Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G078600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q1X0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a023514 , Zm00025a035593
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G006000 ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpA homolog CD4B,chloroplast precursor, putative, expressed K03696: ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC
2 Sobic.003G367350 - -
3 Sobic.009G099050 - -
4 Sobic.003G078501 - -
5 Sobic.007G217300 hsp20/alpha crystallin family protein, putative, expressed K13993: HSP20 family protein
6 Sobic.010G114800 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@cyclin-dependent kinase G-1, putative, expressed K08818: cell division cycle 2-like
7 Sobic.002G347800 expressed protein -
8 Sobic.001G159850 - -
9 Sobic.001G159850 - -
10 Sobic.001G159850 - -
11 Sobic.001G159850 - -
12 Sobic.001G159850 - -
13 Sobic.001G159850 - -
14 Sobic.001G159850 - -
15 Sobic.001G159850 - -
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17 Sobic.001G159850 - -
18 Sobic.001G159850 - -
19 Sobic.001G159850 - -
20 Sobic.001G159850 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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