Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G216400.1
Synonym Sb03g027530
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0VYE4
Pfam -
Panther DB PTHR31245 PTHR31245:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G32440 : Ubiquitin system component Cue protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g03090.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G186900 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase, putative, expressed -
2 Sobic.002G236800 - -
3 Sobic.003G193600 expressed protein -
4 Sobic.007G051200 cytidylyltransferase domain containing protein, expressed K00968: choline-phosphate cytidylyltransferase
5 Sobic.006G244100 OsFBDUF35 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
6 Sobic.005G054501 - -
7 Sobic.002G165900 csAtPR5, putative, expressed -
8 Sobic.002G305800 expansin precursor, putative, expressed -
9 Sobic.003G287800 anthocyanidin 5,3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
10 Sobic.006G251100 powdery mildew resistant protein 5, putative, expressed -
11 Sobic.003G226400 similar to Late embryogenesis-abundant protein Lea14-A-like(PubMedID : 29862293)@late embryogenesis abundant protein, putative, expressed -
12 Sobic.010G126300 - -
13 Sobic.004G079600 - -
14 Sobic.001G257400 mps one binder kinase activator-like 1A, putative, expressed K06685: MOB1, MOB kinase activator 1
15 Sobic.004G078750 - -
16 Sobic.003G379100 expressed protein -
17 Sobic.002G100766 - -
18 Sobic.001G249100 expressed protein -
19 Sobic.004G080600 protein with a conserved N-terminal region, putative, expressed -
20 Sobic.009G089800 reticulon domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G216400 Sobic003G216400 Sobic009G186900 Sobic009G186900 Sobic003G216400--Sobic009G186900 Sobic002G236800 Sobic002G236800 Sobic003G216400--Sobic002G236800 Sobic003G193600 Sobic003G193600 Sobic003G216400--Sobic003G193600 Sobic007G051200 Sobic007G051200 Sobic003G216400--Sobic007G051200 Sobic006G244100 Sobic006G244100 Sobic003G216400--Sobic006G244100 Sobic005G054501 Sobic005G054501 Sobic003G216400--Sobic005G054501 Sobic002G165900 Sobic002G165900 Sobic003G216400--Sobic002G165900 Sobic002G305800 Sobic002G305800 Sobic003G216400--Sobic002G305800 Sobic003G287800 Sobic003G287800 Sobic003G216400--Sobic003G287800 Sobic010G126300 Sobic010G126300 Sobic009G186900--Sobic010G126300 Sobic009G186900--Sobic003G287800 Sobic008G129800 Sobic008G129800 Sobic009G186900--Sobic008G129800 Sobic009G186900--Sobic003G216400 Sobic005G001200 Sobic005G001200 Sobic009G186900--Sobic005G001200 Sobic002G322500 Sobic002G322500 Sobic009G186900--Sobic002G322500 Sobic003G322000 Sobic003G322000 Sobic009G186900--Sobic003G322000 Sobic004G163900 Sobic004G163900 Sobic009G186900--Sobic004G163900 Sobic002G122500 Sobic002G122500 Sobic009G186900--Sobic002G122500 Sobic004G078750 Sobic004G078750 Sobic002G236800--Sobic004G078750 Sobic002G100766 Sobic002G100766 Sobic002G236800--Sobic002G100766 Sobic003G226400 Sobic003G226400 Sobic002G236800--Sobic003G226400 Sobic003G379100 Sobic003G379100 Sobic002G236800--Sobic003G379100 Sobic001G249100 Sobic001G249100 Sobic002G236800--Sobic001G249100 Sobic008G190300 Sobic008G190300 Sobic002G236800--Sobic008G190300 Sobic009G089800 Sobic009G089800 Sobic002G236800--Sobic009G089800 Sobic002G006700 Sobic002G006700 Sobic002G236800--Sobic002G006700 Sobic006G251100 Sobic006G251100 Sobic002G236800--Sobic006G251100 Sobic003G193600--Sobic007G051200 Sobic003G193600--Sobic008G129800 Sobic004G079600 Sobic004G079600 Sobic003G193600--Sobic004G079600 Sobic003G193600--Sobic002G122500 Sobic003G193600--Sobic006G251100 Sobic003G193600--Sobic002G305800 Sobic003G193600--Sobic004G163900 Sobic008G080700 Sobic008G080700 Sobic003G193600--Sobic008G080700 Sobic008G131300 Sobic008G131300 Sobic003G193600--Sobic008G131300 Sobic007G051200--Sobic006G251100 Sobic007G051200--Sobic002G305800 Sobic007G051200--Sobic008G080700 Sobic007G051200--Sobic002G236800 Sobic004G080600 Sobic004G080600 Sobic007G051200--Sobic004G080600 Sobic007G051200--Sobic003G226400 Sobic007G051200--Sobic004G078750 Sobic007G051200--Sobic002G100766 Sobic007G051200--Sobic002G122500 Sobic010G246132 Sobic010G246132 Sobic006G244100--Sobic010G246132 Sobic004G334900 Sobic004G334900 Sobic006G244100--Sobic004G334900 Sobic006G105500 Sobic006G105500 Sobic006G244100--Sobic006G105500 Sobic010G257700 Sobic010G257700 Sobic006G244100--Sobic010G257700 Sobic004G359900 Sobic004G359900 Sobic006G244100--Sobic004G359900 Sobic010G151575 Sobic010G151575 Sobic006G244100--Sobic010G151575 Sobic002G224000 Sobic002G224000 Sobic006G244100--Sobic002G224000 Sobic004G197200 Sobic004G197200 Sobic006G244100--Sobic004G197200 Sobic002G121800 Sobic002G121800 Sobic006G244100--Sobic002G121800 Sobic005G054501--Sobic002G165900 Sobic005G054501--Sobic010G257700 Sobic005G054501--Sobic009G089800 Sobic009G095640 Sobic009G095640 Sobic005G054501--Sobic009G095640 Sobic005G054501--Sobic003G379100 Sobic005G054501--Sobic008G190300 Sobic005G054501--Sobic002G100766 Sobic005G054501--Sobic004G078750 Sobic005G054501--Sobic003G226400 Sobic002G165900--Sobic009G089800 Sobic002G165900--Sobic003G379100 Sobic002G165900--Sobic008G190300 Sobic002G165900--Sobic003G226400 Sobic002G165900--Sobic002G100766 Sobic002G165900--Sobic004G078750 Sobic002G210700 Sobic002G210700 Sobic002G165900--Sobic002G210700 Sobic002G165900--Sobic002G006700 Sobic002G165900--Sobic001G249100 Sobic002G305800--Sobic008G080700 Sobic002G305800--Sobic002G122500 Sobic002G305800--Sobic004G080600 Sobic002G305800--Sobic006G251100 Sobic002G305800--Sobic004G163900 Sobic002G305800--Sobic007G051200 Sobic002G305800--Sobic002G236800 Sobic002G305800--Sobic008G131300 Sobic003G166001 Sobic003G166001 Sobic002G305800--Sobic003G166001 Sobic003G287800--Sobic010G126300 Sobic003G287800--Sobic005G001200 Sobic003G287800--Sobic002G322500 Sobic003G400700 Sobic003G400700 Sobic003G287800--Sobic003G400700 Sobic006G037100 Sobic006G037100 Sobic003G287800--Sobic006G037100 Sobic005G098100 Sobic005G098100 Sobic003G287800--Sobic005G098100 Sobic001G433500 Sobic001G433500 Sobic003G287800--Sobic001G433500 Sobic002G102600 Sobic002G102600 Sobic003G287800--Sobic002G102600 Sobic003G287800--Sobic003G166001
Octagon: transcription factors


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