Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G058700.1
Synonym Sb10g005070
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Z5C3
Pfam PF04195
Panther DB PTHR31099
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G51172 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g06950.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a049841
Brachypodium KQK19292
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G366000 DUF623 domain containing protein, expressed -
2 Sobic.001G064600 IQ calmodulin-binding motif domain containing protein, expressed -
3 Sobic.006G187000 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
4 Sobic.004G302700 YABBY domain containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.009G208300 TOO MANY MOUTHS precursor, putative, expressed -
6 Sobic.001G390400 expressed protein -
7 Sobic.010G192500 anthranilate phosphoribosyltransferase, putative, expressed -
8 Sobic.009G060800 carboxyl-terminal proteinase, putative, expressed -
9 Sobic.001G046400 expressed protein -
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11 Sobic.008G190000 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
12 Sobic.008G150500 - -
13 Sobic.003G283900 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
14 Sobic.009G137500 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
15 Sobic.008G042200 DUF623 domain containing protein, expressed -
16 Sobic.006G110850 - -
17 Sobic.003G041900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@DUF581 domain containing protein, expressed -
18 Sobic.001G473500 domain of unknown function DUF966 domain containing protein, expressed -
19 Sobic.003G089300 heavy-metal-associated domain-containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.002G315500 ankyrin repeat domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G058700 Sobic010G058700 Sobic003G366000 Sobic003G366000 Sobic010G058700--Sobic003G366000 Sobic001G064600 Sobic001G064600 Sobic010G058700--Sobic001G064600 Sobic006G187000 Sobic006G187000 Sobic010G058700--Sobic006G187000 Sobic004G302700 Sobic004G302700 Sobic010G058700--Sobic004G302700 Sobic009G208300 Sobic009G208300 Sobic010G058700--Sobic009G208300 Sobic001G390400 Sobic001G390400 Sobic010G058700--Sobic001G390400 Sobic010G192500 Sobic010G192500 Sobic010G058700--Sobic010G192500 Sobic009G060800 Sobic009G060800 Sobic010G058700--Sobic009G060800 Sobic001G046400 Sobic001G046400 Sobic010G058700--Sobic001G046400 Sobic006G110850 Sobic006G110850 Sobic003G366000--Sobic006G110850 Sobic003G366000--Sobic006G187000 Sobic003G366000--Sobic009G060800 Sobic003G366000--Sobic004G302700 Sobic003G366000--Sobic010G192500 Sobic003G366000--Sobic001G390400 Sobic001G160000 Sobic001G160000 Sobic003G366000--Sobic001G160000 Sobic003G366000--Sobic001G046400 Sobic008G190000 Sobic008G190000 Sobic003G366000--Sobic008G190000 Sobic001G064600--Sobic009G060800 Sobic001G064600--Sobic003G366000 Sobic001G064600--Sobic010G192500 Sobic001G064600--Sobic010G058700 Sobic001G064600--Sobic006G187000 Sobic001G008300 Sobic001G008300 Sobic001G064600--Sobic001G008300 Sobic001G064600--Sobic009G208300 Sobic001G064600--Sobic004G302700 Sobic009G174100 Sobic009G174100 Sobic001G064600--Sobic009G174100 Sobic008G150500 Sobic008G150500 Sobic006G187000--Sobic008G150500 Sobic009G137500 Sobic009G137500 Sobic006G187000--Sobic009G137500 Sobic006G187000--Sobic001G046400 Sobic006G187000--Sobic003G366000 Sobic006G187000--Sobic004G302700 Sobic006G187000--Sobic001G160000 Sobic003G016200 Sobic003G016200 Sobic006G187000--Sobic003G016200 Sobic003G283900 Sobic003G283900 Sobic006G187000--Sobic003G283900 Sobic001G267100 Sobic001G267100 Sobic006G187000--Sobic001G267100 Sobic004G302700--Sobic001G046400 Sobic004G302700--Sobic003G366000 Sobic001G135600 Sobic001G135600 Sobic004G302700--Sobic001G135600 Sobic004G302700--Sobic006G187000 Sobic009G141300 Sobic009G141300 Sobic004G302700--Sobic009G141300 Sobic004G302700--Sobic008G150500 Sobic004G302700--Sobic003G283900 Sobic002G011000 Sobic002G011000 Sobic004G302700--Sobic002G011000 Sobic007G115400 Sobic007G115400 Sobic004G302700--Sobic007G115400 Sobic009G208300--Sobic009G060800 Sobic009G208300--Sobic010G192500 Sobic007G209200 Sobic007G209200 Sobic009G208300--Sobic007G209200 Sobic009G208300--Sobic003G366000 Sobic001G473500 Sobic001G473500 Sobic009G208300--Sobic001G473500 Sobic009G208300--Sobic001G390400 Sobic001G286700 Sobic001G286700 Sobic009G208300--Sobic001G286700 Sobic009G188500 Sobic009G188500 Sobic009G208300--Sobic009G188500 Sobic009G208300--Sobic001G046400 Sobic001G390400--Sobic003G366000 Sobic005G163400 Sobic005G163400 Sobic001G390400--Sobic005G163400 Sobic006G050900 Sobic006G050900 Sobic001G390400--Sobic006G050900 Sobic002G050700 Sobic002G050700 Sobic001G390400--Sobic002G050700 Sobic001G390400--Sobic010G192500 Sobic004G317200 Sobic004G317200 Sobic001G390400--Sobic004G317200 Sobic002G319300 Sobic002G319300 Sobic001G390400--Sobic002G319300 Sobic010G024500 Sobic010G024500 Sobic001G390400--Sobic010G024500 Sobic006G142500 Sobic006G142500 Sobic001G390400--Sobic006G142500 Sobic010G192500--Sobic009G060800 Sobic003G089300 Sobic003G089300 Sobic010G192500--Sobic003G089300 Sobic002G337600 Sobic002G337600 Sobic010G192500--Sobic002G337600 Sobic010G192500--Sobic003G366000 Sobic010G241100 Sobic010G241100 Sobic010G192500--Sobic010G241100 Sobic001G155700 Sobic001G155700 Sobic010G192500--Sobic001G155700 Sobic001G493900 Sobic001G493900 Sobic010G192500--Sobic001G493900 Sobic010G192500--Sobic002G319300 Sobic010G192500--Sobic009G208300 Sobic009G060800--Sobic010G192500 Sobic009G060800--Sobic003G089300 Sobic009G060800--Sobic003G366000 Sobic009G060800--Sobic009G208300 Sobic009G060800--Sobic004G302700 Sobic009G060800--Sobic001G064600 Sobic009G060800--Sobic001G473500 Sobic009G060800--Sobic001G286700 Sobic009G060800--Sobic001G390400 Sobic007G211200 Sobic007G211200 Sobic001G046400--Sobic007G211200 Sobic001G046400--Sobic008G150500 Sobic001G046400--Sobic006G187000 Sobic001G046400--Sobic004G302700 Sobic004G342000 Sobic004G342000 Sobic001G046400--Sobic004G342000 Sobic001G046400--Sobic002G337600 Sobic001G046400--Sobic003G016200 Sobic004G211700 Sobic004G211700 Sobic001G046400--Sobic004G211700 Sobic001G046400--Sobic003G283900
Octagon: transcription factors


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