Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G078500.1
Synonym
Functional annotation LTPL32 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed
UniProt A0A1Z5RIF3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g14880.1 : LTPL32 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G309200 alpha-amylase precursor, putative, expressed K01176: AMY, amyA, alpha-amylase
2 Sobic.006G194900 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
3 Sobic.006G189500 OsMADS17 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed K09264: MADS-box transcription factor, plant
4 Sobic.004G029500 - -
5 Sobic.002G095000 DEFL72 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
6 Sobic.010G191400 - -
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8 Sobic.010G129300 aspartic proteinase nepenthesin-2 precursor, putative, expressed -
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12 Sobic.005G027200 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
13 Sobic.006G006000 expressed protein -
14 Sobic.005G130900 expressed protein -
15 Sobic.006G006100 expressed protein -
16 Sobic.005G080800 - -
17 Sobic.005G064400 eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -
18 Sobic.004G316400 - -
19 Sobic.007G041000 expressed protein -
20 Sobic.004G315900 DEFL74 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G078500 Sobic005G078500 Sobic004G309200 Sobic004G309200 Sobic005G078500--Sobic004G309200 Sobic006G194900 Sobic006G194900 Sobic005G078500--Sobic006G194900 Sobic006G189500 Sobic006G189500 Sobic005G078500--Sobic006G189500 Sobic004G029500 Sobic004G029500 Sobic005G078500--Sobic004G029500 Sobic002G095000 Sobic002G095000 Sobic005G078500--Sobic002G095000 Sobic010G191400 Sobic010G191400 Sobic005G078500--Sobic010G191400 Sobic002G058100 Sobic002G058100 Sobic005G078500--Sobic002G058100 Sobic010G129300 Sobic010G129300 Sobic005G078500--Sobic010G129300 Sobic005G081800 Sobic005G081800 Sobic005G078500--Sobic005G081800 Sobic004G309200--Sobic006G194900 Sobic004G316400 Sobic004G316400 Sobic004G309200--Sobic004G316400 Sobic005G064400 Sobic005G064400 Sobic004G309200--Sobic005G064400 Sobic006G007001 Sobic006G007001 Sobic004G309200--Sobic006G007001 Sobic004G309200--Sobic010G129300 Sobic004G309200--Sobic005G081800 Sobic002G352401 Sobic002G352401 Sobic004G309200--Sobic002G352401 Sobic002G352501 Sobic002G352501 Sobic004G309200--Sobic002G352501 Sobic004G309200--Sobic002G095000 Sobic006G194900--Sobic004G316400 Sobic006G194900--Sobic005G064400 Sobic006G194900--Sobic002G352501 Sobic006G194900--Sobic010G129300 Sobic006G194900--Sobic006G007001 Sobic008G188300 Sobic008G188300 Sobic006G194900--Sobic008G188300 Sobic006G194900--Sobic004G309200 Sobic006G194900--Sobic002G352401 Sobic006G194900--Sobic005G081800 Sobic004G195400 Sobic004G195400 Sobic006G189500--Sobic004G195400 Sobic004G014700 Sobic004G014700 Sobic006G189500--Sobic004G014700 Sobic008G048600 Sobic008G048600 Sobic006G189500--Sobic008G048600 Sobic006G131100 Sobic006G131100 Sobic006G189500--Sobic006G131100 Sobic002G076600 Sobic002G076600 Sobic006G189500--Sobic002G076600 Sobic003G411100 Sobic003G411100 Sobic006G189500--Sobic003G411100 Sobic008G123350 Sobic008G123350 Sobic006G189500--Sobic008G123350 Sobic006G006100 Sobic006G006100 Sobic006G189500--Sobic006G006100 Sobic006G189500--Sobic005G064400 Sobic004G029500--Sobic002G095000 Sobic004G029500--Sobic002G058100 Sobic004G029500--Sobic010G191400 Sobic004G029500--Sobic010G129300 Sobic004G029500--Sobic005G081800 Sobic005G027200 Sobic005G027200 Sobic004G029500--Sobic005G027200 Sobic006G006000 Sobic006G006000 Sobic004G029500--Sobic006G006000 Sobic001G349600 Sobic001G349600 Sobic004G029500--Sobic001G349600 Sobic004G029500--Sobic006G007001 Sobic002G095000--Sobic004G029500 Sobic002G095000--Sobic002G058100 Sobic002G095000--Sobic005G081800 Sobic002G095000--Sobic010G191400 Sobic002G095000--Sobic005G027200 Sobic002G095000--Sobic010G129300 Sobic002G095000--Sobic006G006000 Sobic002G095000--Sobic001G349600 Sobic002G095000--Sobic006G007001 Sobic010G191400--Sobic002G058100 Sobic010G191400--Sobic001G349600 Sobic010G191400--Sobic004G029500 Sobic010G191400--Sobic005G027200 Sobic010G191400--Sobic002G095000 Sobic005G130900 Sobic005G130900 Sobic010G191400--Sobic005G130900 Sobic010G191400--Sobic006G006000 Sobic005G080800 Sobic005G080800 Sobic010G191400--Sobic005G080800 Sobic010G191400--Sobic005G081800 Sobic002G058100--Sobic010G191400 Sobic002G058100--Sobic004G029500 Sobic002G058100--Sobic002G095000 Sobic002G058100--Sobic005G027200 Sobic002G058100--Sobic001G349600 Sobic002G058100--Sobic006G006000 Sobic002G058100--Sobic005G081800 Sobic002G058100--Sobic010G129300 Sobic002G058100--Sobic005G130900 Sobic010G129300--Sobic005G081800 Sobic010G129300--Sobic006G007001 Sobic010G129300--Sobic004G029500 Sobic010G129300--Sobic002G095000 Sobic010G129300--Sobic002G058100 Sobic010G129300--Sobic010G191400 Sobic010G129300--Sobic006G006100 Sobic010G129300--Sobic005G064400 Sobic010G129300--Sobic006G006000 Sobic005G081800--Sobic002G095000 Sobic005G081800--Sobic010G129300 Sobic005G081800--Sobic004G029500 Sobic005G081800--Sobic006G007001 Sobic005G081800--Sobic002G058100 Sobic005G081800--Sobic005G027200 Sobic005G081800--Sobic010G191400 Sobic005G081800--Sobic006G006100 Sobic005G081800--Sobic006G006000
Octagon: transcription factors


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