Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G343400.1
Synonym Sb04g037060
Functional annotation diphthamide biosynthesis protein, putative, expressed
UniProt A0A097PMC2 , C5XVV0
Pfam PF01866
Panther DB PTHR10762 PTHR10762:SF1
NCBI CDD KOG2648; Diphthamide biosynthesis protein
KEGG Orthology K07561; DPH1, 2-(3-amino-3-carboxypropyl)histidine synthase
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G62030 : diphthamide synthesis DPH2 family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g57050.1 : diphthamide biosynthesis protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a022591
Brachypodium PNT69426 , PNT69427
Barley HORVU6Hr1G090270.8 , HORVU6Hr1G090270.6 , HORVU6Hr1G090270.7 , HORVU6Hr1G090270.4 , HORVU6Hr1G090270.5 , HORVU6Hr1G090270.2 , HORVU6Hr1G090270.3 , HORVU6Hr1G090270.1
Wheat TraesCS6D02G371300 , TraesCS6A02G386700 , TraesCS6B02G425800
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G343400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic004G343400 Sobic004G343400 Sobic003G118266 Sobic003G118266 Sobic004G343400--Sobic003G118266 Sobic001G291400 Sobic001G291400 Sobic004G343400--Sobic001G291400 Sobic008G067500 Sobic008G067500 Sobic004G343400--Sobic008G067500 Sobic001G229200 Sobic001G229200 Sobic004G343400--Sobic001G229200 Sobic009G082800 Sobic009G082800 Sobic004G343400--Sobic009G082800 Sobic007G045000 Sobic007G045000 Sobic004G343400--Sobic007G045000 Sobic001G030500 Sobic001G030500 Sobic004G343400--Sobic001G030500 Sobic003G368200 Sobic003G368200 Sobic004G343400--Sobic003G368200 Sobic009G023401 Sobic009G023401 Sobic004G343400--Sobic009G023401 Sobic003G118266--Sobic009G082800 Sobic006G227600 Sobic006G227600 Sobic003G118266--Sobic006G227600 Sobic004G078600 Sobic004G078600 Sobic003G118266--Sobic004G078600 Sobic009G085700 Sobic009G085700 Sobic003G118266--Sobic009G085700 Sobic002G041800 Sobic002G041800 Sobic003G118266--Sobic002G041800 Sobic005G191500 Sobic005G191500 Sobic003G118266--Sobic005G191500 Sobic001G198700 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Octagon: transcription factors


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