Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G239900.1
Synonym AtRLP15, Sb06g030610, RLP15
Functional annotation Cf-4A protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6PNL6
Pfam PF08263 PF00560 PF13855
Panther DB PTHR27004 PTHR27004:SF11
NCBI CDD KOG0472; Leucine-rich repeat protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G74190 : receptor like protein 15
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g55440.1 : Cf-4A protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G026400 expressed protein -
2 Sobic.004G204300 cyclin, putative, expressed K06627: cyclin-A
3 Sobic.003G353900 - -
4 Sobic.006G217950 - -
5 Sobic.003G417500 ZOS1-23 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
6 Sobic.001G138700 - -
7 Sobic.009G182500 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
8 Sobic.009G054450 - -
9 Sobic.003G163801 - -
10 Sobic.002G326650 - -
11 Sobic.009G200750 - -
12 Sobic.007G145901 - K02705: photosystem II CP43 chlorophyll apoprotein
13 Sobic.002G055500 Putative uncharacterized protein (Oryza sativa Indica Group)(PubMedID : 24655390)@Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@expressed protein -
14 Sobic.004G219700 OsWAK13 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
15 Sobic.005G071500 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
16 Sobic.001G210101 - -
17 Sobic.003G050500 - -
18 Sobic.001G216900 - -
19 Sobic.003G077800 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@suppressor of G2 allele of SKP1, putative, expressed K12795: SUGT1, suppressor of G2 allele of SKP1
20 Sobic.003G214200 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic006G239900 Sobic006G239900 Sobic007G026400 Sobic007G026400 Sobic006G239900--Sobic007G026400 Sobic004G204300 Sobic004G204300 Sobic006G239900--Sobic004G204300 Sobic003G353900 Sobic003G353900 Sobic006G239900--Sobic003G353900 Sobic006G217950 Sobic006G217950 Sobic006G239900--Sobic006G217950 Sobic003G417500 Sobic003G417500 Sobic006G239900--Sobic003G417500 Sobic001G138700 Sobic001G138700 Sobic006G239900--Sobic001G138700 Sobic009G182500 Sobic009G182500 Sobic006G239900--Sobic009G182500 Sobic009G054450 Sobic009G054450 Sobic006G239900--Sobic009G054450 Sobic003G163801 Sobic003G163801 Sobic006G239900--Sobic003G163801 Sobic007G026400--Sobic006G239900 Sobic005G071500 Sobic005G071500 Sobic007G026400--Sobic005G071500 Sobic007G026400--Sobic003G417500 Sobic010G023066 Sobic010G023066 Sobic007G026400--Sobic010G023066 Sobic009G072300 Sobic009G072300 Sobic007G026400--Sobic009G072300 Sobic007G026400--Sobic004G204300 Sobic003G214200 Sobic003G214200 Sobic007G026400--Sobic003G214200 Sobic007G013800 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Sobic003G163801--Sobic005G039350 Sobic003G327300 Sobic003G327300 Sobic003G163801--Sobic003G327300
Octagon: transcription factors


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