Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G366000.1
Synonym Sb03g040770
Functional annotation DUF623 domain containing protein, expressed
UniProt C5XQK9
Pfam PF04844
Panther DB PTHR33057 PTHR33057:SF32
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G52525 : ovate family protein 6
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g64430.1 : DUF623 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a026735 , Zm00025a039574 , Zm00025a043795
Brachypodium PNT73242 , KQK06030
Barley HORVU4Hr1G021500.1 , HORVU3Hr1G083700.1 , HORVU1Hr1G074020.1
Wheat TraesCS4A02G198600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G110850 - -
2 Sobic.006G187000 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
3 Sobic.009G060800 carboxyl-terminal proteinase, putative, expressed -
4 Sobic.004G302700 YABBY domain containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.010G192500 anthranilate phosphoribosyltransferase, putative, expressed -
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7 Sobic.001G160000 LSTK-1-like kinase, putative, expressed K08857: NIMA (never in mitosis gene a)-related kinase 1/4/5
8 Sobic.001G046400 expressed protein -
9 Sobic.008G190000 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
10 Sobic.003G089300 heavy-metal-associated domain-containing protein, putative, expressed -
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12 Sobic.009G208300 TOO MANY MOUTHS precursor, putative, expressed -
13 Sobic.008G042200 DUF623 domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G064600 IQ calmodulin-binding motif domain containing protein, expressed -
15 Sobic.001G381100 receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed -
16 Sobic.010G058700 expressed protein -
17 Sobic.009G137500 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
18 Sobic.007G211200 inactive receptor kinase At2g26730 precursor, putative, expressed -
19 Sobic.002G337600 expressed protein -
20 Sobic.006G058000 OsSCP24 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16297: serine carboxypeptidase-like clade II


Gene co-expression network
sample Sobic003G366000 Sobic003G366000 Sobic006G110850 Sobic006G110850 Sobic003G366000--Sobic006G110850 Sobic006G187000 Sobic006G187000 Sobic003G366000--Sobic006G187000 Sobic009G060800 Sobic009G060800 Sobic003G366000--Sobic009G060800 Sobic004G302700 Sobic004G302700 Sobic003G366000--Sobic004G302700 Sobic010G192500 Sobic010G192500 Sobic003G366000--Sobic010G192500 Sobic001G390400 Sobic001G390400 Sobic003G366000--Sobic001G390400 Sobic001G160000 Sobic001G160000 Sobic003G366000--Sobic001G160000 Sobic001G046400 Sobic001G046400 Sobic003G366000--Sobic001G046400 Sobic008G190000 Sobic008G190000 Sobic003G366000--Sobic008G190000 Sobic006G110850--Sobic003G366000 Sobic008G042200 Sobic008G042200 Sobic006G110850--Sobic008G042200 Sobic005G092700 Sobic005G092700 Sobic006G110850--Sobic005G092700 Sobic006G110850--Sobic001G390400 Sobic006G110850--Sobic004G302700 Sobic006G110850--Sobic008G190000 Sobic006G110850--Sobic009G060800 Sobic004G115700 Sobic004G115700 Sobic006G110850--Sobic004G115700 Sobic002G206100 Sobic002G206100 Sobic006G110850--Sobic002G206100 Sobic008G150500 Sobic008G150500 Sobic006G187000--Sobic008G150500 Sobic009G137500 Sobic009G137500 Sobic006G187000--Sobic009G137500 Sobic006G187000--Sobic001G046400 Sobic006G187000--Sobic003G366000 Sobic006G187000--Sobic004G302700 Sobic006G187000--Sobic001G160000 Sobic003G016200 Sobic003G016200 Sobic006G187000--Sobic003G016200 Sobic003G283900 Sobic003G283900 Sobic006G187000--Sobic003G283900 Sobic001G267100 Sobic001G267100 Sobic006G187000--Sobic001G267100 Sobic009G060800--Sobic010G192500 Sobic003G089300 Sobic003G089300 Sobic009G060800--Sobic003G089300 Sobic009G060800--Sobic003G366000 Sobic009G208300 Sobic009G208300 Sobic009G060800--Sobic009G208300 Sobic009G060800--Sobic004G302700 Sobic001G064600 Sobic001G064600 Sobic009G060800--Sobic001G064600 Sobic001G473500 Sobic001G473500 Sobic009G060800--Sobic001G473500 Sobic001G286700 Sobic001G286700 Sobic009G060800--Sobic001G286700 Sobic009G060800--Sobic001G390400 Sobic004G302700--Sobic001G046400 Sobic004G302700--Sobic003G366000 Sobic001G135600 Sobic001G135600 Sobic004G302700--Sobic001G135600 Sobic004G302700--Sobic006G187000 Sobic009G141300 Sobic009G141300 Sobic004G302700--Sobic009G141300 Sobic004G302700--Sobic008G150500 Sobic004G302700--Sobic003G283900 Sobic002G011000 Sobic002G011000 Sobic004G302700--Sobic002G011000 Sobic007G115400 Sobic007G115400 Sobic004G302700--Sobic007G115400 Sobic010G192500--Sobic009G060800 Sobic010G192500--Sobic003G089300 Sobic002G337600 Sobic002G337600 Sobic010G192500--Sobic002G337600 Sobic010G192500--Sobic003G366000 Sobic010G241100 Sobic010G241100 Sobic010G192500--Sobic010G241100 Sobic001G155700 Sobic001G155700 Sobic010G192500--Sobic001G155700 Sobic001G493900 Sobic001G493900 Sobic010G192500--Sobic001G493900 Sobic002G319300 Sobic002G319300 Sobic010G192500--Sobic002G319300 Sobic010G192500--Sobic009G208300 Sobic001G390400--Sobic003G366000 Sobic005G163400 Sobic005G163400 Sobic001G390400--Sobic005G163400 Sobic006G050900 Sobic006G050900 Sobic001G390400--Sobic006G050900 Sobic002G050700 Sobic002G050700 Sobic001G390400--Sobic002G050700 Sobic001G390400--Sobic010G192500 Sobic004G317200 Sobic004G317200 Sobic001G390400--Sobic004G317200 Sobic001G390400--Sobic002G319300 Sobic010G024500 Sobic010G024500 Sobic001G390400--Sobic010G024500 Sobic006G142500 Sobic006G142500 Sobic001G390400--Sobic006G142500 Sobic001G160000--Sobic006G187000 Sobic001G160000--Sobic008G190000 Sobic001G160000--Sobic003G366000 Sobic001G381100 Sobic001G381100 Sobic001G160000--Sobic001G381100 Sobic001G160000--Sobic005G092700 Sobic001G160000--Sobic010G192500 Sobic001G075700 Sobic001G075700 Sobic001G160000--Sobic001G075700 Sobic001G160000--Sobic001G267100 Sobic005G091000 Sobic005G091000 Sobic001G160000--Sobic005G091000 Sobic007G211200 Sobic007G211200 Sobic001G046400--Sobic007G211200 Sobic001G046400--Sobic008G150500 Sobic001G046400--Sobic006G187000 Sobic001G046400--Sobic004G302700 Sobic004G342000 Sobic004G342000 Sobic001G046400--Sobic004G342000 Sobic001G046400--Sobic002G337600 Sobic001G046400--Sobic003G016200 Sobic004G211700 Sobic004G211700 Sobic001G046400--Sobic004G211700 Sobic001G046400--Sobic003G283900 Sobic008G190000--Sobic001G381100 Sobic008G190000--Sobic005G092700 Sobic008G190000--Sobic001G160000 Sobic008G190000--Sobic010G024500 Sobic008G190000--Sobic003G366000 Sobic008G190000--Sobic008G042200 Sobic002G286700 Sobic002G286700 Sobic008G190000--Sobic002G286700 Sobic009G200000 Sobic009G200000 Sobic008G190000--Sobic009G200000 Sobic008G190000--Sobic004G115700
Octagon: transcription factors


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