Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G148400.2,Sobic.006G148400.1
Synonym WAK5, Sb06g022700
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
OsWAK51 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed
UniProt C5YCD2
Pfam PF07645 PF13947 PF00069
Panther DB PTHR27005 PTHR27005:SF48
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005509; calcium ion binding GO:0006468protein phosphorylation GO:0005524ATP binding GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G21230 : wall associated kinase 5
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g43730.1 : OsWAK51 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a007833 , Zm00025a010720 , Zm00025a010659 , Zm00025a010657 , Zm00025a010660
Brachypodium PNT61490 , PNT61491 , KQJ83614 , KQJ83615 , PNT61487 , PNT61486 , PNT61489 , PNT61488
Barley -
Wheat TraesCS2A02G381400 , TraesCS3A02G533100 , TraesCS2D02G377900 , TraesCS2D02G378000 , TraesCS2A02G381500 , TraesCS2B02G489700 , TraesCS5D02G365500
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G145000 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed K09286: EREBP-like factor
2 Sobic.003G233332 - -
3 Sobic.005G024500 expressed protein -
4 Sobic.008G138850 - -
5 Sobic.003G172000 - -
6 Sobic.002G075400 receptor kinase, putative, expressed -
7 Sobic.002G073000 - -
8 Sobic.006G094900 DUF567 domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.002G094000 expressed protein -
10 Sobic.002G321200 vrga1, putative, expressed -
11 Sobic.005G019300 receptor kinase, putative, expressed -
12 Sobic.001G449300 LYK, putative, expressed -
13 Sobic.002G121050 - -
14 Sobic.006G232100 expressed protein -
15 Sobic.002G094100 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.010G061400 expressed protein -
17 Sobic.009G078401 - -
18 Sobic.001G443400 conserved hypothetical protein -
19 Sobic.003G263450 - -
20 Sobic.002G075300 receptor kinase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G148400 Sobic006G148400 Sobic008G145000 Sobic008G145000 Sobic006G148400--Sobic008G145000 Sobic003G233332 Sobic003G233332 Sobic006G148400--Sobic003G233332 Sobic005G024500 Sobic005G024500 Sobic006G148400--Sobic005G024500 Sobic008G138850 Sobic008G138850 Sobic006G148400--Sobic008G138850 Sobic003G172000 Sobic003G172000 Sobic006G148400--Sobic003G172000 Sobic002G075400 Sobic002G075400 Sobic006G148400--Sobic002G075400 Sobic002G073000 Sobic002G073000 Sobic006G148400--Sobic002G073000 Sobic006G094900 Sobic006G094900 Sobic006G148400--Sobic006G094900 Sobic002G094000 Sobic002G094000 Sobic006G148400--Sobic002G094000 Sobic004G127350 Sobic004G127350 Sobic008G145000--Sobic004G127350 Sobic001G449300 Sobic001G449300 Sobic008G145000--Sobic001G449300 Sobic008G145000--Sobic003G172000 Sobic002G074700 Sobic002G074700 Sobic008G145000--Sobic002G074700 Sobic008G145000--Sobic003G233332 Sobic005G194400 Sobic005G194400 Sobic008G145000--Sobic005G194400 Sobic002G121050 Sobic002G121050 Sobic008G145000--Sobic002G121050 Sobic002G118000 Sobic002G118000 Sobic008G145000--Sobic002G118000 Sobic007G103200 Sobic007G103200 Sobic008G145000--Sobic007G103200 Sobic001G325100 Sobic001G325100 Sobic003G233332--Sobic001G325100 Sobic003G068200 Sobic003G068200 Sobic003G233332--Sobic003G068200 Sobic003G254850 Sobic003G254850 Sobic003G233332--Sobic003G254850 Sobic005G019300 Sobic005G019300 Sobic003G233332--Sobic005G019300 Sobic002G316400 Sobic002G316400 Sobic003G233332--Sobic002G316400 Sobic001G279800 Sobic001G279800 Sobic003G233332--Sobic001G279800 Sobic003G233332--Sobic005G024500 Sobic008G053500 Sobic008G053500 Sobic003G233332--Sobic008G053500 Sobic003G233332--Sobic008G138850 Sobic005G024500--Sobic002G094000 Sobic005G024500--Sobic005G019300 Sobic005G024500--Sobic003G172000 Sobic005G024500--Sobic002G073000 Sobic005G024500--Sobic002G121050 Sobic005G024500--Sobic006G094900 Sobic004G334501 Sobic004G334501 Sobic005G024500--Sobic004G334501 Sobic002G094100 Sobic002G094100 Sobic005G024500--Sobic002G094100 Sobic009G097500 Sobic009G097500 Sobic005G024500--Sobic009G097500 Sobic009G078401 Sobic009G078401 Sobic008G138850--Sobic009G078401 Sobic009G078300 Sobic009G078300 Sobic008G138850--Sobic009G078300 Sobic009G255400 Sobic009G255400 Sobic008G138850--Sobic009G255400 Sobic008G138850--Sobic005G024500 Sobic008G138850--Sobic001G325100 Sobic004G278800 Sobic004G278800 Sobic008G138850--Sobic004G278800 Sobic008G138850--Sobic005G019300 Sobic008G138850--Sobic002G075400 Sobic003G441301 Sobic003G441301 Sobic008G138850--Sobic003G441301 Sobic003G172000--Sobic002G121050 Sobic002G149600 Sobic002G149600 Sobic003G172000--Sobic002G149600 Sobic004G272950 Sobic004G272950 Sobic003G172000--Sobic004G272950 Sobic003G172000--Sobic002G074700 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic003G172000--Sobic009G094100 Sobic003G172000--Sobic005G024500 Sobic002G152100 Sobic002G152100 Sobic003G172000--Sobic002G152100 Sobic003G172000--Sobic006G094900 Sobic003G263450 Sobic003G263450 Sobic003G172000--Sobic003G263450 Sobic002G075400--Sobic009G078401 Sobic002G075400--Sobic008G138850 Sobic002G075400--Sobic001G325100 Sobic002G075400--Sobic009G078300 Sobic002G325000 Sobic002G325000 Sobic002G075400--Sobic002G325000 Sobic010G045966 Sobic010G045966 Sobic002G075400--Sobic010G045966 Sobic002G075400--Sobic009G255400 Sobic003G244850 Sobic003G244850 Sobic002G075400--Sobic003G244850 Sobic002G075400--Sobic004G278800 Sobic002G073000--Sobic002G094000 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic002G073000--Sobic010G166201 Sobic002G073000--Sobic005G024500 Sobic010G098800 Sobic010G098800 Sobic002G073000--Sobic010G098800 Sobic003G173200 Sobic003G173200 Sobic002G073000--Sobic003G173200 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic002G073000--Sobic004G223700 Sobic002G073000--Sobic002G094100 Sobic002G073000--Sobic004G334501 Sobic002G073000--Sobic002G121050 Sobic006G094900--Sobic002G121050 Sobic006G094900--Sobic003G172000 Sobic006G094900--Sobic002G094000 Sobic006G094900--Sobic002G149600 Sobic009G213150 Sobic009G213150 Sobic006G094900--Sobic009G213150 Sobic006G094900--Sobic005G024500 Sobic007G179266 Sobic007G179266 Sobic006G094900--Sobic007G179266 Sobic001G154450 Sobic001G154450 Sobic006G094900--Sobic001G154450 Sobic006G094900--Sobic009G094100 Sobic002G094000--Sobic005G024500 Sobic002G094000--Sobic005G019300 Sobic002G094000--Sobic002G073000 Sobic002G094000--Sobic002G094100 Sobic003G142500 Sobic003G142500 Sobic002G094000--Sobic003G142500 Sobic002G094000--Sobic006G094900 Sobic002G094000--Sobic009G213150 Sobic002G094000--Sobic004G278800 Sobic002G094000--Sobic004G334501
Octagon: transcription factors


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