Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G163100.2,Sobic.004G163100.3
Synonym Sb04g021480
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XTC8
Pfam -
Panther DB PTHR33270 PTHR33270:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G27830 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g32580.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a020518
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G163100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G272000 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@csAtPR5, putative, expressed -
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19 Sobic.010G100600 expressed protein -
20 Sobic.009G030501 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G163100 Sobic004G163100 Sobic006G272000 Sobic006G272000 Sobic004G163100--Sobic006G272000 Sobic007G133733 Sobic007G133733 Sobic004G163100--Sobic007G133733 Sobic002G398300 Sobic002G398300 Sobic004G163100--Sobic002G398300 Sobic007G149500 Sobic007G149500 Sobic004G163100--Sobic007G149500 Sobic003G413700 Sobic003G413700 Sobic004G163100--Sobic003G413700 Sobic001G455466 Sobic001G455466 Sobic004G163100--Sobic001G455466 Sobic002G046150 Sobic002G046150 Sobic004G163100--Sobic002G046150 Sobic005G027350 Sobic005G027350 Sobic004G163100--Sobic005G027350 Sobic001G162600 Sobic001G162600 Sobic004G163100--Sobic001G162600 Sobic003G097000 Sobic003G097000 Sobic006G272000--Sobic003G097000 Sobic006G272000--Sobic004G163100 Sobic009G146500 Sobic009G146500 Sobic006G272000--Sobic009G146500 Sobic003G016950 Sobic003G016950 Sobic006G272000--Sobic003G016950 Sobic002G249700 Sobic002G249700 Sobic006G272000--Sobic002G249700 Sobic006G272000--Sobic003G413700 Sobic004G193350 Sobic004G193350 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Octagon: transcription factors


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