Sobic008G005900 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Sobic007G013800 Sobic007G026400--Sobic007G013800 Sobic001G309732 Sobic001G309732 Sobic007G026400--Sobic001G309732
Octagon: transcription factors


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