Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G286000.7,Sobic.003G286000.9,Sobic.003G286000.2,Sobic.003G286000.6,Sobic.003G286000.10,Sobic.003G286000.12,Sobic.003G286000.11,Sobic.003G286000.3,Sobic.003G286000.5,Sobic.003G286000.8,Sobic.003G286000.4
Synonym Sb03g033690
Functional annotation zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
UniProt A0A1W0VZD1 , A0A1W0VZB8 , A0A1W0VZA7 , A0A1W0VZC8
Pfam PF12906
Panther DB PTHR23012 PTHR23012:SF83
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G34200 : RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g53130.2 : zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a039020
Brachypodium KQK09592 , PNT72774 , PNT72771 , PNT72773 , PNT72772
Barley -
Wheat TraesCS3A02G281400 , TraesCS3B02G315100 , TraesCS3D02G281400
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G024800 microtubule associated protein, putative, expressed K16732: protein regulator of cytokinesis 1
2 Sobic.001G539880 - -
3 Sobic.007G148233 - -
4 Sobic.003G195400 - -
5 Sobic.004G158100 phosphatidylinositol transfer, putative, expressed -
6 Sobic.002G225800 paramyosin, putative, expressed -
7 Sobic.005G035250 - -
8 Sobic.008G011901 - K00889: 1-phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase
9 Sobic.001G364700 glycosyl transferase 8 domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.002G128700 expressed protein -
11 Sobic.001G139400 - -
12 Sobic.005G035200 - -
13 Sobic.001G539820 - -
14 Sobic.002G061300 OsFBX239 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.005G009700 expressed protein -
16 Sobic.007G080100 DNA binding protein, putative, expressed -
17 Sobic.001G202900 expressed protein -
18 Sobic.005G000200 lipase, putative, expressed -
19 Sobic.002G145400 octicosapeptide/Phox/Bem1p, putative, expressed -
20 Sobic.007G222700 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G286000 Sobic003G286000 Sobic004G024800 Sobic004G024800 Sobic003G286000--Sobic004G024800 Sobic001G539880 Sobic001G539880 Sobic003G286000--Sobic001G539880 Sobic007G148233 Sobic007G148233 Sobic003G286000--Sobic007G148233 Sobic003G195400 Sobic003G195400 Sobic003G286000--Sobic003G195400 Sobic004G158100 Sobic004G158100 Sobic003G286000--Sobic004G158100 Sobic002G225800 Sobic002G225800 Sobic003G286000--Sobic002G225800 Sobic005G035250 Sobic005G035250 Sobic003G286000--Sobic005G035250 Sobic008G011901 Sobic008G011901 Sobic003G286000--Sobic008G011901 Sobic001G364700 Sobic001G364700 Sobic003G286000--Sobic001G364700 Sobic004G024800--Sobic001G539880 Sobic005G035200 Sobic005G035200 Sobic004G024800--Sobic005G035200 Sobic007G080100 Sobic007G080100 Sobic004G024800--Sobic007G080100 Sobic004G024800--Sobic003G195400 Sobic004G024800--Sobic007G148233 Sobic004G024800--Sobic008G011901 Sobic002G145400 Sobic002G145400 Sobic004G024800--Sobic002G145400 Sobic007G221932 Sobic007G221932 Sobic004G024800--Sobic007G221932 Sobic004G024800--Sobic005G035250 Sobic001G539880--Sobic007G148233 Sobic001G539880--Sobic003G195400 Sobic001G539880--Sobic004G024800 Sobic001G539880--Sobic002G225800 Sobic001G539880--Sobic005G035250 Sobic001G539880--Sobic005G035200 Sobic001G539880--Sobic007G080100 Sobic002G128700 Sobic002G128700 Sobic001G539880--Sobic002G128700 Sobic001G539880--Sobic002G145400 Sobic007G148233--Sobic002G225800 Sobic007G148233--Sobic003G195400 Sobic007G148233--Sobic001G539880 Sobic007G148233--Sobic005G035250 Sobic007G148233--Sobic004G024800 Sobic007G148233--Sobic005G035200 Sobic007G148233--Sobic002G128700 Sobic005G009700 Sobic005G009700 Sobic007G148233--Sobic005G009700 Sobic001G539820 Sobic001G539820 Sobic007G148233--Sobic001G539820 Sobic003G195400--Sobic007G148233 Sobic003G195400--Sobic002G225800 Sobic003G195400--Sobic001G539880 Sobic003G195400--Sobic005G035250 Sobic003G195400--Sobic005G035200 Sobic003G195400--Sobic004G024800 Sobic003G195400--Sobic007G080100 Sobic003G195400--Sobic004G158100 Sobic003G195400--Sobic005G009700 Sobic004G158100--Sobic005G009700 Sobic004G158100--Sobic002G225800 Sobic004G158100--Sobic001G539820 Sobic005G000200 Sobic005G000200 Sobic004G158100--Sobic005G000200 Sobic001G139400 Sobic001G139400 Sobic004G158100--Sobic001G139400 Sobic004G158100--Sobic003G195400 Sobic004G158100--Sobic007G148233 Sobic004G158100--Sobic002G128700 Sobic007G222700 Sobic007G222700 Sobic004G158100--Sobic007G222700 Sobic002G225800--Sobic007G148233 Sobic002G225800--Sobic003G195400 Sobic002G225800--Sobic001G539880 Sobic002G225800--Sobic005G035250 Sobic002G225800--Sobic005G009700 Sobic002G225800--Sobic001G539820 Sobic002G225800--Sobic002G128700 Sobic002G225800--Sobic007G222700 Sobic002G225800--Sobic004G158100 Sobic005G035250--Sobic007G148233 Sobic005G035250--Sobic003G195400 Sobic005G035250--Sobic002G225800 Sobic005G035250--Sobic001G539880 Sobic005G035250--Sobic005G035200 Sobic005G035250--Sobic004G024800 Sobic005G035250--Sobic007G080100 Sobic005G035250--Sobic002G145400 Sobic005G035250--Sobic007G222700 Sobic008G011901--Sobic007G080100 Sobic008G011901--Sobic004G024800 Sobic008G011901--Sobic005G035200 Sobic008G011901--Sobic007G221932 Sobic008G011901--Sobic002G145400 Sobic008G011901--Sobic001G539880 Sobic008G097800 Sobic008G097800 Sobic008G011901--Sobic008G097800 Sobic008G011901--Sobic003G195400 Sobic009G091000 Sobic009G091000 Sobic008G011901--Sobic009G091000 Sobic010G118800 Sobic010G118800 Sobic001G364700--Sobic010G118800 Sobic001G364700--Sobic005G000200 Sobic001G364700--Sobic001G539820 Sobic001G364700--Sobic005G009700 Sobic001G364700--Sobic007G222700 Sobic007G061800 Sobic007G061800 Sobic001G364700--Sobic007G061800 Sobic001G364700--Sobic002G128700 Sobic003G114800 Sobic003G114800 Sobic001G364700--Sobic003G114800 Sobic001G364700--Sobic002G225800
Octagon: transcription factors


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