Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G253300.1
Synonym BIM1
Functional annotation helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed
UniProt A0A194YRH9
Pfam PF00010
Panther DB PTHR12565 PTHR12565:SF138
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G08130 : basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g49480.1 : helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a021887
Brachypodium -
Barley HORVU6Hr1G072300.2 , HORVU6Hr1G072300.3 , HORVU6Hr1G072300.1 , HORVU6Hr1G072300.8 , HORVU6Hr1G072300.9 , HORVU6Hr1G072300.20 , HORVU6Hr1G072300.29 , HORVU6Hr1G072300.11 , HORVU6Hr1G072300.13 , HORVU6Hr1G072300.14 , HORVU6Hr1G072300.15 , HORVU6Hr1G072300.16 , HORVU6Hr1G072300.17 , HORVU6Hr1G072300.18 , HORVU6Hr1G072300.19
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic004G253300 Sobic004G253300 Sobic001G059001 Sobic001G059001 Sobic004G253300--Sobic001G059001 Sobic005G137500 Sobic005G137500 Sobic004G253300--Sobic005G137500 Sobic009G064300 Sobic009G064300 Sobic004G253300--Sobic009G064300 Sobic002G012100 Sobic002G012100 Sobic004G253300--Sobic002G012100 Sobic003G312600 Sobic003G312600 Sobic004G253300--Sobic003G312600 Sobic006G172100 Sobic006G172100 Sobic004G253300--Sobic006G172100 Sobic003G338600 Sobic003G338600 Sobic004G253300--Sobic003G338600 Sobic002G181500 Sobic002G181500 Sobic004G253300--Sobic002G181500 Sobic004G206600 Sobic004G206600 Sobic004G253300--Sobic004G206600 Sobic001G059001--Sobic009G064300 Sobic001G059001--Sobic005G137500 Sobic001G190900 Sobic001G190900 Sobic001G059001--Sobic001G190900 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic001G059001--Sobic003G312900 Sobic003G312800 Sobic003G312800 Sobic001G059001--Sobic003G312800 Sobic005G152866 Sobic005G152866 Sobic001G059001--Sobic005G152866 Sobic008G072800 Sobic008G072800 Sobic001G059001--Sobic008G072800 Sobic001G059001--Sobic002G012100 Sobic010G183350 Sobic010G183350 Sobic001G059001--Sobic010G183350 Sobic005G137500--Sobic010G183350 Sobic005G137500--Sobic001G059001 Sobic004G193350 Sobic004G193350 Sobic005G137500--Sobic004G193350 Sobic005G137500--Sobic009G064300 Sobic005G137500--Sobic002G012100 Sobic001G476600 Sobic001G476600 Sobic005G137500--Sobic001G476600 Sobic005G137500--Sobic005G152866 Sobic006G268900 Sobic006G268900 Sobic005G137500--Sobic006G268900 Sobic005G137500--Sobic003G312800 Sobic009G064300--Sobic001G059001 Sobic009G064300--Sobic002G012100 Sobic007G078700 Sobic007G078700 Sobic009G064300--Sobic007G078700 Sobic007G141900 Sobic007G141900 Sobic009G064300--Sobic007G141900 Sobic003G023450 Sobic003G023450 Sobic009G064300--Sobic003G023450 Sobic009G064300--Sobic003G338600 Sobic009G064300--Sobic008G072800 Sobic009G064300--Sobic005G137500 Sobic009G064300--Sobic003G312900 Sobic002G012100--Sobic007G141900 Sobic001G167000 Sobic001G167000 Sobic002G012100--Sobic001G167000 Sobic002G012100--Sobic008G072800 Sobic002G012100--Sobic004G206600 Sobic008G067000 Sobic008G067000 Sobic002G012100--Sobic008G067000 Sobic004G242800 Sobic004G242800 Sobic002G012100--Sobic004G242800 Sobic010G196466 Sobic010G196466 Sobic002G012100--Sobic010G196466 Sobic002G012100--Sobic009G064300 Sobic002G012100--Sobic003G023450 Sobic003G312600--Sobic003G312800 Sobic002G398300 Sobic002G398300 Sobic003G312600--Sobic002G398300 Sobic003G312600--Sobic001G190900 Sobic001G239000 Sobic001G239000 Sobic003G312600--Sobic001G239000 Sobic003G312600--Sobic003G312900 Sobic003G312600--Sobic001G476600 Sobic007G133733 Sobic007G133733 Sobic003G312600--Sobic007G133733 Sobic004G209100 Sobic004G209100 Sobic003G312600--Sobic004G209100 Sobic005G027350 Sobic005G027350 Sobic003G312600--Sobic005G027350 Sobic002G256400 Sobic002G256400 Sobic006G172100--Sobic002G256400 Sobic006G172100--Sobic001G059001 Sobic006G172100--Sobic005G137500 Sobic001G190700 Sobic001G190700 Sobic006G172100--Sobic001G190700 Sobic006G172100--Sobic004G193350 Sobic002G216300 Sobic002G216300 Sobic006G172100--Sobic002G216300 Sobic003G375400 Sobic003G375400 Sobic006G172100--Sobic003G375400 Sobic009G153366 Sobic009G153366 Sobic006G172100--Sobic009G153366 Sobic006G172100--Sobic010G183350 Sobic003G338600--Sobic009G064300 Sobic003G338600--Sobic002G181500 Sobic003G338600--Sobic003G023450 Sobic003G338600--Sobic005G152866 Sobic003G338600--Sobic002G012100 Sobic002G281850 Sobic002G281850 Sobic003G338600--Sobic002G281850 Sobic003G338600--Sobic001G059001 Sobic003G338600--Sobic007G078700 Sobic003G030450 Sobic003G030450 Sobic003G338600--Sobic003G030450 Sobic008G046700 Sobic008G046700 Sobic002G181500--Sobic008G046700 Sobic002G181500--Sobic003G338600 Sobic001G261452 Sobic001G261452 Sobic002G181500--Sobic001G261452 Sobic002G181500--Sobic002G281850 Sobic003G263900 Sobic003G263900 Sobic002G181500--Sobic003G263900 Sobic002G181500--Sobic003G312800 Sobic010G100700 Sobic010G100700 Sobic002G181500--Sobic010G100700 Sobic002G181500--Sobic004G209100 Sobic005G118800 Sobic005G118800 Sobic002G181500--Sobic005G118800 Sobic004G206600--Sobic010G196466 Sobic003G267200 Sobic003G267200 Sobic004G206600--Sobic003G267200 Sobic004G206600--Sobic002G012100 Sobic004G206600--Sobic004G242800 Sobic004G206600--Sobic001G167000 Sobic004G206600--Sobic007G141900 Sobic002G324801 Sobic002G324801 Sobic004G206600--Sobic002G324801 Sobic009G087540 Sobic009G087540 Sobic004G206600--Sobic009G087540 Sobic009G236900 Sobic009G236900 Sobic004G206600--Sobic009G236900
Octagon: transcription factors


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