Gene annotation
Transcriptome id
Sobic.003G398600.1
Synonym
AGL103, Sb03g043520
Functional annotation
OsMADS98 - MADS-box family gene with M-beta type-box, expressed
UniProt
A0A1W0W153
Pfam
PF00319
Panther DB
PTHR11945
PTHR11945:SF226
NCBI CDD
-
KEGG Orthology
-
Gene Ontology
GO:0003677 ; DNA binding
Orthologs (automatic annotation)
TAIR
AT3G18650 : AGAMOUS-like 103
RAP-DB (Rice)
LOC_Os01g68560.1 : OsMADS98 - MADS-box family gene with M-beta type-box, expressed
MaizeGDB (Corn)
-
Brachypodium
-
Barley
-
Wheat
-
Populus
-
JBrowse
Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot
Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles
Rank
Gene
Function
KEGG orthology
1
Sobic.010G081300
expressed protein
-
2
Sobic.005G009900
pectinesterase, putative, expressed
-
3
Sobic.007G048300
berberine and berberine like domain containing protein, expressed
-
4
Sobic.001G419400
Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@DnaK family protein, putative, expressed
K03283 : heat shock 70kDa protein 1/2/6/8
5
Sobic.004G029200
-
-
6
Sobic.004G015000
DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed
-
7
Sobic.005G189500
expressed protein
-
8
Sobic.002G331900
CRP8 - Cysteine-rich family protein precursor, expressed
-
9
Sobic.003G066600
expressed protein
-
10
Sobic.001G538200
-
-
11
Sobic.005G141200
plant protein of unknown function domain containing protein, expressed
-
12
Sobic.003G108500
glycosyltransferase, putative, expressed
-
13
Sobic.003G404800
OsFBO21 - F-box and other domain containing protein, expressed
-
14
Sobic.007G125800
expressed protein
-
15
Sobic.008G130350
-
-
16
Sobic.003G092000
expressed protein
K04506 : E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
17
Sobic.008G017600
Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@no apical meristem protein, putative, expressed
-
18
Sobic.003G031600
expressed protein
-
19
Sobic.003G279000
aspartic proteinase nepenthesin precursor, putative, expressed
-
20
Sobic.001G494700
nodulin, putative, expressed
-
Gene co-expression network
sample
Sobic003G398600
Sobic003G398600
Sobic010G081300
Sobic010G081300
Sobic003G398600--Sobic010G081300
Sobic005G009900
Sobic005G009900
Sobic003G398600--Sobic005G009900
Sobic007G048300
Sobic007G048300
Sobic003G398600--Sobic007G048300
Sobic001G419400
Sobic001G419400
Sobic003G398600--Sobic001G419400
Sobic004G029200
Sobic004G029200
Sobic003G398600--Sobic004G029200
Sobic004G015000
Sobic004G015000
Sobic003G398600--Sobic004G015000
Sobic005G189500
Sobic005G189500
Sobic003G398600--Sobic005G189500
Sobic002G331900
Sobic002G331900
Sobic003G398600--Sobic002G331900
Sobic003G066600
Sobic003G066600
Sobic003G398600--Sobic003G066600
Sobic010G081300--Sobic004G029200
Sobic010G081300--Sobic005G009900
Sobic010G081300--Sobic003G398600
Sobic008G130350
Sobic008G130350
Sobic010G081300--Sobic008G130350
Sobic003G279000
Sobic003G279000
Sobic010G081300--Sobic003G279000
Sobic001G538200
Sobic001G538200
Sobic010G081300--Sobic001G538200
Sobic001G494700
Sobic001G494700
Sobic010G081300--Sobic001G494700
Sobic001G129750
Sobic001G129750
Sobic010G081300--Sobic001G129750
Sobic003G020900
Sobic003G020900
Sobic010G081300--Sobic003G020900
Sobic005G009900--Sobic004G029200
Sobic005G009900--Sobic003G279000
Sobic005G009900--Sobic002G331900
Sobic005G009900--Sobic010G081300
Sobic005G009900--Sobic007G048300
Sobic005G009900--Sobic001G494700
Sobic005G009900--Sobic008G130350
Sobic005G009900--Sobic001G129750
Sobic005G009900--Sobic003G020900
Sobic007G048300--Sobic004G015000
Sobic007G048300--Sobic005G189500
Sobic007G125800
Sobic007G125800
Sobic007G048300--Sobic007G125800
Sobic007G048300--Sobic005G009900
Sobic007G048300--Sobic001G419400
Sobic007G048300--Sobic003G398600
Sobic009G019550
Sobic009G019550
Sobic007G048300--Sobic009G019550
Sobic010G035100
Sobic010G035100
Sobic007G048300--Sobic010G035100
Sobic007G048300--Sobic002G331900
Sobic001G419400--Sobic007G048300
Sobic001G419400--Sobic004G015000
Sobic001G419400--Sobic005G009900
Sobic001G419400--Sobic003G398600
Sobic001G419400--Sobic005G189500
Sobic001G419400--Sobic007G125800
Sobic001G419400--Sobic010G081300
Sobic001G419400--Sobic002G331900
Sobic001G419400--Sobic004G029200
Sobic004G029200--Sobic005G009900
Sobic004G029200--Sobic003G279000
Sobic004G029200--Sobic008G130350
Sobic004G029200--Sobic001G129750
Sobic004G029200--Sobic003G020900
Sobic004G029200--Sobic001G494700
Sobic003G262000
Sobic003G262000
Sobic004G029200--Sobic003G262000
Sobic001G302000
Sobic001G302000
Sobic004G029200--Sobic001G302000
Sobic004G029200--Sobic010G081300
Sobic004G015000--Sobic005G189500
Sobic004G015000--Sobic007G048300
Sobic004G015000--Sobic007G125800
Sobic004G015000--Sobic009G019550
Sobic004G015000--Sobic010G035100
Sobic002G346700
Sobic002G346700
Sobic004G015000--Sobic002G346700
Sobic003G020700
Sobic003G020700
Sobic004G015000--Sobic003G020700
Sobic002G258500
Sobic002G258500
Sobic004G015000--Sobic002G258500
Sobic009G180700
Sobic009G180700
Sobic004G015000--Sobic009G180700
Sobic005G189500--Sobic004G015000
Sobic005G189500--Sobic007G125800
Sobic005G189500--Sobic007G048300
Sobic005G189500--Sobic009G019550
Sobic005G189500--Sobic010G035100
Sobic005G189500--Sobic002G346700
Sobic003G092400
Sobic003G092400
Sobic005G189500--Sobic003G092400
Sobic005G189500--Sobic003G020700
Sobic005G189500--Sobic002G258500
Sobic002G331900--Sobic005G009900
Sobic002G331900--Sobic004G029200
Sobic003G284400
Sobic003G284400
Sobic002G331900--Sobic003G284400
Sobic002G331900--Sobic003G279000
Sobic002G331900--Sobic007G048300
Sobic002G331900--Sobic001G494700
Sobic002G331900--Sobic004G015000
Sobic002G331900--Sobic010G081300
Sobic002G331900--Sobic003G398600
Sobic003G066600--Sobic001G538200
Sobic003G031600
Sobic003G031600
Sobic003G066600--Sobic003G031600
Sobic004G285300
Sobic004G285300
Sobic003G066600--Sobic004G285300
Sobic004G108300
Sobic004G108300
Sobic003G066600--Sobic004G108300
Sobic004G099000
Sobic004G099000
Sobic003G066600--Sobic004G099000
Sobic003G066600--Sobic008G130350
Sobic003G066600--Sobic010G081300
Sobic004G015050
Sobic004G015050
Sobic003G066600--Sobic004G015050
Sobic002G080500
Sobic002G080500
Sobic003G066600--Sobic002G080500
Octagon: transcription factors