Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G113201.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RMC9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G137000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
2 Sobic.003G165401 - -
3 Sobic.002G124832 - -
4 Sobic.008G140500 expressed protein -
5 Sobic.004G055901 - -
6 Sobic.002G069300 DNA binding protein, putative, expressed -
7 Sobic.002G014100 OsFBX212 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.010G192200 two-component response regulator, putative, expressed K14491: two-component response regulator ARR-B family
9 Sobic.006G142925 - -
10 Sobic.010G143666 - -
11 Sobic.003G281000 - -
12 Sobic.003G155700 transcription initiation factor IID, 18kD subunit family protein, expressed K03127: transcription initiation factor TFIID subunit 13
13 Sobic.009G062701 - -
14 Sobic.007G072700 - -
15 Sobic.002G202050 - -
16 Sobic.002G202050 - -
17 Sobic.002G202050 - -
18 Sobic.002G202050 - -
19 Sobic.006G247200 AMP-binding enzyme, putative, expressed -
20 Sobic.002G344800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G113201 Sobic004G113201 Sobic003G137000 Sobic003G137000 Sobic004G113201--Sobic003G137000 Sobic003G165401 Sobic003G165401 Sobic004G113201--Sobic003G165401 Sobic002G124832 Sobic002G124832 Sobic004G113201--Sobic002G124832 Sobic008G140500 Sobic008G140500 Sobic004G113201--Sobic008G140500 Sobic004G055901 Sobic004G055901 Sobic004G113201--Sobic004G055901 Sobic002G069300 Sobic002G069300 Sobic004G113201--Sobic002G069300 Sobic002G014100 Sobic002G014100 Sobic004G113201--Sobic002G014100 Sobic010G192200 Sobic010G192200 Sobic004G113201--Sobic010G192200 Sobic006G142925 Sobic006G142925 Sobic004G113201--Sobic006G142925 Sobic003G137000--Sobic003G165401 Sobic003G137000--Sobic002G124832 Sobic003G137000--Sobic002G069300 Sobic003G137000--Sobic002G014100 Sobic010G143666 Sobic010G143666 Sobic003G137000--Sobic010G143666 Sobic003G281000 Sobic003G281000 Sobic003G137000--Sobic003G281000 Sobic003G137000--Sobic006G142925 Sobic003G137000--Sobic008G140500 Sobic002G344800 Sobic002G344800 Sobic003G137000--Sobic002G344800 Sobic003G165401--Sobic003G137000 Sobic003G165401--Sobic008G140500 Sobic003G165401--Sobic002G069300 Sobic003G165401--Sobic002G124832 Sobic003G165401--Sobic006G142925 Sobic003G165401--Sobic002G014100 Sobic003G165401--Sobic010G143666 Sobic003G165401--Sobic010G192200 Sobic003G165401--Sobic003G281000 Sobic002G124832--Sobic003G137000 Sobic002G124832--Sobic003G165401 Sobic002G124832--Sobic002G069300 Sobic002G124832--Sobic002G014100 Sobic002G124832--Sobic006G142925 Sobic002G124832--Sobic010G143666 Sobic002G124832--Sobic003G281000 Sobic002G124832--Sobic008G140500 Sobic002G202050 Sobic002G202050 Sobic002G124832--Sobic002G202050 Sobic008G140500--Sobic003G165401 Sobic008G140500--Sobic003G137000 Sobic004G020150 Sobic004G020150 Sobic008G140500--Sobic004G020150 Sobic008G140500--Sobic006G142925 Sobic008G140500--Sobic004G055901 Sobic008G140500--Sobic002G124832 Sobic008G140500--Sobic010G192200 Sobic009G239400 Sobic009G239400 Sobic008G140500--Sobic009G239400 Sobic008G140500--Sobic002G069300 Sobic004G055901--Sobic010G192200 Sobic002G057700 Sobic002G057700 Sobic004G055901--Sobic002G057700 Sobic004G055901--Sobic008G140500 Sobic004G055901--Sobic003G165401 Sobic004G055901--Sobic003G137000 Sobic004G055901--Sobic002G124832 Sobic010G133275 Sobic010G133275 Sobic004G055901--Sobic010G133275 Sobic004G055901--Sobic002G069300 Sobic005G179900 Sobic005G179900 Sobic004G055901--Sobic005G179900 Sobic002G069300--Sobic006G142925 Sobic002G069300--Sobic010G143666 Sobic002G069300--Sobic002G014100 Sobic002G069300--Sobic003G281000 Sobic002G069300--Sobic002G202050 Sobic006G247200 Sobic006G247200 Sobic002G069300--Sobic006G247200 Sobic002G014100--Sobic002G202050 Sobic002G014100--Sobic010G143666 Sobic002G014100--Sobic006G247200 Sobic002G382200 Sobic002G382200 Sobic002G014100--Sobic002G382200 Sobic002G014100--Sobic002G344800 Sobic002G014100--Sobic003G281000 Sobic010G192200--Sobic004G055901 Sobic010G192200--Sobic002G057700 Sobic010G192200--Sobic003G165401 Sobic010G192200--Sobic008G140500 Sobic010G192200--Sobic003G137000 Sobic010G192200--Sobic010G133275 Sobic010G192200--Sobic005G179900 Sobic010G192200--Sobic002G124832 Sobic010G192200--Sobic002G344800 Sobic006G142925--Sobic002G069300 Sobic006G142925--Sobic009G239400 Sobic006G142925--Sobic010G143666 Sobic008G069100 Sobic008G069100 Sobic006G142925--Sobic008G069100 Sobic006G142925--Sobic003G281000 Sobic009G019400 Sobic009G019400 Sobic006G142925--Sobic009G019400 Sobic006G142925--Sobic003G165401 Sobic006G142925--Sobic002G014100 Sobic006G142925--Sobic002G202050
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.