Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G298500.1
Synonym Sb03g034845
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence. (PubMedID : 27586543)
O-methyltransferase, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q646
Pfam PF08100 PF00891
Panther DB PTHR11746 PTHR11746:SF85
NCBI CDD KOG3178; Hydroxyindole-O-methyltransferase and related SAM-dependent methyltransferases
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008171; O-methyltransferase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G35160 : O-methyltransferase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g54969.1 : O-methyltransferase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT72870
Barley -
Wheat TraesCS3A02G292300 , TraesCS3D02G292000 , TraesCS3B02G326900
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G100900 - -
2 Sobic.004G327100 atATG18b, putative, expressed K17908: WIPI1_2, autophagy-related protein 18
3 Sobic.002G063201 - -
4 Sobic.007G087500 hypothetical protein -
5 Sobic.001G452300 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed -
6 Sobic.008G008601 - -
7 Sobic.004G184900 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.008G024000 expressed protein -
9 Sobic.002G063500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
10 Sobic.002G013500 pentatricopeptide, putative, expressed -
11 Sobic.008G053700 - -
12 Sobic.006G004700 erythronate-4-phosphate dehydrogenase domain containing protein, expressed K15919: glyoxylate/hydroxypyruvate reductase
13 Sobic.008G069901 - -
14 Sobic.004G082050 - K02935: RP-L7, MRPL12, large subunit ribosomal protein L7/L12
15 Sobic.003G046000 - -
16 Sobic.003G021401 - -
17 Sobic.010G091750 - -
18 Sobic.004G122700 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase, putative, expressed -
19 Sobic.010G103300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@membrane attack complex component/perforin/complement C9, putative, expressed -
20 Sobic.001G152240 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G298500 Sobic003G298500 Sobic007G100900 Sobic007G100900 Sobic003G298500--Sobic007G100900 Sobic004G327100 Sobic004G327100 Sobic003G298500--Sobic004G327100 Sobic002G063201 Sobic002G063201 Sobic003G298500--Sobic002G063201 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic003G298500--Sobic007G087500 Sobic001G452300 Sobic001G452300 Sobic003G298500--Sobic001G452300 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic003G298500--Sobic008G008601 Sobic004G184900 Sobic004G184900 Sobic003G298500--Sobic004G184900 Sobic008G024000 Sobic008G024000 Sobic003G298500--Sobic008G024000 Sobic002G063500 Sobic002G063500 Sobic003G298500--Sobic002G063500 Sobic007G100900--Sobic004G327100 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic007G100900--Sobic004G122700 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic007G100900--Sobic008G008701 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic007G100900--Sobic005G207550 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic007G100900--Sobic001G138500 Sobic001G190600 Sobic001G190600 Sobic007G100900--Sobic001G190600 Sobic007G100900--Sobic008G008601 Sobic006G137900 Sobic006G137900 Sobic007G100900--Sobic006G137900 Sobic004G090900 Sobic004G090900 Sobic007G100900--Sobic004G090900 Sobic004G327100--Sobic004G122700 Sobic004G327100--Sobic005G207550 Sobic004G327100--Sobic006G137900 Sobic004G327100--Sobic008G008701 Sobic004G327100--Sobic001G138500 Sobic004G327100--Sobic008G008601 Sobic004G327100--Sobic001G190600 Sobic004G327100--Sobic001G452300 Sobic004G327100--Sobic004G090900 Sobic003G021401 Sobic003G021401 Sobic002G063201--Sobic003G021401 Sobic003G120050 Sobic003G120050 Sobic002G063201--Sobic003G120050 Sobic003G023100 Sobic003G023100 Sobic002G063201--Sobic003G023100 Sobic010G228200 Sobic010G228200 Sobic002G063201--Sobic010G228200 Sobic010G146350 Sobic010G146350 Sobic002G063201--Sobic010G146350 Sobic005G207600 Sobic005G207600 Sobic002G063201--Sobic005G207600 Sobic002G063201--Sobic001G452300 Sobic002G063201--Sobic004G327100 Sobic002G063201--Sobic008G008601 Sobic006G004700 Sobic006G004700 Sobic007G087500--Sobic006G004700 Sobic008G053700 Sobic008G053700 Sobic007G087500--Sobic008G053700 Sobic007G087500--Sobic001G452300 Sobic007G087500--Sobic008G008601 Sobic007G087500--Sobic002G063500 Sobic007G087500--Sobic004G184900 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic007G087500--Sobic008G069901 Sobic010G091750 Sobic010G091750 Sobic007G087500--Sobic010G091750 Sobic003G046000 Sobic003G046000 Sobic007G087500--Sobic003G046000 Sobic001G452300--Sobic008G008601 Sobic001G452300--Sobic007G087500 Sobic001G452300--Sobic004G122700 Sobic001G452300--Sobic008G069901 Sobic001G452300--Sobic002G063500 Sobic001G452300--Sobic004G184900 Sobic001G452300--Sobic008G008701 Sobic001G452300--Sobic004G090900 Sobic001G033701 Sobic001G033701 Sobic001G452300--Sobic001G033701 Sobic008G008601--Sobic001G452300 Sobic008G008601--Sobic004G122700 Sobic008G008601--Sobic008G008701 Sobic008G008601--Sobic002G063500 Sobic008G008601--Sobic004G090900 Sobic008G008601--Sobic008G069901 Sobic008G008601--Sobic007G087500 Sobic008G008601--Sobic001G033701 Sobic008G008601--Sobic004G184900 Sobic004G184900--Sobic008G069901 Sobic004G184900--Sobic003G046000 Sobic009G113300 Sobic009G113300 Sobic004G184900--Sobic009G113300 Sobic010G081500 Sobic010G081500 Sobic004G184900--Sobic010G081500 Sobic002G289601 Sobic002G289601 Sobic004G184900--Sobic002G289601 Sobic006G258200 Sobic006G258200 Sobic004G184900--Sobic006G258200 Sobic001G160300 Sobic001G160300 Sobic004G184900--Sobic001G160300 Sobic006G076700 Sobic006G076700 Sobic004G184900--Sobic006G076700 Sobic005G014600 Sobic005G014600 Sobic004G184900--Sobic005G014600 Sobic008G024000--Sobic007G100900 Sobic008G024000--Sobic003G120050 Sobic008G024000--Sobic006G137900 Sobic004G013400 Sobic004G013400 Sobic008G024000--Sobic004G013400 Sobic008G024000--Sobic001G138500 Sobic008G024000--Sobic008G008601 Sobic008G024000--Sobic004G122700 Sobic008G024000--Sobic001G452300 Sobic008G024000--Sobic001G190600 Sobic002G063500--Sobic008G069901 Sobic002G063500--Sobic001G160300 Sobic002G063500--Sobic003G046000 Sobic002G063500--Sobic004G184900 Sobic002G063500--Sobic009G113300 Sobic002G063500--Sobic006G004700 Sobic002G063500--Sobic005G014600 Sobic002G063500--Sobic002G289601 Sobic002G063500--Sobic010G081500
Octagon: transcription factors


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