Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G441400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q8E6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g40750.1 : pectinesterase inhibitor domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025270
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G213150 - -
2 Sobic.009G029800 endoglucanase, putative, expressed -
3 Sobic.007G215300 expressed protein -
4 Sobic.005G204400 oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed -
5 Sobic.003G060900 OsFBX320 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.005G005100 PMR5, putative, expressed -
7 Sobic.010G273200 3-ketoacyl-CoA synthase, putative, expressed K15397: 3-ketoacyl-CoA synthase
8 Sobic.002G070400 - -
9 Sobic.005G144101 - -
10 Sobic.002G407500 sex determination protein tasselseed-2, putative, expressed -
11 Sobic.001G152240 - -
12 Sobic.002G103400 - -
13 Sobic.004G082050 - K02935: RP-L7, MRPL12, large subunit ribosomal protein L7/L12
14 Sobic.010G091750 - -
15 Sobic.004G173800 - -
16 Sobic.006G004700 erythronate-4-phosphate dehydrogenase domain containing protein, expressed K15919: glyoxylate/hydroxypyruvate reductase
17 Sobic.008G006900 laccase-23 precursor, putative, expressed K05909: laccase
18 Sobic.003G141400 expressed protein -
19 Sobic.008G053700 - -
20 Sobic.007G087500 hypothetical protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G441400 Sobic003G441400 Sobic001G213150 Sobic001G213150 Sobic003G441400--Sobic001G213150 Sobic009G029800 Sobic009G029800 Sobic003G441400--Sobic009G029800 Sobic007G215300 Sobic007G215300 Sobic003G441400--Sobic007G215300 Sobic005G204400 Sobic005G204400 Sobic003G441400--Sobic005G204400 Sobic003G060900 Sobic003G060900 Sobic003G441400--Sobic003G060900 Sobic005G005100 Sobic005G005100 Sobic003G441400--Sobic005G005100 Sobic010G273200 Sobic010G273200 Sobic003G441400--Sobic010G273200 Sobic002G070400 Sobic002G070400 Sobic003G441400--Sobic002G070400 Sobic005G144101 Sobic005G144101 Sobic003G441400--Sobic005G144101 Sobic001G213150--Sobic009G029800 Sobic001G213150--Sobic003G060900 Sobic001G213150--Sobic007G215300 Sobic001G213150--Sobic010G273200 Sobic001G213150--Sobic005G144101 Sobic001G213150--Sobic005G204400 Sobic010G091750 Sobic010G091750 Sobic001G213150--Sobic010G091750 Sobic002G103400 Sobic002G103400 Sobic001G213150--Sobic002G103400 Sobic003G141400 Sobic003G141400 Sobic001G213150--Sobic003G141400 Sobic009G029800--Sobic001G213150 Sobic009G029800--Sobic003G060900 Sobic009G029800--Sobic010G273200 Sobic009G029800--Sobic005G144101 Sobic009G029800--Sobic007G215300 Sobic009G029800--Sobic002G103400 Sobic001G152240 Sobic001G152240 Sobic009G029800--Sobic001G152240 Sobic009G029800--Sobic010G091750 Sobic009G029800--Sobic003G141400 Sobic007G215300--Sobic001G213150 Sobic007G215300--Sobic009G029800 Sobic007G215300--Sobic003G060900 Sobic007G215300--Sobic005G204400 Sobic010G228300 Sobic010G228300 Sobic007G215300--Sobic010G228300 Sobic009G142700 Sobic009G142700 Sobic007G215300--Sobic009G142700 Sobic007G095850 Sobic007G095850 Sobic007G215300--Sobic007G095850 Sobic007G215300--Sobic010G273200 Sobic007G215300--Sobic005G144101 Sobic005G204400--Sobic007G215300 Sobic005G204400--Sobic001G213150 Sobic005G204400--Sobic009G029800 Sobic005G204400--Sobic003G060900 Sobic005G204400--Sobic010G273200 Sobic005G204400--Sobic005G144101 Sobic005G204400--Sobic001G152240 Sobic005G204400--Sobic002G103400 Sobic005G204400--Sobic010G091750 Sobic003G060900--Sobic001G213150 Sobic003G060900--Sobic010G273200 Sobic003G060900--Sobic009G029800 Sobic003G060900--Sobic005G144101 Sobic003G060900--Sobic010G091750 Sobic003G060900--Sobic007G215300 Sobic003G060900--Sobic002G103400 Sobic003G060900--Sobic001G152240 Sobic003G060900--Sobic005G204400 Sobic006G004700 Sobic006G004700 Sobic005G005100--Sobic006G004700 Sobic005G005100--Sobic002G070400 Sobic008G053700 Sobic008G053700 Sobic005G005100--Sobic008G053700 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic005G005100--Sobic007G087500 Sobic004G173800 Sobic004G173800 Sobic005G005100--Sobic004G173800 Sobic005G005100--Sobic005G144101 Sobic002G063500 Sobic002G063500 Sobic005G005100--Sobic002G063500 Sobic005G005100--Sobic002G103400 Sobic005G013700 Sobic005G013700 Sobic005G005100--Sobic005G013700 Sobic010G273200--Sobic005G144101 Sobic010G273200--Sobic001G152240 Sobic010G273200--Sobic002G103400 Sobic010G273200--Sobic010G091750 Sobic010G273200--Sobic003G060900 Sobic010G273200--Sobic009G029800 Sobic010G273200--Sobic004G173800 Sobic010G273200--Sobic007G087500 Sobic010G273200--Sobic006G004700 Sobic002G070400--Sobic005G005100 Sobic002G070400--Sobic005G013700 Sobic002G070400--Sobic002G063500 Sobic002G070400--Sobic006G004700 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic002G070400--Sobic008G008601 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic002G070400--Sobic008G069901 Sobic001G160300 Sobic001G160300 Sobic002G070400--Sobic001G160300 Sobic003G046000 Sobic003G046000 Sobic002G070400--Sobic003G046000 Sobic005G025500 Sobic005G025500 Sobic002G070400--Sobic005G025500 Sobic005G144101--Sobic010G273200 Sobic005G144101--Sobic002G103400 Sobic005G144101--Sobic001G152240 Sobic005G144101--Sobic010G091750 Sobic005G144101--Sobic004G173800 Sobic005G144101--Sobic006G004700 Sobic005G144101--Sobic008G053700 Sobic005G144101--Sobic007G087500 Sobic005G144101--Sobic009G029800
Octagon: transcription factors


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