Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G099050.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R1W1
Pfam PF13639
Panther DB PTHR14155 PTHR14155:SF111
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G06490 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g34450.1 : zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a050948
Brachypodium KQK06442 , KQK06441 , PNT71341 , PNT71340
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G233300 ZOS6-07 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
2 Sobic.007G006000 ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpA homolog CD4B,chloroplast precursor, putative, expressed K03696: ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpC
3 Sobic.002G347800 expressed protein -
4 Sobic.003G078600 - -
5 Sobic.009G030701 - -
6 Sobic.010G091366 - -
7 Sobic.009G066850 - -
8 Sobic.002G168100 Plant PDR ABC transporter associated domain containing protein, expressed -
9 Sobic.003G051300 expressed protein -
10 Sobic.001G322766 - -
11 Sobic.009G150100 expressed protein -
12 Sobic.007G154901 - K01674: carbonic anhydrase
13 Sobic.001G450100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450 protein, putative, expressed -
14 Sobic.007G100275 - -
15 Sobic.004G289700 C2 domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.007G075200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@bifunctional purine biosynthesis protein purH, putative, expressed K00602: phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase / IMP cyclohydrolase
17 Sobic.008G043450 - -
18 Sobic.008G085600 - -
19 Sobic.003G091100 seven in absentia protein family domain containing protein, expressed -
20 Sobic.K042700 OsMADS70 - MADS-box family gene with M-alpha type-box, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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