Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G016200.1
Synonym Sb03g001600
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XKF4
Pfam -
Panther DB PTHR15537 PTHR15537:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G36000 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g11990.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a022889
Brachypodium KQK03326
Barley HORVU3Hr1G029340.16 , HORVU3Hr1G029340.14 , HORVU3Hr1G029290.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G283900 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
2 Sobic.001G046400 expressed protein -
3 Sobic.008G150500 - -
4 Sobic.006G187000 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
5 Sobic.004G211800 - -
6 Sobic.004G302700 YABBY domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.004G342000 WAX2, putative, expressed K15404: K15404, aldehyde decarbonylase
8 Sobic.009G137500 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
9 Sobic.002G029700 DUF640 domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.007G211200 inactive receptor kinase At2g26730 precursor, putative, expressed -
11 Sobic.004G211700 - -
12 Sobic.002G337600 expressed protein -
13 Sobic.001G341700 "GS3(Ortholog in rice:Mao et al., 2010(PubMedID : 31659843)@ Li et al., 2010)"(PubMedID : 32497208)@keratin-associated protein 5-4, putative, expressed -
14 Sobic.002G011000 expressed protein -
15 Sobic.006G151800 OsRR5 type-A response regulator, expressed K14492: two-component response regulator ARR-A family
16 Sobic.003G366000 DUF623 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.001G473500 domain of unknown function DUF966 domain containing protein, expressed -
18 Sobic.010G241100 thaumatin family domain containing protein, expressed -
19 Sobic.007G115400 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
20 Sobic.010G077700 ZOS6-02 - C2H2 zinc finger protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G016200 Sobic003G016200 Sobic003G283900 Sobic003G283900 Sobic003G016200--Sobic003G283900 Sobic001G046400 Sobic001G046400 Sobic003G016200--Sobic001G046400 Sobic008G150500 Sobic008G150500 Sobic003G016200--Sobic008G150500 Sobic006G187000 Sobic006G187000 Sobic003G016200--Sobic006G187000 Sobic004G211800 Sobic004G211800 Sobic003G016200--Sobic004G211800 Sobic004G302700 Sobic004G302700 Sobic003G016200--Sobic004G302700 Sobic004G342000 Sobic004G342000 Sobic003G016200--Sobic004G342000 Sobic009G137500 Sobic009G137500 Sobic003G016200--Sobic009G137500 Sobic002G029700 Sobic002G029700 Sobic003G016200--Sobic002G029700 Sobic003G283900--Sobic003G016200 Sobic003G283900--Sobic004G211800 Sobic003G283900--Sobic008G150500 Sobic003G283900--Sobic001G046400 Sobic003G283900--Sobic004G302700 Sobic003G283900--Sobic006G187000 Sobic007G115400 Sobic007G115400 Sobic003G283900--Sobic007G115400 Sobic004G211700 Sobic004G211700 Sobic003G283900--Sobic004G211700 Sobic010G023400 Sobic010G023400 Sobic003G283900--Sobic010G023400 Sobic007G211200 Sobic007G211200 Sobic001G046400--Sobic007G211200 Sobic001G046400--Sobic008G150500 Sobic001G046400--Sobic006G187000 Sobic001G046400--Sobic004G302700 Sobic001G046400--Sobic004G342000 Sobic002G337600 Sobic002G337600 Sobic001G046400--Sobic002G337600 Sobic001G046400--Sobic003G016200 Sobic001G046400--Sobic004G211700 Sobic001G046400--Sobic003G283900 Sobic008G150500--Sobic006G187000 Sobic008G150500--Sobic001G046400 Sobic008G150500--Sobic003G283900 Sobic008G150500--Sobic004G211800 Sobic008G150500--Sobic003G016200 Sobic008G150500--Sobic004G302700 Sobic008G150500--Sobic002G029700 Sobic008G150500--Sobic009G137500 Sobic008G150500--Sobic004G342000 Sobic006G187000--Sobic008G150500 Sobic006G187000--Sobic009G137500 Sobic006G187000--Sobic001G046400 Sobic003G366000 Sobic003G366000 Sobic006G187000--Sobic003G366000 Sobic006G187000--Sobic004G302700 Sobic001G160000 Sobic001G160000 Sobic006G187000--Sobic001G160000 Sobic006G187000--Sobic003G016200 Sobic006G187000--Sobic003G283900 Sobic001G267100 Sobic001G267100 Sobic006G187000--Sobic001G267100 Sobic004G211800--Sobic003G283900 Sobic004G211800--Sobic008G150500 Sobic004G211800--Sobic002G029700 Sobic008G012600 Sobic008G012600 Sobic004G211800--Sobic008G012600 Sobic006G151800 Sobic006G151800 Sobic004G211800--Sobic006G151800 Sobic004G211800--Sobic004G342000 Sobic004G211800--Sobic003G016200 Sobic006G160800 Sobic006G160800 Sobic004G211800--Sobic006G160800 Sobic004G211800--Sobic001G046400 Sobic004G302700--Sobic001G046400 Sobic004G302700--Sobic003G366000 Sobic001G135600 Sobic001G135600 Sobic004G302700--Sobic001G135600 Sobic004G302700--Sobic006G187000 Sobic009G141300 Sobic009G141300 Sobic004G302700--Sobic009G141300 Sobic004G302700--Sobic008G150500 Sobic004G302700--Sobic003G283900 Sobic002G011000 Sobic002G011000 Sobic004G302700--Sobic002G011000 Sobic004G302700--Sobic007G115400 Sobic005G218000 Sobic005G218000 Sobic004G342000--Sobic005G218000 Sobic001G341700 Sobic001G341700 Sobic004G342000--Sobic001G341700 Sobic004G342000--Sobic004G211700 Sobic004G342000--Sobic002G029700 Sobic007G076100 Sobic007G076100 Sobic004G342000--Sobic007G076100 Sobic004G342000--Sobic008G012600 Sobic002G416400 Sobic002G416400 Sobic004G342000--Sobic002G416400 Sobic004G342000--Sobic006G151800 Sobic006G089700 Sobic006G089700 Sobic004G342000--Sobic006G089700 Sobic009G137500--Sobic006G187000 Sobic009G137500--Sobic001G267100 Sobic006G105600 Sobic006G105600 Sobic009G137500--Sobic006G105600 Sobic006G255300 Sobic006G255300 Sobic009G137500--Sobic006G255300 Sobic009G137500--Sobic003G366000 Sobic009G137500--Sobic003G016200 Sobic001G276800 Sobic001G276800 Sobic009G137500--Sobic001G276800 Sobic009G137500--Sobic008G150500 Sobic009G137500--Sobic001G046400 Sobic002G029700--Sobic006G151800 Sobic006G098300 Sobic006G098300 Sobic002G029700--Sobic006G098300 Sobic001G334501 Sobic001G334501 Sobic002G029700--Sobic001G334501 Sobic005G089700 Sobic005G089700 Sobic002G029700--Sobic005G089700 Sobic005G226500 Sobic005G226500 Sobic002G029700--Sobic005G226500 Sobic007G048500 Sobic007G048500 Sobic002G029700--Sobic007G048500 Sobic009G075000 Sobic009G075000 Sobic002G029700--Sobic009G075000 Sobic007G098600 Sobic007G098600 Sobic002G029700--Sobic007G098600 Sobic003G088200 Sobic003G088200 Sobic002G029700--Sobic003G088200
Octagon: transcription factors


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