Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G128200.2,Sobic.009G128200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6P8B4 , A0A1B6P8U7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G050500 - -
2 Sobic.003G154100 gibberellin 2-oxidase, putative, expressed K04125: gibberellin 2beta-dioxygenase
3 Sobic.002G109200 - -
4 Sobic.010G173500 - -
5 Sobic.008G012100 csAtPR5, putative, expressed -
6 Sobic.009G163950 - -
7 Sobic.006G150800 gibberellin 2-beta-dioxygenase 7, putative, expressed K04125: gibberellin 2beta-dioxygenase
8 Sobic.009G018600 TKL_IRAK_CrRLK1L-1.3 - The CrRLK1L-1 subfamily has homology to the CrRLK1L homolog, expressed -
9 Sobic.001G181000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@expressed protein -
10 Sobic.002G031000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@bHLH(PubMedID : 28944535)@helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed K16189: phytochrome-interacting factor 4
11 Sobic.005G223925 - -
12 Sobic.009G016000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@-(PubMedID : 26976818)@soluble inorganic pyrophosphatase, putative, expressed K01507: inorganic pyrophosphatase
13 Sobic.001G276550 - -
14 Sobic.007G163433 - -
15 Sobic.007G198200 - -
16 Sobic.008G180800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@carotenoid biosynthesi(PubMedID : 18162592)@phytoene synthase, chloroplast precursor, putative, expressed K02291: 15-cis-phytoene synthase
17 Sobic.008G012150 - -
18 Sobic.001G313000 expressed protein -
19 Sobic.006G020300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@transferase family protein, putative, expressed -
20 Sobic.003G340350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G128200 Sobic009G128200 Sobic003G050500 Sobic003G050500 Sobic009G128200--Sobic003G050500 Sobic003G154100 Sobic003G154100 Sobic009G128200--Sobic003G154100 Sobic002G109200 Sobic002G109200 Sobic009G128200--Sobic002G109200 Sobic010G173500 Sobic010G173500 Sobic009G128200--Sobic010G173500 Sobic008G012100 Sobic008G012100 Sobic009G128200--Sobic008G012100 Sobic009G163950 Sobic009G163950 Sobic009G128200--Sobic009G163950 Sobic006G150800 Sobic006G150800 Sobic009G128200--Sobic006G150800 Sobic009G018600 Sobic009G018600 Sobic009G128200--Sobic009G018600 Sobic001G181000 Sobic001G181000 Sobic009G128200--Sobic001G181000 Sobic004G100000 Sobic004G100000 Sobic003G050500--Sobic004G100000 Sobic003G050500--Sobic006G150800 Sobic003G050500--Sobic002G109200 Sobic003G050500--Sobic003G154100 Sobic010G133566 Sobic010G133566 Sobic003G050500--Sobic010G133566 Sobic003G050500--Sobic009G128200 Sobic007G153800 Sobic007G153800 Sobic003G050500--Sobic007G153800 Sobic001G380300 Sobic001G380300 Sobic003G050500--Sobic001G380300 Sobic007G026400 Sobic007G026400 Sobic003G050500--Sobic007G026400 Sobic006G155150 Sobic006G155150 Sobic003G154100--Sobic006G155150 Sobic003G251050 Sobic003G251050 Sobic003G154100--Sobic003G251050 Sobic003G154100--Sobic010G133566 Sobic003G154100--Sobic001G380300 Sobic001G002900 Sobic001G002900 Sobic003G154100--Sobic001G002900 Sobic008G035000 Sobic008G035000 Sobic003G154100--Sobic008G035000 Sobic010G048933 Sobic010G048933 Sobic003G154100--Sobic010G048933 Sobic003G154100--Sobic003G050500 Sobic004G359150 Sobic004G359150 Sobic003G154100--Sobic004G359150 Sobic007G163433 Sobic007G163433 Sobic002G109200--Sobic007G163433 Sobic002G109200--Sobic008G012100 Sobic002G052100 Sobic002G052100 Sobic002G109200--Sobic002G052100 Sobic003G340350 Sobic003G340350 Sobic002G109200--Sobic003G340350 Sobic004G206800 Sobic004G206800 Sobic002G109200--Sobic004G206800 Sobic002G021900 Sobic002G021900 Sobic002G109200--Sobic002G021900 Sobic002G109200--Sobic009G018600 Sobic001G181100 Sobic001G181100 Sobic002G109200--Sobic001G181100 Sobic002G052000 Sobic002G052000 Sobic002G109200--Sobic002G052000 Sobic010G173500--Sobic001G380300 Sobic010G173500--Sobic002G109200 Sobic010G173500--Sobic009G018600 Sobic010G173500--Sobic004G359150 Sobic008G015400 Sobic008G015400 Sobic010G173500--Sobic008G015400 Sobic010G207325 Sobic010G207325 Sobic010G173500--Sobic010G207325 Sobic003G208100 Sobic003G208100 Sobic010G173500--Sobic003G208100 Sobic008G044200 Sobic008G044200 Sobic010G173500--Sobic008G044200 Sobic003G386500 Sobic003G386500 Sobic010G173500--Sobic003G386500 Sobic008G012150 Sobic008G012150 Sobic008G012100--Sobic008G012150 Sobic008G012100--Sobic007G163433 Sobic008G012100--Sobic002G021900 Sobic008G012100--Sobic003G340350 Sobic008G012100--Sobic004G206800 Sobic010G208750 Sobic010G208750 Sobic008G012100--Sobic010G208750 Sobic008G012100--Sobic002G109200 Sobic008G012100--Sobic002G052100 Sobic005G208200 Sobic005G208200 Sobic008G012100--Sobic005G208200 Sobic008G149100 Sobic008G149100 Sobic009G163950--Sobic008G149100 Sobic004G151800 Sobic004G151800 Sobic009G163950--Sobic004G151800 Sobic008G180800 Sobic008G180800 Sobic009G163950--Sobic008G180800 Sobic007G006400 Sobic007G006400 Sobic009G163950--Sobic007G006400 Sobic002G116000 Sobic002G116000 Sobic009G163950--Sobic002G116000 Sobic001G200000 Sobic001G200000 Sobic009G163950--Sobic001G200000 Sobic006G153400 Sobic006G153400 Sobic009G163950--Sobic006G153400 Sobic010G104700 Sobic010G104700 Sobic009G163950--Sobic010G104700 Sobic003G127800 Sobic003G127800 Sobic009G163950--Sobic003G127800 Sobic010G183600 Sobic010G183600 Sobic006G150800--Sobic010G183600 Sobic006G150800--Sobic002G052100 Sobic005G176100 Sobic005G176100 Sobic006G150800--Sobic005G176100 Sobic006G150800--Sobic001G181100 Sobic010G271800 Sobic010G271800 Sobic006G150800--Sobic010G271800 Sobic004G214800 Sobic004G214800 Sobic006G150800--Sobic004G214800 Sobic006G154800 Sobic006G154800 Sobic006G150800--Sobic006G154800 Sobic003G326000 Sobic003G326000 Sobic006G150800--Sobic003G326000 Sobic006G150800--Sobic002G052000 Sobic009G018600--Sobic002G109200 Sobic008G115700 Sobic008G115700 Sobic009G018600--Sobic008G115700 Sobic007G090451 Sobic007G090451 Sobic009G018600--Sobic007G090451 Sobic003G340300 Sobic003G340300 Sobic009G018600--Sobic003G340300 Sobic009G018600--Sobic010G208750 Sobic005G073800 Sobic005G073800 Sobic009G018600--Sobic005G073800 Sobic009G018600--Sobic008G012150 Sobic009G018600--Sobic008G012100 Sobic009G246400 Sobic009G246400 Sobic009G018600--Sobic009G246400 Sobic003G175800 Sobic003G175800 Sobic001G181000--Sobic003G175800 Sobic006G020300 Sobic006G020300 Sobic001G181000--Sobic006G020300 Sobic001G181000--Sobic002G052100 Sobic001G181000--Sobic007G163433 Sobic001G181000--Sobic003G340350 Sobic001G181000--Sobic008G012100 Sobic001G181000--Sobic002G052000 Sobic001G181000--Sobic004G206800 Sobic001G181000--Sobic001G181100
Octagon: transcription factors


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