Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G150500.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R6T7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g47910.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G187000 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
2 Sobic.001G046400 expressed protein -
3 Sobic.003G283900 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
4 Sobic.004G211800 - -
5 Sobic.003G016200 expressed protein -
6 Sobic.004G302700 YABBY domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.002G029700 DUF640 domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.009G137500 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
9 Sobic.004G342000 WAX2, putative, expressed K15404: K15404, aldehyde decarbonylase
10 Sobic.006G151800 OsRR5 type-A response regulator, expressed K14492: two-component response regulator ARR-A family
11 Sobic.002G035000 OsGrx_C10 - glutaredoxin subgroup III, expressed K03676: grxC, GLRX, glutaredoxin 3
12 Sobic.003G366000 DUF623 domain containing protein, expressed -
13 Sobic.002G011000 expressed protein -
14 Sobic.006G160800 YABBY domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.007G115400 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
16 Sobic.001G119200 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
17 Sobic.010G077700 ZOS6-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
18 Sobic.005G042200 homeobox domain containing protein, expressed -
19 Sobic.002G380800 - -
20 Sobic.001G341700 "GS3(Ortholog in rice:Mao et al., 2010(PubMedID : 31659843)@ Li et al., 2010)"(PubMedID : 32497208)@keratin-associated protein 5-4, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G150500 Sobic008G150500 Sobic006G187000 Sobic006G187000 Sobic008G150500--Sobic006G187000 Sobic001G046400 Sobic001G046400 Sobic008G150500--Sobic001G046400 Sobic003G283900 Sobic003G283900 Sobic008G150500--Sobic003G283900 Sobic004G211800 Sobic004G211800 Sobic008G150500--Sobic004G211800 Sobic003G016200 Sobic003G016200 Sobic008G150500--Sobic003G016200 Sobic004G302700 Sobic004G302700 Sobic008G150500--Sobic004G302700 Sobic002G029700 Sobic002G029700 Sobic008G150500--Sobic002G029700 Sobic009G137500 Sobic009G137500 Sobic008G150500--Sobic009G137500 Sobic004G342000 Sobic004G342000 Sobic008G150500--Sobic004G342000 Sobic006G187000--Sobic008G150500 Sobic006G187000--Sobic009G137500 Sobic006G187000--Sobic001G046400 Sobic003G366000 Sobic003G366000 Sobic006G187000--Sobic003G366000 Sobic006G187000--Sobic004G302700 Sobic001G160000 Sobic001G160000 Sobic006G187000--Sobic001G160000 Sobic006G187000--Sobic003G016200 Sobic006G187000--Sobic003G283900 Sobic001G267100 Sobic001G267100 Sobic006G187000--Sobic001G267100 Sobic007G211200 Sobic007G211200 Sobic001G046400--Sobic007G211200 Sobic001G046400--Sobic008G150500 Sobic001G046400--Sobic006G187000 Sobic001G046400--Sobic004G302700 Sobic001G046400--Sobic004G342000 Sobic002G337600 Sobic002G337600 Sobic001G046400--Sobic002G337600 Sobic001G046400--Sobic003G016200 Sobic004G211700 Sobic004G211700 Sobic001G046400--Sobic004G211700 Sobic001G046400--Sobic003G283900 Sobic003G283900--Sobic003G016200 Sobic003G283900--Sobic004G211800 Sobic003G283900--Sobic008G150500 Sobic003G283900--Sobic001G046400 Sobic003G283900--Sobic004G302700 Sobic003G283900--Sobic006G187000 Sobic007G115400 Sobic007G115400 Sobic003G283900--Sobic007G115400 Sobic003G283900--Sobic004G211700 Sobic010G023400 Sobic010G023400 Sobic003G283900--Sobic010G023400 Sobic004G211800--Sobic003G283900 Sobic004G211800--Sobic008G150500 Sobic004G211800--Sobic002G029700 Sobic008G012600 Sobic008G012600 Sobic004G211800--Sobic008G012600 Sobic006G151800 Sobic006G151800 Sobic004G211800--Sobic006G151800 Sobic004G211800--Sobic004G342000 Sobic004G211800--Sobic003G016200 Sobic006G160800 Sobic006G160800 Sobic004G211800--Sobic006G160800 Sobic004G211800--Sobic001G046400 Sobic003G016200--Sobic003G283900 Sobic003G016200--Sobic001G046400 Sobic003G016200--Sobic008G150500 Sobic003G016200--Sobic006G187000 Sobic003G016200--Sobic004G211800 Sobic003G016200--Sobic004G302700 Sobic003G016200--Sobic004G342000 Sobic003G016200--Sobic009G137500 Sobic003G016200--Sobic002G029700 Sobic004G302700--Sobic001G046400 Sobic004G302700--Sobic003G366000 Sobic001G135600 Sobic001G135600 Sobic004G302700--Sobic001G135600 Sobic004G302700--Sobic006G187000 Sobic009G141300 Sobic009G141300 Sobic004G302700--Sobic009G141300 Sobic004G302700--Sobic008G150500 Sobic004G302700--Sobic003G283900 Sobic002G011000 Sobic002G011000 Sobic004G302700--Sobic002G011000 Sobic004G302700--Sobic007G115400 Sobic002G029700--Sobic006G151800 Sobic006G098300 Sobic006G098300 Sobic002G029700--Sobic006G098300 Sobic001G334501 Sobic001G334501 Sobic002G029700--Sobic001G334501 Sobic005G089700 Sobic005G089700 Sobic002G029700--Sobic005G089700 Sobic005G226500 Sobic005G226500 Sobic002G029700--Sobic005G226500 Sobic007G048500 Sobic007G048500 Sobic002G029700--Sobic007G048500 Sobic009G075000 Sobic009G075000 Sobic002G029700--Sobic009G075000 Sobic007G098600 Sobic007G098600 Sobic002G029700--Sobic007G098600 Sobic003G088200 Sobic003G088200 Sobic002G029700--Sobic003G088200 Sobic009G137500--Sobic006G187000 Sobic009G137500--Sobic001G267100 Sobic006G105600 Sobic006G105600 Sobic009G137500--Sobic006G105600 Sobic006G255300 Sobic006G255300 Sobic009G137500--Sobic006G255300 Sobic009G137500--Sobic003G366000 Sobic009G137500--Sobic003G016200 Sobic001G276800 Sobic001G276800 Sobic009G137500--Sobic001G276800 Sobic009G137500--Sobic008G150500 Sobic009G137500--Sobic001G046400 Sobic005G218000 Sobic005G218000 Sobic004G342000--Sobic005G218000 Sobic001G341700 Sobic001G341700 Sobic004G342000--Sobic001G341700 Sobic004G342000--Sobic004G211700 Sobic004G342000--Sobic002G029700 Sobic007G076100 Sobic007G076100 Sobic004G342000--Sobic007G076100 Sobic004G342000--Sobic008G012600 Sobic002G416400 Sobic002G416400 Sobic004G342000--Sobic002G416400 Sobic004G342000--Sobic006G151800 Sobic006G089700 Sobic006G089700 Sobic004G342000--Sobic006G089700
Octagon: transcription factors


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