Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G272000.1,Sobic.006G272000.2
Synonym Sb06g033340
Functional annotation "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence." (PubMedID : 27586543)
csAtPR5, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RFP6 , C5YAN2
Pfam -
Panther DB PTHR33065 PTHR33065:SF22
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g34602.1 : csAtPR5, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G097000 expressed protein -
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18 Sobic.003G312900 - -
19 Sobic.002G398300 expressed protein -
20 Sobic.002G181066 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G272000 Sobic006G272000 Sobic003G097000 Sobic003G097000 Sobic006G272000--Sobic003G097000 Sobic004G163100 Sobic004G163100 Sobic006G272000--Sobic004G163100 Sobic009G146500 Sobic009G146500 Sobic006G272000--Sobic009G146500 Sobic003G016950 Sobic003G016950 Sobic006G272000--Sobic003G016950 Sobic002G249700 Sobic002G249700 Sobic006G272000--Sobic002G249700 Sobic003G413700 Sobic003G413700 Sobic006G272000--Sobic003G413700 Sobic004G193350 Sobic004G193350 Sobic006G272000--Sobic004G193350 Sobic005G090800 Sobic005G090800 Sobic006G272000--Sobic005G090800 Sobic002G324801 Sobic002G324801 Sobic006G272000--Sobic002G324801 Sobic003G097000--Sobic006G272000 Sobic002G334800 Sobic002G334800 Sobic003G097000--Sobic002G334800 Sobic001G107550 Sobic001G107550 Sobic003G097000--Sobic001G107550 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic003G097000--Sobic002G074900 Sobic003G097000--Sobic003G413700 Sobic001G373850 Sobic001G373850 Sobic003G097000--Sobic001G373850 Sobic009G077000 Sobic009G077000 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Octagon: transcription factors


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