Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G084800.2
Synonym Sb03g007135
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0VW83
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g04090.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a023607
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G084800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G127600 MBTB45 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
2 Sobic.009G236700 DUF1645 domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.003G299400 - -
4 Sobic.005G106800 - -
5 Sobic.010G173550 - -
6 Sobic.002G189350 - -
7 Sobic.009G221701 - -
8 Sobic.002G429200 expressed protein -
9 Sobic.002G149550 - K03879: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2
10 Sobic.004G098200 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
11 Sobic.003G357000 - -
12 Sobic.003G292800 expressed protein -
13 Sobic.003G045800 - -
14 Sobic.006G242600 RIPER9 - Ripening-related family protein precursor, putative, expressed -
15 Sobic.004G072950 - -
16 Sobic.010G045200 expressed protein -
17 Sobic.010G217466 - -
18 Sobic.005G230600 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
19 Sobic.002G375600 expressed protein -
20 Sobic.002G295550 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G084800 Sobic003G084800 Sobic008G127600 Sobic008G127600 Sobic003G084800--Sobic008G127600 Sobic009G236700 Sobic009G236700 Sobic003G084800--Sobic009G236700 Sobic003G299400 Sobic003G299400 Sobic003G084800--Sobic003G299400 Sobic005G106800 Sobic005G106800 Sobic003G084800--Sobic005G106800 Sobic010G173550 Sobic010G173550 Sobic003G084800--Sobic010G173550 Sobic002G189350 Sobic002G189350 Sobic003G084800--Sobic002G189350 Sobic009G221701 Sobic009G221701 Sobic003G084800--Sobic009G221701 Sobic002G429200 Sobic002G429200 Sobic003G084800--Sobic002G429200 Sobic002G149550 Sobic002G149550 Sobic003G084800--Sobic002G149550 Sobic003G357000 Sobic003G357000 Sobic008G127600--Sobic003G357000 Sobic004G325766 Sobic004G325766 Sobic008G127600--Sobic004G325766 Sobic003G045800 Sobic003G045800 Sobic008G127600--Sobic003G045800 Sobic004G098200 Sobic004G098200 Sobic008G127600--Sobic004G098200 Sobic008G023500 Sobic008G023500 Sobic008G127600--Sobic008G023500 Sobic009G164200 Sobic009G164200 Sobic008G127600--Sobic009G164200 Sobic008G127600--Sobic003G299400 Sobic007G152200 Sobic007G152200 Sobic008G127600--Sobic007G152200 Sobic008G127600--Sobic005G106800 Sobic004G082000 Sobic004G082000 Sobic009G236700--Sobic004G082000 Sobic007G213200 Sobic007G213200 Sobic009G236700--Sobic007G213200 Sobic005G138900 Sobic005G138900 Sobic009G236700--Sobic005G138900 Sobic009G236700--Sobic003G084800 Sobic001G042400 Sobic001G042400 Sobic009G236700--Sobic001G042400 Sobic010G266100 Sobic010G266100 Sobic009G236700--Sobic010G266100 Sobic002G241900 Sobic002G241900 Sobic009G236700--Sobic002G241900 Sobic010G256433 Sobic010G256433 Sobic009G236700--Sobic010G256433 Sobic005G160900 Sobic005G160900 Sobic009G236700--Sobic005G160900 Sobic003G299400--Sobic005G106800 Sobic003G299400--Sobic003G357000 Sobic004G351866 Sobic004G351866 Sobic003G299400--Sobic004G351866 Sobic009G165050 Sobic009G165050 Sobic003G299400--Sobic009G165050 Sobic002G205201 Sobic002G205201 Sobic003G299400--Sobic002G205201 Sobic010G275550 Sobic010G275550 Sobic003G299400--Sobic010G275550 Sobic003G299400--Sobic003G045800 Sobic003G299400--Sobic008G023500 Sobic003G299400--Sobic004G325766 Sobic005G106800--Sobic003G299400 Sobic005G106800--Sobic009G165050 Sobic005G106800--Sobic004G351866 Sobic005G106800--Sobic004G325766 Sobic005G106800--Sobic003G357000 Sobic005G106800--Sobic003G045800 Sobic005G106800--Sobic010G275550 Sobic010G014600 Sobic010G014600 Sobic005G106800--Sobic010G014600 Sobic006G214101 Sobic006G214101 Sobic005G106800--Sobic006G214101 Sobic010G173550--Sobic005G106800 Sobic010G173550--Sobic003G299400 Sobic010G173550--Sobic009G165050 Sobic010G173550--Sobic004G325766 Sobic005G008301 Sobic005G008301 Sobic010G173550--Sobic005G008301 Sobic010G173550--Sobic003G045800 Sobic010G173550--Sobic002G205201 Sobic010G173550--Sobic007G152200 Sobic010G173550--Sobic010G275550 Sobic005G230600 Sobic005G230600 Sobic002G189350--Sobic005G230600 Sobic002G189350--Sobic002G429200 Sobic002G375600 Sobic002G375600 Sobic002G189350--Sobic002G375600 Sobic003G292800 Sobic003G292800 Sobic002G189350--Sobic003G292800 Sobic004G071401 Sobic004G071401 Sobic002G189350--Sobic004G071401 Sobic002G189350--Sobic005G106800 Sobic002G189350--Sobic009G221701 Sobic002G189350--Sobic003G299400 Sobic006G242600 Sobic006G242600 Sobic002G189350--Sobic006G242600 Sobic010G217466 Sobic010G217466 Sobic009G221701--Sobic010G217466 Sobic009G221701--Sobic002G149550 Sobic009G221701--Sobic006G242600 Sobic009G221701--Sobic002G429200 Sobic003G396400 Sobic003G396400 Sobic009G221701--Sobic003G396400 Sobic009G221701--Sobic005G106800 Sobic009G221701--Sobic003G299400 Sobic002G285950 Sobic002G285950 Sobic009G221701--Sobic002G285950 Sobic006G116600 Sobic006G116600 Sobic009G221701--Sobic006G116600 Sobic002G429200--Sobic002G375600 Sobic002G429200--Sobic003G292800 Sobic002G429200--Sobic009G221701 Sobic002G429200--Sobic005G230600 Sobic002G429200--Sobic002G189350 Sobic002G429200--Sobic010G217466 Sobic002G429200--Sobic006G242600 Sobic008G175700 Sobic008G175700 Sobic002G429200--Sobic008G175700 Sobic003G013400 Sobic003G013400 Sobic002G429200--Sobic003G013400 Sobic002G149550--Sobic009G221701 Sobic002G149550--Sobic010G217466 Sobic002G149550--Sobic002G285950 Sobic002G149550--Sobic006G242600 Sobic002G149550--Sobic006G116600 Sobic001G378150 Sobic001G378150 Sobic002G149550--Sobic001G378150 Sobic002G149550--Sobic002G429200 Sobic002G149550--Sobic003G396400 Sobic003G336400 Sobic003G336400 Sobic002G149550--Sobic003G336400
Octagon: transcription factors


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