Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G097000.1
Synonym Sb03g008160, PR5K
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0VWK7
Pfam PF00069 PF00314
Panther DB PTHR27002 PTHR27002:SF38
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0005524ATP binding GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G38280 : PR5-like receptor kinase
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g02310.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK13877 , PNT69831 , KQK02402
Barley HORVU3Hr1G012100.10 , HORVU4Hr1G002640.1 , HORVU3Hr1G002210.13 , HORVU3Hr1G002210.14 , HORVU2Hr1G098980.1 , HORVU2Hr1G098980.2 , HORVU6Hr1G092730.1 , HORVU6Hr1G092730.2 , HORVU3Hr1G012100.5 , HORVU3Hr1G012100.4 , HORVU3Hr1G012100.2 , HORVU3Hr1G012100.1 , HORVU3Hr1G012100.9 , HORVU3Hr1G012100.8 , HORVU3Hr1G002230.1 , HORVU3Hr1G002210.3 , HORVU3Hr1G002210.6 , HORVU3Hr1G002210.7 , HORVU3Hr1G002210.4 , HORVU3Hr1G002210.5 , HORVU3Hr1G002240.1 , HORVU3Hr1G002240.2
Wheat TraesCS3B02G079400 , TraesCS3D02G062500 , TraesCS3A02G064300 , TraesCS3A02G063700 , TraesCS2D02G419700 , TraesCS3D02G012900 , TraesCS3A02G064400 , TraesCS3D02G012800
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G272000 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@csAtPR5, putative, expressed -
2 Sobic.002G334800 - -
3 Sobic.001G107550 - -
4 Sobic.002G074900 receptor kinase, putative, expressed -
5 Sobic.003G413700 potassium transporter, putative, expressed K03549: KUP system potassium uptake protein
6 Sobic.001G373850 - -
7 Sobic.009G077000 - -
8 Sobic.009G210250 - -
9 Sobic.002G009000 - -
10 Sobic.009G257000 - -
11 Sobic.003G208200 - -
12 Sobic.008G132500 pleiotropic drug resistance protein 15, putative, expressed -
13 Sobic.007G090433 - -
14 Sobic.003G085533 - -
15 Sobic.007G132650 - -
16 Sobic.001G202450 - -
17 Sobic.003G069400 - -
18 Sobic.003G187600 PPR repeat containing protein, expressed -
19 Sobic.003G260500 - -
20 Sobic.004G072300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G097000 Sobic003G097000 Sobic006G272000 Sobic006G272000 Sobic003G097000--Sobic006G272000 Sobic002G334800 Sobic002G334800 Sobic003G097000--Sobic002G334800 Sobic001G107550 Sobic001G107550 Sobic003G097000--Sobic001G107550 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic003G097000--Sobic002G074900 Sobic003G413700 Sobic003G413700 Sobic003G097000--Sobic003G413700 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic003G097000--Sobic001G373850 Sobic009G077000 Sobic009G077000 Sobic003G097000--Sobic009G077000 Sobic009G210250 Sobic009G210250 Sobic003G097000--Sobic009G210250 Sobic002G009000 Sobic002G009000 Sobic003G097000--Sobic002G009000 Sobic006G272000--Sobic003G097000 Sobic004G163100 Sobic004G163100 Sobic006G272000--Sobic004G163100 Sobic009G146500 Sobic009G146500 Sobic006G272000--Sobic009G146500 Sobic003G016950 Sobic003G016950 Sobic006G272000--Sobic003G016950 Sobic002G249700 Sobic002G249700 Sobic006G272000--Sobic002G249700 Sobic006G272000--Sobic003G413700 Sobic004G193350 Sobic004G193350 Sobic006G272000--Sobic004G193350 Sobic005G090800 Sobic005G090800 Sobic006G272000--Sobic005G090800 Sobic002G324801 Sobic002G324801 Sobic006G272000--Sobic002G324801 Sobic007G132650 Sobic007G132650 Sobic002G334800--Sobic007G132650 Sobic003G069400 Sobic003G069400 Sobic002G334800--Sobic003G069400 Sobic002G334800--Sobic002G074900 Sobic007G054200 Sobic007G054200 Sobic002G334800--Sobic007G054200 Sobic003G296250 Sobic003G296250 Sobic002G334800--Sobic003G296250 Sobic010G039150 Sobic010G039150 Sobic002G334800--Sobic010G039150 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic002G334800--Sobic004G274300 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic002G334800--Sobic003G260500 Sobic009G079600 Sobic009G079600 Sobic002G334800--Sobic009G079600 Sobic001G107550--Sobic009G077000 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic001G107550--Sobic002G401533 Sobic001G107550--Sobic009G210250 Sobic006G107700 Sobic006G107700 Sobic001G107550--Sobic006G107700 Sobic003G056200 Sobic003G056200 Sobic001G107550--Sobic003G056200 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic001G107550--Sobic003G161900 Sobic004G077700 Sobic004G077700 Sobic001G107550--Sobic004G077700 Sobic002G358450 Sobic002G358450 Sobic001G107550--Sobic002G358450 Sobic002G214000 Sobic002G214000 Sobic001G107550--Sobic002G214000 Sobic002G256250 Sobic002G256250 Sobic002G074900--Sobic002G256250 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic002G074900--Sobic007G004400 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic002G074900--Sobic007G046700 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic002G074900--Sobic008G115200 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic002G074900--Sobic003G335100 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic002G074900--Sobic008G119600 Sobic001G340100 Sobic001G340100 Sobic002G074900--Sobic001G340100 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic002G074900--Sobic004G133201 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic002G074900--Sobic003G169550 Sobic010G235100 Sobic010G235100 Sobic003G413700--Sobic010G235100 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic003G413700--Sobic006G111000 Sobic003G109150 Sobic003G109150 Sobic003G413700--Sobic003G109150 Sobic003G232600 Sobic003G232600 Sobic003G413700--Sobic003G232600 Sobic008G132500 Sobic008G132500 Sobic003G413700--Sobic008G132500 Sobic004G117850 Sobic004G117850 Sobic003G413700--Sobic004G117850 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic003G413700--Sobic002G171901 Sobic005G118800 Sobic005G118800 Sobic003G413700--Sobic005G118800 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic003G413700--Sobic001G250750 Sobic001G373850--Sobic002G214000 Sobic001G202450 Sobic001G202450 Sobic001G373850--Sobic001G202450 Sobic003G208200 Sobic003G208200 Sobic001G373850--Sobic003G208200 Sobic001G373850--Sobic009G210250 Sobic001G373850--Sobic009G077000 Sobic008G100201 Sobic008G100201 Sobic001G373850--Sobic008G100201 Sobic009G257000 Sobic009G257000 Sobic001G373850--Sobic009G257000 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic001G373850--Sobic004G115100 Sobic001G373850--Sobic004G133201 Sobic009G077000--Sobic002G214000 Sobic009G077000--Sobic001G202450 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic009G077000--Sobic005G045250 Sobic009G077000--Sobic001G107550 Sobic009G077000--Sobic003G161900 Sobic009G077000--Sobic001G373850 Sobic009G077000--Sobic002G401533 Sobic001G261444 Sobic001G261444 Sobic009G077000--Sobic001G261444 Sobic009G077000--Sobic006G107700 Sobic009G210250--Sobic001G202450 Sobic009G210250--Sobic006G107700 Sobic009G210250--Sobic001G373850 Sobic007G090433 Sobic007G090433 Sobic009G210250--Sobic007G090433 Sobic009G210250--Sobic009G257000 Sobic001G037033 Sobic001G037033 Sobic009G210250--Sobic001G037033 Sobic009G210250--Sobic002G401533 Sobic009G210250--Sobic001G107550 Sobic009G210250--Sobic009G077000 Sobic002G009000--Sobic001G250750 Sobic002G009000--Sobic008G132500 Sobic002G009000--Sobic010G235100 Sobic002G009000--Sobic009G210250 Sobic002G009000--Sobic002G074900 Sobic007G141900 Sobic007G141900 Sobic002G009000--Sobic007G141900 Sobic002G009000--Sobic005G118800 Sobic002G067900 Sobic002G067900 Sobic002G009000--Sobic002G067900 Sobic002G009000--Sobic003G109150
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.