Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G035950.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RGL5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g32790.1 : ankyrin repeat domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G042100 expressed protein -
2 Sobic.004G259800 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed K00621: GNPNAT1, glucosamine-phosphate N-acetyltransferase
3 Sobic.007G182700 POLD4B - Putative DNA polymerase delta complex subunit, expressed K03505: DNA polymerase delta subunit 4
4 Sobic.001G060600 cell division control protein 2 homolog 3, putative, expressed K08818: cell division cycle 2-like
5 Sobic.003G077800 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@suppressor of G2 allele of SKP1, putative, expressed K12795: SUGT1, suppressor of G2 allele of SKP1
6 Sobic.003G185800 - -
7 Sobic.010G234100 - -
8 Sobic.006G250350 - -
9 Sobic.005G197900 expressed protein -
10 Sobic.001G512100 Magnesium transporter 6("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@CorA-like magnesium transporter protein, putative, expressed K16075: MRS2, magnesium transporter
11 Sobic.006G242701 - -
12 Sobic.008G174850 - -
13 Sobic.008G174200 NBS-LRR type disease resistance protein, putative, expressed -
14 Sobic.006G113301 - -
15 Sobic.001G156700 - -
16 Sobic.009G078401 - -
17 Sobic.001G339000 terpene synthase, N-terminal domain containing protein, expressed -
18 Sobic.005G049100 CAF1 family ribonuclease containing protein, putative, expressed K12581: CNOT7_8, CAF1, CCR4-NOT transcription complex subunit 7/8
19 Sobic.009G158200 - -
20 Sobic.001G324300 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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