Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G089100.1
Synonym Sb04g007370
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XY04
Pfam -
Panther DB PTHR33237 PTHR33237:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G71740 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g11950.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G028566 - -
2 Sobic.006G101900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@transporter family protein, putative, expressed -
3 Sobic.004G187600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10664: E3 ubiquitin-protein ligase ATL6/9/15/31/42/55
4 Sobic.006G133300 expressed protein -
5 Sobic.005G219500 cytochrome P450, putative, expressed -
6 Sobic.001G416100 - -
7 Sobic.001G414800 dirigent, putative, expressed -
8 Sobic.007G005100 L-asparaginase precursor protein, putative, expressed K13051: ASRGL1, L-asparaginase / beta-aspartyl-peptidase
9 Sobic.009G225800 expressed protein -
10 Sobic.001G319300 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
11 Sobic.005G217766 - -
12 Sobic.006G019700 transferase family protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G392100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
14 Sobic.007G206800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@lectin-like protein kinase, putative, expressed -
15 Sobic.002G068000 expressed protein -
16 Sobic.007G086300 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed -
17 Sobic.003G064800 dirigent, putative, expressed -
18 Sobic.001G070100 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR1 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -
19 Sobic.010G191600 cytochrome P450, putative, expressed -
20 Sobic.001G507100 dirigent, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G089100 Sobic004G089100 Sobic002G028566 Sobic002G028566 Sobic004G089100--Sobic002G028566 Sobic006G101900 Sobic006G101900 Sobic004G089100--Sobic006G101900 Sobic004G187600 Sobic004G187600 Sobic004G089100--Sobic004G187600 Sobic006G133300 Sobic006G133300 Sobic004G089100--Sobic006G133300 Sobic005G219500 Sobic005G219500 Sobic004G089100--Sobic005G219500 Sobic001G416100 Sobic001G416100 Sobic004G089100--Sobic001G416100 Sobic001G414800 Sobic001G414800 Sobic004G089100--Sobic001G414800 Sobic007G005100 Sobic007G005100 Sobic004G089100--Sobic007G005100 Sobic009G225800 Sobic009G225800 Sobic004G089100--Sobic009G225800 Sobic002G028566--Sobic005G219500 Sobic002G028566--Sobic004G089100 Sobic002G028566--Sobic004G187600 Sobic001G506900 Sobic001G506900 Sobic002G028566--Sobic001G506900 Sobic001G271200 Sobic001G271200 Sobic002G028566--Sobic001G271200 Sobic002G178200 Sobic002G178200 Sobic002G028566--Sobic002G178200 Sobic002G028566--Sobic007G005100 Sobic003G317300 Sobic003G317300 Sobic002G028566--Sobic003G317300 Sobic002G028566--Sobic009G225800 Sobic006G101900--Sobic001G414800 Sobic005G097400 Sobic005G097400 Sobic006G101900--Sobic005G097400 Sobic001G499900 Sobic001G499900 Sobic006G101900--Sobic001G499900 Sobic006G101900--Sobic006G133300 Sobic006G101900--Sobic009G225800 Sobic010G191600 Sobic010G191600 Sobic006G101900--Sobic010G191600 Sobic001G507100 Sobic001G507100 Sobic006G101900--Sobic001G507100 Sobic008G022100 Sobic008G022100 Sobic006G101900--Sobic008G022100 Sobic003G167300 Sobic003G167300 Sobic006G101900--Sobic003G167300 Sobic004G187600--Sobic009G225800 Sobic005G212800 Sobic005G212800 Sobic004G187600--Sobic005G212800 Sobic009G136800 Sobic009G136800 Sobic004G187600--Sobic009G136800 Sobic001G234100 Sobic001G234100 Sobic004G187600--Sobic001G234100 Sobic005G101000 Sobic005G101000 Sobic004G187600--Sobic005G101000 Sobic004G299500 Sobic004G299500 Sobic004G187600--Sobic004G299500 Sobic004G187600--Sobic005G219500 Sobic001G395900 Sobic001G395900 Sobic004G187600--Sobic001G395900 Sobic006G230100 Sobic006G230100 Sobic004G187600--Sobic006G230100 Sobic006G133300--Sobic001G499900 Sobic006G133300--Sobic010G191600 Sobic007G206800 Sobic007G206800 Sobic006G133300--Sobic007G206800 Sobic002G391400 Sobic002G391400 Sobic006G133300--Sobic002G391400 Sobic009G065700 Sobic009G065700 Sobic006G133300--Sobic009G065700 Sobic005G217766 Sobic005G217766 Sobic006G133300--Sobic005G217766 Sobic006G133300--Sobic001G414800 Sobic006G133300--Sobic003G167300 Sobic010G191700 Sobic010G191700 Sobic006G133300--Sobic010G191700 Sobic001G181600 Sobic001G181600 Sobic005G219500--Sobic001G181600 Sobic003G154500 Sobic003G154500 Sobic005G219500--Sobic003G154500 Sobic001G218400 Sobic001G218400 Sobic005G219500--Sobic001G218400 Sobic007G015000 Sobic007G015000 Sobic005G219500--Sobic007G015000 Sobic006G097900 Sobic006G097900 Sobic005G219500--Sobic006G097900 Sobic005G219500--Sobic006G230100 Sobic004G121600 Sobic004G121600 Sobic005G219500--Sobic004G121600 Sobic008G105800 Sobic008G105800 Sobic005G219500--Sobic008G105800 Sobic007G202480 Sobic007G202480 Sobic005G219500--Sobic007G202480 Sobic006G106900 Sobic006G106900 Sobic001G416100--Sobic006G106900 Sobic007G100700 Sobic007G100700 Sobic001G416100--Sobic007G100700 Sobic003G319400 Sobic003G319400 Sobic001G416100--Sobic003G319400 Sobic004G106100 Sobic004G106100 Sobic001G416100--Sobic004G106100 Sobic004G306900 Sobic004G306900 Sobic001G416100--Sobic004G306900 Sobic006G019700 Sobic006G019700 Sobic001G416100--Sobic006G019700 Sobic001G416100--Sobic003G167300 Sobic003G064800 Sobic003G064800 Sobic001G416100--Sobic003G064800 Sobic009G259800 Sobic009G259800 Sobic001G416100--Sobic009G259800 Sobic001G414800--Sobic006G106900 Sobic001G414800--Sobic001G507100 Sobic001G414800--Sobic010G191600 Sobic001G414800--Sobic007G206800 Sobic001G414800--Sobic003G064800 Sobic001G414800--Sobic005G217766 Sobic001G414800--Sobic005G097400 Sobic007G086300 Sobic007G086300 Sobic001G414800--Sobic007G086300 Sobic001G414800--Sobic008G022100 Sobic007G005100--Sobic004G187600 Sobic001G070100 Sobic001G070100 Sobic007G005100--Sobic001G070100 Sobic007G005100--Sobic004G089100 Sobic005G048400 Sobic005G048400 Sobic007G005100--Sobic005G048400 Sobic002G325500 Sobic002G325500 Sobic007G005100--Sobic002G325500 Sobic007G005100--Sobic002G028566 Sobic008G078800 Sobic008G078800 Sobic007G005100--Sobic008G078800 Sobic007G061600 Sobic007G061600 Sobic007G005100--Sobic007G061600 Sobic010G032500 Sobic010G032500 Sobic007G005100--Sobic010G032500 Sobic006G047200 Sobic006G047200 Sobic009G225800--Sobic006G047200 Sobic002G392000 Sobic002G392000 Sobic009G225800--Sobic002G392000 Sobic006G171100 Sobic006G171100 Sobic009G225800--Sobic006G171100 Sobic010G241900 Sobic010G241900 Sobic009G225800--Sobic010G241900 Sobic009G225800--Sobic009G136800 Sobic005G035900 Sobic005G035900 Sobic009G225800--Sobic005G035900 Sobic002G391300 Sobic002G391300 Sobic009G225800--Sobic002G391300 Sobic005G046400 Sobic005G046400 Sobic009G225800--Sobic005G046400 Sobic009G225800--Sobic001G499900
Octagon: transcription factors


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