Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G218600.2
Synonym Sb03g027730
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6Q4M8
Pfam PF07800
Panther DB PTHR31197 PTHR31197:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G25910 : Protein of unknown function (DUF1644)
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g42700.3 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028705 , Zm00025a038491
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G218600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G254700 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
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18 Sobic.004G173900 - -
19 Sobic.010G078000 - -
20 Sobic.007G201300 30S ribosomal protein S16, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G218600 Sobic003G218600 Sobic009G254700 Sobic009G254700 Sobic003G218600--Sobic009G254700 Sobic010G051600 Sobic010G051600 Sobic003G218600--Sobic010G051600 Sobic005G040950 Sobic005G040950 Sobic003G218600--Sobic005G040950 Sobic007G119400 Sobic007G119400 Sobic003G218600--Sobic007G119400 Sobic002G076450 Sobic002G076450 Sobic003G218600--Sobic002G076450 Sobic003G289300 Sobic003G289300 Sobic003G218600--Sobic003G289300 Sobic001G437600 Sobic001G437600 Sobic003G218600--Sobic001G437600 Sobic005G106900 Sobic005G106900 Sobic003G218600--Sobic005G106900 Sobic010G051900 Sobic010G051900 Sobic003G218600--Sobic010G051900 Sobic009G254700--Sobic003G218600 Sobic003G039100 Sobic003G039100 Sobic009G254700--Sobic003G039100 Sobic009G254700--Sobic010G051600 Sobic005G161500 Sobic005G161500 Sobic009G254700--Sobic005G161500 Sobic003G336600 Sobic003G336600 Sobic009G254700--Sobic003G336600 Sobic009G047033 Sobic009G047033 Sobic009G254700--Sobic009G047033 Sobic001G439850 Sobic001G439850 Sobic009G254700--Sobic001G439850 Sobic009G254700--Sobic010G051900 Sobic003G091900 Sobic003G091900 Sobic009G254700--Sobic003G091900 Sobic010G051600--Sobic009G047033 Sobic010G051600--Sobic001G437600 Sobic010G051600--Sobic010G051900 Sobic002G076200 Sobic002G076200 Sobic010G051600--Sobic002G076200 Sobic010G051600--Sobic005G040950 Sobic010G051600--Sobic005G106900 Sobic007G185000 Sobic007G185000 Sobic010G051600--Sobic007G185000 Sobic010G010100 Sobic010G010100 Sobic010G051600--Sobic010G010100 Sobic005G059300 Sobic005G059300 Sobic010G051600--Sobic005G059300 Sobic005G040950--Sobic003G289300 Sobic003G339400 Sobic003G339400 Sobic005G040950--Sobic003G339400 Sobic005G040950--Sobic010G051900 Sobic005G040950--Sobic001G437600 Sobic001G241500 Sobic001G241500 Sobic005G040950--Sobic001G241500 Sobic005G040950--Sobic007G119400 Sobic005G040950--Sobic002G076200 Sobic005G219800 Sobic005G219800 Sobic005G040950--Sobic005G219800 Sobic001G494350 Sobic001G494350 Sobic005G040950--Sobic001G494350 Sobic007G119400--Sobic003G339400 Sobic009G142600 Sobic009G142600 Sobic007G119400--Sobic009G142600 Sobic008G045900 Sobic008G045900 Sobic007G119400--Sobic008G045900 Sobic005G205000 Sobic005G205000 Sobic007G119400--Sobic005G205000 Sobic009G258200 Sobic009G258200 Sobic007G119400--Sobic009G258200 Sobic007G119400--Sobic010G010100 Sobic010G103300 Sobic010G103300 Sobic007G119400--Sobic010G103300 Sobic006G258200 Sobic006G258200 Sobic007G119400--Sobic006G258200 Sobic008G053700 Sobic008G053700 Sobic007G119400--Sobic008G053700 Sobic008G119100 Sobic008G119100 Sobic002G076450--Sobic008G119100 Sobic002G076450--Sobic010G051900 Sobic002G076450--Sobic009G047033 Sobic005G201100 Sobic005G201100 Sobic002G076450--Sobic005G201100 Sobic001G524900 Sobic001G524900 Sobic002G076450--Sobic001G524900 Sobic002G076450--Sobic005G040950 Sobic006G128450 Sobic006G128450 Sobic002G076450--Sobic006G128450 Sobic003G092150 Sobic003G092150 Sobic002G076450--Sobic003G092150 Sobic002G076450--Sobic003G289300 Sobic003G289300--Sobic005G040950 Sobic003G289300--Sobic003G339400 Sobic003G289300--Sobic007G119400 Sobic003G289300--Sobic001G437600 Sobic003G289300--Sobic005G219800 Sobic003G289300--Sobic001G241500 Sobic003G289300--Sobic002G076200 Sobic003G289300--Sobic009G258200 Sobic003G289300--Sobic010G051900 Sobic001G437600--Sobic010G010100 Sobic001G437600--Sobic005G059300 Sobic001G437600--Sobic003G339400 Sobic001G437600--Sobic009G142600 Sobic001G437600--Sobic005G219800 Sobic004G173900 Sobic004G173900 Sobic001G437600--Sobic004G173900 Sobic001G437600--Sobic008G045900 Sobic008G139200 Sobic008G139200 Sobic001G437600--Sobic008G139200 Sobic010G091750 Sobic010G091750 Sobic001G437600--Sobic010G091750 Sobic005G106900--Sobic010G010100 Sobic005G106900--Sobic005G059300 Sobic005G106900--Sobic001G437600 Sobic004G200501 Sobic004G200501 Sobic005G106900--Sobic004G200501 Sobic003G120050 Sobic003G120050 Sobic005G106900--Sobic003G120050 Sobic003G118750 Sobic003G118750 Sobic005G106900--Sobic003G118750 Sobic005G106900--Sobic003G339400 Sobic003G023100 Sobic003G023100 Sobic005G106900--Sobic003G023100 Sobic005G106900--Sobic010G091750 Sobic010G051900--Sobic005G040950 Sobic010G051900--Sobic008G119100 Sobic010G051900--Sobic002G076450 Sobic010G051900--Sobic009G047033 Sobic010G051900--Sobic010G051600 Sobic010G051900--Sobic003G289300 Sobic010G051900--Sobic001G241500 Sobic003G157800 Sobic003G157800 Sobic010G051900--Sobic003G157800 Sobic010G051900--Sobic001G524900
Octagon: transcription factors


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