Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G334800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QEX3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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cDNA sequences
Sobic.002G334800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G132650 - -
2 Sobic.003G069400 - -
3 Sobic.002G074900 receptor kinase, putative, expressed -
4 Sobic.007G054200 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
5 Sobic.003G296250 - -
6 Sobic.010G039150 - -
7 Sobic.004G274300 no apical meristem protein, putative, expressed -
8 Sobic.003G260500 - -
9 Sobic.009G079600 - -
10 Sobic.003G109150 - -
11 Sobic.001G323101 - -
12 Sobic.003G187600 PPR repeat containing protein, expressed -
13 Sobic.002G256250 - -
14 Sobic.001G340100 - -
15 Sobic.004G134400 - -
16 Sobic.001G431900 DUF292 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.003G335100 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
18 Sobic.003G394701 - -
19 Sobic.004G223800 membrane-associated salt-inducible protein like, putative, expressed -
20 Sobic.006G258100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G334800 Sobic002G334800 Sobic007G132650 Sobic007G132650 Sobic002G334800--Sobic007G132650 Sobic003G069400 Sobic003G069400 Sobic002G334800--Sobic003G069400 Sobic002G074900 Sobic002G074900 Sobic002G334800--Sobic002G074900 Sobic007G054200 Sobic007G054200 Sobic002G334800--Sobic007G054200 Sobic003G296250 Sobic003G296250 Sobic002G334800--Sobic003G296250 Sobic010G039150 Sobic010G039150 Sobic002G334800--Sobic010G039150 Sobic004G274300 Sobic004G274300 Sobic002G334800--Sobic004G274300 Sobic003G260500 Sobic003G260500 Sobic002G334800--Sobic003G260500 Sobic009G079600 Sobic009G079600 Sobic002G334800--Sobic009G079600 Sobic007G132650--Sobic003G260500 Sobic007G132650--Sobic004G274300 Sobic003G187600 Sobic003G187600 Sobic007G132650--Sobic003G187600 Sobic007G132650--Sobic009G079600 Sobic006G107766 Sobic006G107766 Sobic007G132650--Sobic006G107766 Sobic004G134400 Sobic004G134400 Sobic007G132650--Sobic004G134400 Sobic001G323101 Sobic001G323101 Sobic007G132650--Sobic001G323101 Sobic007G132650--Sobic010G039150 Sobic006G149900 Sobic006G149900 Sobic007G132650--Sobic006G149900 Sobic006G258100 Sobic006G258100 Sobic003G069400--Sobic006G258100 Sobic003G069400--Sobic007G054200 Sobic008G156800 Sobic008G156800 Sobic003G069400--Sobic008G156800 Sobic001G229850 Sobic001G229850 Sobic003G069400--Sobic001G229850 Sobic003G069400--Sobic002G074900 Sobic009G058900 Sobic009G058900 Sobic003G069400--Sobic009G058900 Sobic010G163666 Sobic010G163666 Sobic003G069400--Sobic010G163666 Sobic003G169550 Sobic003G169550 Sobic003G069400--Sobic003G169550 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic003G069400--Sobic003G335100 Sobic002G256250 Sobic002G256250 Sobic002G074900--Sobic002G256250 Sobic007G004400 Sobic007G004400 Sobic002G074900--Sobic007G004400 Sobic007G046700 Sobic007G046700 Sobic002G074900--Sobic007G046700 Sobic008G115200 Sobic008G115200 Sobic002G074900--Sobic008G115200 Sobic002G074900--Sobic003G335100 Sobic008G119600 Sobic008G119600 Sobic002G074900--Sobic008G119600 Sobic001G340100 Sobic001G340100 Sobic002G074900--Sobic001G340100 Sobic004G133201 Sobic004G133201 Sobic002G074900--Sobic004G133201 Sobic002G074900--Sobic003G169550 Sobic007G054200--Sobic007G046700 Sobic003G394701 Sobic003G394701 Sobic007G054200--Sobic003G394701 Sobic007G054200--Sobic009G058900 Sobic007G054200--Sobic003G169550 Sobic007G054200--Sobic001G323101 Sobic007G054200--Sobic008G156800 Sobic007G054200--Sobic004G133201 Sobic007G054200--Sobic004G274300 Sobic007G054200--Sobic003G187600 Sobic002G118000 Sobic002G118000 Sobic003G296250--Sobic002G118000 Sobic003G296250--Sobic007G132650 Sobic003G296250--Sobic010G039150 Sobic003G168600 Sobic003G168600 Sobic003G296250--Sobic003G168600 Sobic004G272950 Sobic004G272950 Sobic003G296250--Sobic004G272950 Sobic001G401750 Sobic001G401750 Sobic003G296250--Sobic001G401750 Sobic004G127350 Sobic004G127350 Sobic003G296250--Sobic004G127350 Sobic003G072000 Sobic003G072000 Sobic003G296250--Sobic003G072000 Sobic009G095720 Sobic009G095720 Sobic003G296250--Sobic009G095720 Sobic010G039150--Sobic009G079600 Sobic006G029850 Sobic006G029850 Sobic010G039150--Sobic006G029850 Sobic010G039150--Sobic004G274300 Sobic010G039150--Sobic007G132650 Sobic010G039150--Sobic004G134400 Sobic010G039150--Sobic003G187600 Sobic010G039150--Sobic003G260500 Sobic004G115100 Sobic004G115100 Sobic010G039150--Sobic004G115100 Sobic010G039150--Sobic001G323101 Sobic004G274300--Sobic004G134400 Sobic004G274300--Sobic009G079600 Sobic004G274300--Sobic003G187600 Sobic004G274300--Sobic003G260500 Sobic004G274300--Sobic004G133201 Sobic004G274300--Sobic007G132650 Sobic004G274300--Sobic006G107766 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic004G274300--Sobic007G127200 Sobic004G274300--Sobic003G394701 Sobic010G247750 Sobic010G247750 Sobic003G260500--Sobic010G247750 Sobic003G260500--Sobic007G132650 Sobic006G035350 Sobic006G035350 Sobic003G260500--Sobic006G035350 Sobic003G260500--Sobic004G274300 Sobic008G100201 Sobic008G100201 Sobic003G260500--Sobic008G100201 Sobic003G260500--Sobic006G107766 Sobic003G260500--Sobic007G127200 Sobic010G143700 Sobic010G143700 Sobic003G260500--Sobic010G143700 Sobic003G260500--Sobic003G187600 Sobic009G079600--Sobic004G134400 Sobic009G079600--Sobic004G274300 Sobic009G079600--Sobic003G187600 Sobic009G079600--Sobic001G323101 Sobic009G079600--Sobic007G127200 Sobic009G079600--Sobic010G039150 Sobic009G079600--Sobic007G132650 Sobic009G079600--Sobic003G260500 Sobic009G079600--Sobic010G247750
Octagon: transcription factors


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