Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G045000.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PFK2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) ChrSy.fgenesh.mRNA.47 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G106550 - -
2 Sobic.009G082800 - -
3 Sobic.004G088600 expressed protein -
4 Sobic.005G019350 - -
5 Sobic.006G148400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@OsWAK51 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
6 Sobic.010G069300 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450 72A1, putative, expressed K15639: CYP734A1, PHYB activation tagged suppressor 1
7 Sobic.002G307700 expressed protein -
8 Sobic.001G251650 - -
9 Sobic.004G303500 DNA-directed RNA polymerase subunit beta, putative, expressed -
10 Sobic.008G038100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
11 Sobic.004G343400 diphthamide biosynthesis protein, putative, expressed K07561: DPH1, 2-(3-amino-3-carboxypropyl)histidine synthase
12 Sobic.003G125500 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@TKL_IRAK_CR4L.2 - The CR4L subfamily has homology with Crinkly4, expressed -
13 Sobic.001G280300 receptor-like protein kinase, putative, expressed -
14 Sobic.001G330925 - -
15 Sobic.001G376332 - -
16 Sobic.007G165701 - -
17 Sobic.006G227600 leucoanthocyanidin reductase, putative, expressed K08695: anthocyanidin reductase
18 Sobic.003G118266 - -
19 Sobic.001G074800 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
20 Sobic.001G299400 metalloendoproteinase 1 precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G045000 Sobic007G045000 Sobic001G106550 Sobic001G106550 Sobic007G045000--Sobic001G106550 Sobic009G082800 Sobic009G082800 Sobic007G045000--Sobic009G082800 Sobic004G088600 Sobic004G088600 Sobic007G045000--Sobic004G088600 Sobic005G019350 Sobic005G019350 Sobic007G045000--Sobic005G019350 Sobic006G148400 Sobic006G148400 Sobic007G045000--Sobic006G148400 Sobic010G069300 Sobic010G069300 Sobic007G045000--Sobic010G069300 Sobic002G307700 Sobic002G307700 Sobic007G045000--Sobic002G307700 Sobic001G251650 Sobic001G251650 Sobic007G045000--Sobic001G251650 Sobic004G303500 Sobic004G303500 Sobic007G045000--Sobic004G303500 Sobic005G049100 Sobic005G049100 Sobic001G106550--Sobic005G049100 Sobic007G050750 Sobic007G050750 Sobic001G106550--Sobic007G050750 Sobic001G112550 Sobic001G112550 Sobic001G106550--Sobic001G112550 Sobic004G358800 Sobic004G358800 Sobic001G106550--Sobic004G358800 Sobic006G113301 Sobic006G113301 Sobic001G106550--Sobic006G113301 Sobic007G050650 Sobic007G050650 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Octagon: transcription factors


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